SAXSdb — 4uif

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN

DENGUE VIRUS 2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 720	DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN × 180 （E0WXJ3） ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - HEAVY CHAIN × 180 ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN × 180 （S6BGD6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D6MQ38_9FLAV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 E； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN

DENGUE VIRUS 2

UniProt E0WXJ3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 720	DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN × 180 （D6MQ38） ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - HEAVY CHAIN × 180 ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN × 180 （S6BGD6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E0WXJ3_9FLAV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 D； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 F； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277

ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN

物种未注明

UniProt S6BGD6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 720	DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN × 180 （D6MQ38） DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN × 180 （E0WXJ3） ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - HEAVY CHAIN × 180	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S6BGD6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–115； UniProt 20–134 作者链 J； PDB构建体 1–115； UniProt 20–134 作者链 L； PDB构建体 1–115； UniProt 20–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4uif
沉积日期 deposition_date	2015-03-30
结构标题 title	Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 in complex with antigen-binding fragments of human antibody 2D22
关键词 keywords	VIRAL PROTEIN, DENGUE VIRUS, HUMAN ANTIBODY, CRYO-EM, NEUTRALIZATION; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4uif__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4uif__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4uif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	216.30 Å
总 Rg	216.30 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	19198000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4uif__assembly_1__model_1`	720-meric （720）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN
分子量 formula_weight	54258.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	2394

MRCIGISNRDFVEGVSGGSWVDIVLEHGSCVTTMAKNKPTLDFELIKTEAKHPATLRKYCVEAKLTNTTTASRCPTQGEPSLNEEQDKRFVCKHSMVDRGWGNGCGLFGKGGIVTCAMFTCKKNMEGKVVQPENLEYTIVITPHSGEENAVGNDTGKHGKEIKVTPQSSITEAELTGYGTVTMECSPRTGLDFNEMVLLQMENKAWLVHRQWFLDLPLPWLPGADTQGSNWIQKETLVTFKNPHAKKQDVVVLGSQEGAMHTALTGATEIQMSSGNLLFTGHLKCRLRMDKLQLKGMSYSMCTGKFKVVKEIAETQHGTIVIRVQYEGDGSPCKIPFEIMDLEKRHVLGRLITVNPIVTEKDSPVNIEAEPPFGDSYIIIGVEPGQLKLSWFKKGSSIGQMFETTMRGAKRMAILGDTAWDFGSLGGVFTSIGKALHQVFGAIYGAAFSGVSWTMKILIGVVITWIGMNSRSTSLSVSLVLVGVVTLYLGVMVQA

来源 Source

来源生物 organism	DENGUE VIRUS 2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11060
宿主生物 host_organism	AEDES ALBOPICTUS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN
分子量 formula_weight	8109.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

SVALVPHVGMGLETRTETWMSSEGAWKHAQRIETWILRHPGFTIMAAILAYTIGTTYFQRVLIFILLTAVTP

来源 Source

来源生物 organism	DENGUE VIRUS 2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11060
宿主生物 host_organism	AEDES ALBOPICTUS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - HEAVY CHAIN
分子量 formula_weight	13805.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,I,K

EVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFNNYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGGANYAQKFQGRVTITADRSTSTVYMELSGLRSEDTAVYYCARRPQSIFDWNFDLWGRGTLVTVSSAGTKGPS

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN
分子量 formula_weight	12090.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,J,L

QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNVGSNYVYWYQQLPGTAPKLLIYRNNRRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCATWDDSLSGLVFGGGTKLTVLGQPKA

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.500 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	6.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	CROSS-COMMON LINES
颗粒数 num_particles	2485

Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 in complex with antigen-binding fragments of human antibody 2D22

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4uif__assembly_1__model_1

4uif__assembly_1__model_1 | I(q)

4uif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 in complex with antigen-binding fragments of human antibody 2D22

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN PVP94 07 - ENVELOPE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DENGUE VIRUS SEROTYPE 2 STRAIN STRAIN PVP94 07 - MEMBRANE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ANTIGEN-BINDING FRAGMENT OF HUMAN ANTIBODY 2D22 - LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4uif__assembly_1__model_1

4uif__assembly_1__model_1 | I(q)

4uif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)