SAXSdb — 4qcc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 24	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DGOA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 B； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

Escherichia coli

UniProt U6NBA4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 24	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	U6NBA4_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 212–283； UniProt 45–116 作者链 B； PDB构建体 212–283； UniProt 45–116

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4qcc
沉积日期 deposition_date	2014-05-10
结构标题 title	Structure of a cube-shaped, highly porous protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains
关键词 keywords	protein design, bionanotechnology, self-assembly, symmetry, porous biomaterials, STRUCTURAL PROTEIN, LYASE; STRUCTURAL PROTEIN, LYASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4qcc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4qcc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4qcc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	89.02 Å
Rg（电子密度）	87.92 Å
总 Rg	88.12 Å
原子数	47448
残基数	6480
排除体积	846720 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4qcc__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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晶胞边长 a length_a	272.680 Å
晶胞边长 b length_b	272.680 Å
晶胞边长 c length_c	272.680 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	96

空间群 space_group	F 2 3
空间群编号 int_tables_number	196
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	7.078 Å
最低分辨率 resolution_low	96.407 Å
R 因子 r_factor	0.2843
R_work r_work	0.2826
R_free r_free	0.3165

描述 description	2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera
分子量 formula_weight	31233.5 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.2.21
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3954

Structure of a cube-shaped, highly porous protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4qcc__assembly_1__model_1

4qcc__assembly_1__model_1 | I(q)

4qcc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Structure of a cube-shaped, highly porous protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4qcc__assembly_1__model_1

4qcc__assembly_1__model_1 | I(q)

4qcc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)