4un0

Crystal structure of the human CDK12-cyclinK complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYCLIN-K

HOMO SAPIENS

UniProt O75909

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 CYCLIN-DEPENDENT KINASE 12 × 1 (Q9NYV4) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 CYCLIN-DEPENDENT KINASE 12 × 1 (Q9NYV4) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CCNK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–259; UniProt 11–267 作者链 B; PDB构建体 3–259; UniProt 11–267

CYCLIN-DEPENDENT KINASE 12

HOMO SAPIENS

UniProt Q9NYV4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 CYCLIN-K × 1 (O75909) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 CYCLIN-K × 1 (O75909) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDK12_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 3–326; UniProt 715–1038 作者链 D; PDB构建体 3–326; UniProt 715–1038

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4un0
沉积日期 deposition_date2014-05-22
结构标题 titleCrystal structure of the human CDK12-cyclinK complex
关键词 keywordsTRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4un0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4un0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4un0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)28.39 Å
Rg(电子密度)27.40 Å
总 Rg28.12 Å
原子数4254
残基数547
排除体积76176 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4un0__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4un0__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd4un0a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.74 — Cyclin-like
超家族 Superfamily superfamilya.74.1 — Cyclin-like
家族 Family familya.74.1.1 — Cyclin
结构域编号 domain_idd4un0a2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.74 — Cyclin-like
超家族 Superfamily superfamilya.74.1 — Cyclin-like
家族 Family familya.74.1.1 — Cyclin
结构域编号 domain_idd4un0b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.74 — Cyclin-like
超家族 Superfamily superfamilya.74.1 — Cyclin-like
家族 Family familya.74.1.1 — Cyclin
结构域编号 domain_idd4un0b2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.74 — Cyclin-like
超家族 Superfamily superfamilya.74.1 — Cyclin-like
家族 Family familya.74.1.1 — Cyclin
结构域编号 domain_idd4un0c_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4un0d_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id4un0A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id4un0A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id4un0B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id4un0B02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id4un0C01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id4un0C02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id4un0D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id4un0D02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
▶

7. 引用文献 (1)