Bradyrhizobium diazoefficiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （H7C6E5） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （H7C6E5） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | TLPA_BRADU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–184； UniProt 38–221 作者链 C； PDB构建体 1–184； UniProt 38–221 |
Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Thiol:disulfide interchange protein TlpA × 1 （P43221） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Thiol:disulfide interchange protein TlpA × 1 （P43221） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | H7C6E5_BRADU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 3–159； UniProt 123–279 作者链 D； PDB构建体 3–159； UniProt 123–279 |
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| 条目编号 entry_id | 4txv |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-07-07 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the mixed disulfide intermediate between thioredoxin-like TlpAs(C110S) and subunit II of cytochrome c oxidase CoxBPD (C233S) |
| 关键词 keywords | thioredoxin, mixed disulphide, cytochrome c oxidase, protein binding; PROTEIN BINDING |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.11 Å |
| Rg（电子密度） | 20.04 Å |
| 总 Rg | 20.94 Å |
| 原子数 | 2441 |
| 残基数 | 317 |
| 排除体积 | 43916 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4txva_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.47 — Thioredoxin fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.47.1 — Thioredoxin-like |
| 家族 Family family | c.47.1.10 — Glutathione peroxidase-like |
| 结构域编号 domain_id | d4txvc_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.47 — Thioredoxin fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.47.1 — Thioredoxin-like |
| 家族 Family family | c.47.1.10 — Glutathione peroxidase-like |
| 结构域编号 domain_id | 4txvA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 30 — Glutaredoxin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Glutaredoxin |
| 结构域编号 domain_id | 4txvB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 420 — Cupredoxins - blue copper proteins |
| 结构域编号 domain_id | 4txvC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 30 — Glutaredoxin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Glutaredoxin |
| 结构域编号 domain_id | 4txvD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 420 — Cupredoxins - blue copper proteins |