SAXSdb — 4tqv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AlgM1

Sphingomonas sp.

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM2 × 1 （Q9KWT7） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM2 × 1 （Q9KWT7） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM2 × 1 （Q9KWT7） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM2 × 1 （Q9KWT7） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9KWT8_SPHSX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–301； UniProt 25–324 作者链 E； PDB构建体 2–301； UniProt 25–324 作者链 I； PDB构建体 2–301； UniProt 25–324 作者链 M； PDB构建体 2–301； UniProt 25–324

AlgM2

Sphingomonas sp.

UniProt Q9KWT7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgS × 2 （Q9KWT9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9KWT7_SPHSX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–293； UniProt 1–293 作者链 F； PDB构建体 1–293； UniProt 1–293 作者链 J； PDB构建体 1–293； UniProt 1–293 作者链 N； PDB构建体 1–293； UniProt 1–293

AlgS

Sphingomonas sp.

UniProt Q9KWT9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgM2 × 1 （Q9KWT7）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgM2 × 1 （Q9KWT7）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgM2 × 1 （Q9KWT7）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	AlgM1 × 1 （Q9KWT8） AlgM2 × 1 （Q9KWT7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9KWT9_SPHSX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 D； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 G； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 H； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 K； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 L； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 O； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363 作者链 P； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4tqv
沉积日期 deposition_date	2014-06-12
结构标题 title	Crystal structure of a bacterial ABC transporter involved in the import of the acidic polysaccharide alginate
关键词 keywords	ABC, sphingomonas, alginate, transporter, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4tqv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4tqv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4tqv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.10 Å
Rg（电子密度）	38.51 Å
总 Rg	38.82 Å
原子数	10125
残基数	1296
排除体积	183200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4tqv__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4tqv__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4tqv__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4tqv__assembly_4__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AlgM1
分子量 formula_weight	34286.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E,I,M
原子数 atom_count	40472

MERLWKDIKRDWLLYAMLLPTIIWFLIFLYKPMIGLQMAFKQYSAWKGIAGSPWIGFDHFVTLFQSEQFIRAIKNTLTLSGLSLLFGFPMPILLALMINEVYSKGYRKAVQTIVYLPHFISIVIVAGLVVTFLSPSTGVVNNMLSWIGLDRVYFLTQPEWFRPIYISSNIWKEAGFDSIVYLAAIMSINPALYESAQVDGATRWQMITRITLPCIVPTIAVLLVIRLGHILEVGFEYIILLYQPTTYETADVISTYIYRLGLQGARYDIATAAGIFNAVVALVIVLFANHMSRRITKTGVF

来源 Source

来源生物 organism	Sphingomonas sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28214
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AlgM2
分子量 formula_weight	34496.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F,J,N

MLATPFYSRSDRIFGIVNAVLLGIFALCALYPIIYIFSMSISSGAAVTQGRVFLLPVDIDFSAYGRVLHDKLFWTSYANTIFYTVFGVVTSLIFIVPGAYALSKPRIRGRRVFGFIIAFTMWFNAGMIPFFLNMRDLGLLDNRFGILIGFACNAFNIILMRNYFESISASFEEAARMDGANDLQILWKVYIPLAKPALATITLLCAISRWNGYFWAMVLLRAEEKIPLQVYLKKTIVDLNVNEEFAGALLTNSYSMETVVGAIIVMSIIPVIIVYPVVQKYFTKGVMLGGVKELEHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Sphingomonas sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28214
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	AlgS
分子量 formula_weight	39574.5 kDa
突变 mutation	E160Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H,K,L,O,P

MVASVSIQNVVKRYDKTTVVHGVSLDIEPGEFVVLVGPSGCGKSTTLRMVAGLEEISGGTIRIDGRVINDLAPKDRDVAMVFQNYALYPHLNVRDNISFGLRLKRTKKSVIDAAVKTAADILGLQPLLERKPSDLSGGQRQRVAMGRAIVRDPKVFLFDQPLSNLDAKLRTQMRAEIKRLHQRLGTTVIYVTHDQVEAMTLADRIVVMRDGLIEQIGKPMDLFLHPANTFVASFIGSPPMNLMPARIAVDSTQHVELNGGNRISLLPRAGTHLAPGQEVVFGIRPEDVTLDGVEGSERAQIKATVDIVEPLGSESILHATVGDHSLVVKVGGLNEVHPGDPVTLHVDLTRVHLFDAQSQASIY

来源 Source

来源生物 organism	Sphingomonas sp.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28214
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	115.245 Å
晶胞边长 b length_b	151.187 Å
晶胞边长 c length_c	162.406 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	68.66 °
晶胞夹角 β angle_beta	81.76 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.10 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.504 Å
最低分辨率 resolution_low	29.816 Å
R 因子 r_factor	0.2800
R_work r_work	0.2786
R_free r_free	0.3201

Crystal structure of a bacterial ABC transporter involved in the import of the acidic polysaccharide alginate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AlgM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

AlgM2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

AlgS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4tqv__assembly_1__model_1

4tqv__assembly_1__model_1 | I(q)

4tqv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a bacterial ABC transporter involved in the import of the acidic polysaccharide alginate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AlgM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AlgM2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AlgS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4tqv__assembly_1__model_1

4tqv__assembly_1__model_1 | I(q)

4tqv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)