SAXSdb — 4u1e

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B × 1 （P06103） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （Q04067） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EIF3I_YEAS7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P06103

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I × 1 （A6ZMK5） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （Q04067） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EIF3B_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–47； UniProt 694–737

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q04067

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I × 1 （A6ZMK5） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B × 1 （P06103） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EIF3G_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 4–138； UniProt 1–135

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4u1e
沉积日期 deposition_date	2014-07-15
结构标题 title	Crystal structure of the eIF3b-CTD/eIF3i/eIF3g-NTD translation initiation complex
关键词 keywords	translation initiation, eIF3 complex, beta-propeller, translation; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4u1e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4u1e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4u1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.57 Å
Rg（电子密度）	24.99 Å
总 Rg	25.83 Å
原子数	3719
残基数	466
排除体积	65987 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4u1e__assembly_1__model_1`	Trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I
分子量 formula_weight	38803.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I
原子数 atom_count	3922

MKAIKLTGHERPLTQVKYNKEGDLLFSCSKDSSASVWYSLNGERLGTLDGHTGTIWSIDVDCFTKYCVTGSADYSIKLWDVSNGQCVATWKSPVPVKRVEFSPCGNYFLAILDNVMKNPGSINIYEIERDSATHELTKVSEEPIHKIITHEGLDAATVAGWSTKGKYIIAGHKDGKISKYDVSNNYEYVDSIDLHEKSISDMQFSPDLTYFITSSRDTNSFLVDVSTLQVLKKYETDCPLNTAVITPLKEFIILGGGQEAKDVTTTSANEGKFEARFYHKIFEEEIGRVQGHFGPLNTVAISPQGTSYASGGEDGFIRLHHFEKSYFDFKYDVEKAAEAKEHMQEAN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	307796
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
分子量 formula_weight	5677.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SNAEADTAMRDLILHQRELLKQWTEYREKIGQEMEKSMNFKIFDVQP

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G
分子量 formula_weight	15530.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

SNAMSEVAPEEIIENADGSRSIITYKIEDGVKYKITQKVKEVKVLEKVHKSVAERKNWHKYGSEKGSPAGPSAVTARLGEEVELRLSRNWKQAEEERIQKEKASLTKTGLQCRLCGNDHMTMNCPFKTILSELSALED

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	203

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4u1eI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

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晶胞边长 a length_a	54.270 Å
晶胞边长 b length_b	130.290 Å
晶胞边长 c length_c	192.920 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	48.490 Å
R 因子 r_factor	0.1874
R_work r_work	0.1858
R_free r_free	0.2162

Crystal structure of the eIF3b-CTD/eIF3i/eIF3g-NTD translation initiation complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4u1e__assembly_1__model_1

4u1e__assembly_1__model_1 | I(q)

4u1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the eIF3b-CTD/eIF3i/eIF3g-NTD translation initiation complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4u1e__assembly_1__model_1

4u1e__assembly_1__model_1 | I(q)

4u1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)