SAXSdb — 4r71

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 3	RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EFTS_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 C； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

Escherichia coli

UniProt P0CE48

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 3	RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EFTU2_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 285–678； UniProt 1–394 作者链 C； PDB构建体 285–678； UniProt 1–394

RNA-directed RNA polymerase beta chain

Enterobacteria phage Qbeta

UniProt P14647

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Elongation factor Ts, Elongation factor Tu × 1 （P0A6P1,P0CE48） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Elongation factor Ts, Elongation factor Tu × 1 （P0A6P1,P0CE48） 30S ribosomal protein S1 × 1 （P0AG67）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RDRP_BPQBE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 7–595； UniProt 1–589 作者链 D； PDB构建体 7–595； UniProt 1–589

30S ribosomal protein S1

Escherichia coli

UniProt P0AG67

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Elongation factor Ts, Elongation factor Tu × 1 （P0A6P1,P0CE48） RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647）	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Elongation factor Ts, Elongation factor Tu × 1 （P0A6P1,P0CE48） RNA-directed RNA polymerase beta chain × 1 （P14647）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 2–171； UniProt 2–171 作者链 F； PDB构建体 2–171； UniProt 2–171

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4r71
沉积日期 deposition_date	2014-08-26
结构标题 title	Structure of the Qbeta holoenzyme complex in the P1211 crystal form
关键词 keywords	OB FOLD, TRANSLATION, VIRAL PROTEIN-RIBOSOMAL PROTEIN complex; VIRAL PROTEIN/RIBOSOMAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4r71__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4r71__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4r71__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.05 Å
Rg（电子密度）	38.58 Å
总 Rg	39.06 Å
原子数	10550
残基数	1362
排除体积	188190 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4r71__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4r71__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Elongation factor Ts, Elongation factor Tu
分子量 formula_weight	75392.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	21108

MAEITASLVKELRERTGAGMMDCKKALTEANGDIELAIENMRKSGAIKAAKKAGNVAADGVIKTKIDGNYGIILEVNCQTDFVAKDAGFQAFADKVLDAAVAGKITDVEVLKAQFEEERVALVAKIGENINIRRVAALEGDVLGSYQHGARIGVLVAAKGADEELVKHIAMHVAASKPEFIKPEDVSAEVVEKEYQVQLDIAMQSGKPKEIAEKMVEGRMKKFTGEVSLTGQPFVMEPSKTVGQLLKEHNAEVTGFIRFEVGEGIEKVETDFAAEVAAMSKQSHMSKEKFERTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITTVLAKTYGGAARAFDQIDNAPEEKARGITINTSHVEYDTPTRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGAILVVAATDGPMPQTREHILLGRQVGVPYIIVFLNKCDMVDDEELLELVEMEVRELLSQYDFPGDDTPIVRGSALKALEGDAEWEAKILELAGFLDSYIPEPERAIDKPFLLPIEDVFSISGRGTVVTGRVERGIIKVGEEVEIVGIKETQKSTCTGVEMFRKLLDEGRAGENVGVLLRGIKREEIERGQVLAKPGTIKPHTKFESEVYILSKDEGGRHTPFFKGYRPQFYFRTTDVTGTIELPEGVEMVMPGDNIKMVVTLIHPIAMDDGLRFAIREGGRTVGAGVVAKVLSGASGAAGGGGENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RNA-directed RNA polymerase beta chain
分子量 formula_weight	65997.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

SGGGGSMSKTASSRNSLSAQLRRAANTRIEVEGNLALSIANDLLLAYGQSPFNSEAECISFSPRFDGTPDDFRINYLKAEIMSKYDDFSLGIDTEAVAWEKFLAAEAECALTNARLYRPDYSEDFNFSLGESCIHMARRKIAKLIGDVPSVEGMLRHCRFSGGATTTNNRSYGHPSFKFALPQACTPRALKYVLALRASTHFDTRISDISPFNKAVTVPKNSKTDRCIAIEPGWNMFFQLGIGGILRDRLRCWGIDLNDQTINQRRAHEGSVTNNLATVDLSAASDSISLALCELLLPPGWFEVLMDLRSPKGRLPDGSVVTYEKISSMGNGYTFELESLIFASLARSVCEILDLDSSEVTVYGDDIILPSCAVPALREVFKYVGFTTNTKKTFSEGPFRESCGKHYYSGVDVTPFYIRHRIVSPADLILVLNNLYRWATIDGVWDPRAHSVYLKYRKLLPKQLQRNTIPDGYGDGALVGSVLINPFAKNRGWIRYVPVITDHTRDRERAELGSYLYDLFSRCLSESNDGLPLRGPSGCDSADLFAIDQLICRSNPTKISRSTGKFDIQYIACSSRVLAPYGVFQGTKVASLHEA

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage Qbeta
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	39803
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S1
分子量 formula_weight	18797.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

GTESFAQLFEESLKEIETRPGSIVRGVVVAIDKDVVLVDAGLKSESAIPAEQFKNAQGELEIQVGDEVDVALDAVEDGFGETLLSREKAKRHEAWITLEKAYEDAETVTGVINGKVKGGFTVELNGIRAFLPGSLVDVRPVRDTLHLEGKELEFKVIKLDQKRNNVVVSRR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4r71A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

结构域编号 domain_id	4r71A03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4r71A04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	4r71A05
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	4r71C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

结构域编号 domain_id	4r71C03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4r71C04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	4r71C05
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

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晶胞边长 a length_a	99.730 Å
晶胞边长 b length_b	115.450 Å
晶胞边长 c length_c	178.520 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.14 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.210 Å
最低分辨率 resolution_low	59.827 Å
R 因子 r_factor	0.2158
R_work r_work	0.2131
R_free r_free	0.2676

Structure of the Qbeta holoenzyme complex in the P1211 crystal form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RNA-directed RNA polymerase beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

30S ribosomal protein S1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4r71__assembly_2__model_1

4r71__assembly_2__model_1 | I(q)

4r71__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the Qbeta holoenzyme complex in the P1211 crystal form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Elongation factor Ts, Elongation factor Tu

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA-directed RNA polymerase beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4r71__assembly_2__model_1

4r71__assembly_2__model_1 | I(q)

4r71__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)