SAXSdb — 4ux9

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7 × 1 （O14733） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7 × 1 （O14733） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7 × 1 （O14733） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 5 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7 × 1 （O14733） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MK08_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364 作者链 B； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364 作者链 C； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364 作者链 D； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364

DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7

物种未注明

UniProt O14733

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8 × 1 （P45983） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8 × 1 （P45983） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8 × 1 （P45983） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 5 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8 × 1 （P45983） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SULFATE ION × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MP2K7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–12； UniProt 37–48 作者链 G； PDB构建体 1–12； UniProt 37–48 作者链 H； PDB构建体 1–12； UniProt 37–48 作者链 I； PDB构建体 1–12； UniProt 37–48

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ux9
沉积日期 deposition_date	2014-08-20
结构标题 title	Crystal structure of JNK1 bound to a MKK7 docking motif
关键词 keywords	TRANSFERASE, JNK1, INTRINSICALLY DISORDERED DOMAINS, MKK7; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4ux9__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4ux9__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4ux9__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.19 Å
Rg（电子密度）	21.22 Å
总 Rg	22.02 Å
原子数	2922
残基数	353
排除体积	52397 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4ux9__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4ux9__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4ux9__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4ux9__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8
分子量 formula_weight	42096.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.24
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11697

MSRSKRDNNFYSVEIGDSTFTVLKRYQNLKPIGSGAQGIVCAAYDAILERNVAIKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLMKCVNHKNIIGLLNVFTPQKSLEEFQDVYIVMELMDANLCQVIQMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLARTAGTSFMMTPYVVTRYYRAPEVILGMGYKENVDLWSVGCIMGEMVCHKILFPGRDYIDQWNKVIEQLGTPCPEFMKKLQPTVRTYVENRPKYAGYSFEKLFPDVLFPADSEHNKLKASQARDLLSKMLVIDASKRISVDEALQHPYINVWYDPSEAEAPPPKIPDKQLDEREHTIEEWKELIYKEVMDLE

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7
分子量 formula_weight	1391.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G,H,I

QRPRPTLQLPLA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	276

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4ux9A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4ux9D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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晶胞边长 a length_a	108.666 Å
晶胞边长 b length_b	180.159 Å
晶胞边长 c length_c	101.144 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	110.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.340 Å
最低分辨率 resolution_low	49.210 Å
R 因子 r_factor	0.2021
R_work r_work	0.1999
R_free r_free	0.2405

Crystal structure of JNK1 bound to a MKK7 docking motif

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ux9__assembly_4__model_1

4ux9__assembly_4__model_1 | I(q)

4ux9__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of JNK1 bound to a MKK7 docking motif

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ux9__assembly_4__model_1

4ux9__assembly_4__model_1 | I(q)

4ux9__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)