Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*GP*GP*CP*CP*CP*AP*TP*TP*CP*AP*AP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*TP*TP*GP*AP*AP*TP*GP*GP*GP*CP*C)-3' × 1 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*GP*GP*CP*CP*CP*AP*TP*TP*CP*AP*AP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*TP*TP*GP*AP*AP*TP*GP*GP*GP*CP*C)-3' × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | NANP8_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–70； UniProt 94–162 作者链 D； PDB构建体 2–70； UniProt 94–162 |
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| 条目编号 entry_id | 4rbo |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-09-12 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a Nanog homeobox (NANOG) from Homo sapiens at 3.30 A resolution |
| 关键词 keywords | ;Homeobox, PF00046 family, Structural Genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Partnership for Stem Cell Biology, STEMCELL, Protein Structure Initiative, PSI-BIOLOGY, DNA BINDING PROTEIN, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex ;; DNA BINDING PROTEIN, TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.35 Å |
| Rg（电子密度） | 14.38 Å |
| 总 Rg | 15.35 Å |
| 原子数 | 1720 |
| 残基数 | 79 |
| 排除体积 | 15606 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4rboA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Homeodomain-like |
| 结构域编号 domain_id | 4rboD00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Homeodomain-like |