DEINOCOCCUS RADIODURANS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*CP*CP*TP*AP*TP*CP*CP*AP*AAB*GP*TP*CP*TP*CP*CP*G)-3' × 1 5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*GP*AP*CP*AP*TP*GP*GP*AP*CP*AP*G)-3' × 1 CHLORIDE ION × 1 GLYCEROL × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | UNG_DEIRA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247 |
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| 条目编号 entry_id | 4uqm |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-06-24 |
| 结构标题 title | Crystal structure determination of uracil-DNA N-glycosylase (UNG) from Deinococcus radiodurans in complex with DNA - new insights into the role of the Leucine-loop for damage recognition and repair |
| 关键词 keywords | HYDROLASE-DNA COMPLEX, BASE EXCISION REPAIR, RADIATION RESISTANCE, DNA DAMAGE, DNA REPAIR, PROTEIN-DNA COMPLEX; HYDROLASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.24 Å |
| Rg（电子密度） | 18.78 Å |
| 总 Rg | 19.78 Å |
| 原子数 | 2293 |
| 残基数 | 251 |
| 排除体积 | 39408 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4uqmA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 470 — Uracil-DNA Glycosylase, subunit E |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Uracil-DNA glycosylase-like domain |