SAXSdb — 4q4a

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ABC transporter

Thermotoga maritima

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein TM_0288 × 1 （Q9WYC4） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9WYC3_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 12–587； UniProt 2–577

Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein TM_0288

Thermotoga maritima

UniProt Q9WYC4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ABC transporter × 1 （Q9WYC3） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Y288_THEMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4q4a
沉积日期 deposition_date	2014-04-14
结构标题 title	Improved model of AMP-PNP bound TM287/288
关键词 keywords	ABC exporter, Multidrug transport, ABC Transporter, Membrane Transporter, HYDROLASE-TRANSPORT PROTEIN complex; HYDROLASE/TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4q4a__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4q4a__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4q4a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.60 Å
Rg（电子密度）	37.90 Å
总 Rg	38.31 Å
原子数	9166
残基数	1156
排除体积	166130 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4q4a__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ABC transporter
分子量 formula_weight	65060.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	9166

GPSGSGGGGGSKTLARYLKPYWIFAVLAPLFMVVEVICDLSQPTLLARIVDEGIARGDFSLVLKTGILMLIVALIGAVGGIGCTVFASYASQNFGADLRRDLFRKVLSFSISNVNRFHTSSLITRLTNDVTQLQNLVMMLLRIVVRAPLLFVGGIVMAVSINVKLSSVLIFLIPPIVLLFVWLTKKGNPLFRKIQESTDEVNRVVRENLLGVRVVRAFRREEYENENFRKANESLRRSIISAFSLIVFALPLFIFIVNMGMIAVLWFGGVLVRNNQMEIGSIMAYTNYLMQIMFSLMMIGNILNFIVRASASAKRVLEVLNEKPAIEEADNALALPNVEGSVSFENVEFRYFENTDPVLSGVNFSVKPGSLVAVLGETGSGKSTLMNLIPRLIDPERGRVEVDELDVRTVKLKDLRGHISAVPQETVLFSGTIKENLKWGREDATDDEIVEAAKIAQIHDFIISLPEGYDSRVERGGRNFSGGQKQRLSIARALVKKPKVLILDDCTSSVDPITEKRILDGLKRYTKGCTTFIITQKIPTALLADKILVLHEGKVAGFGTHKELLEHCKPYREIYESQFGNGVMNDA

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein TM_0288
分子量 formula_weight	67789.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MPEIRRRPHGPILEKPALKNPTATLRRLLGYLRPHTFTLIMVFVFVTVSSILGVLSPYLIGKTIDVVFVPRRFDLLPRYMLILGTIYALTSLLFWLQGKIMLTLSQDVVFRLRKELFEKLQRVPVGFFDRTPHGDIISRVINDVDNINNVLGNSIIQFFSGIVTLAGAVIMMFRVNVILSLVTLSIVPLTVLITQIVSSQTRKYFYENQRVLGQLNGIIEEDISGLTVIKLFTREEKEMEKFDRVNESLRKVGTKAQIFSGVLPPLMNMVNNLGFALISGFGGWLALKDIITVGTIATFIGYSRQFTRPLNELSNQFNMIQMALASAERIFEILDLEEEKDDPDAVELREVRGEIEFKNVWFSYDKKKPVLKDITFHIKPGQKVALVGPTGSGKTTIVNLLMRFYDVDRGQILVDGIDIRKIKRSSLRSSIGIVLQDTILFSTTVKENLKYGNPGATDEEIKEAAKLTHSDHFIKHLPEGYETVLTDNGEDLSQGQRQLLAITRAFLANPKILILDEATSNVDTKTEKSIQAAMWKLMEGKTSIIIAHRLNTIKNADLIIVLRDGEIVEMGKHDELIQKRGFYYELFTSQYGLVVEKE

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4q4ab1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.37 — ABC transporter transmembrane region
超家族 Superfamily superfamily	f.37.1 — ABC transporter transmembrane region
家族 Family family	f.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4q4ab2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4q4aA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1560 — ABC transporter transmembrane region fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ABC transporter type 1, transmembrane domain

结构域编号 domain_id	4q4aA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4q4aB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1560 — ABC transporter transmembrane region fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ABC transporter type 1, transmembrane domain

结构域编号 domain_id	4q4aB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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晶胞边长 a length_a	216.330 Å
晶胞边长 b length_b	84.310 Å
晶胞边长 c length_c	115.780 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.92 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	24.927 Å
R 因子 r_factor	0.2278
R_work r_work	0.2257
R_free r_free	0.2678

Improved model of AMP-PNP bound TM287/288

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ABC transporter

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein TM_0288

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4q4a__assembly_1__model_1

4q4a__assembly_1__model_1 | I(q)

4q4a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Improved model of AMP-PNP bound TM287/288

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ABC transporter

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein TM_0288

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4q4a__assembly_1__model_1

4q4a__assembly_1__model_1 | I(q)

4q4a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)