4v93

Fitted coordinates for Lumbricus terrestris hemoglobin cryo-EM complex (EMD-2627)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EXTRACELLULAR GLOBIN-3

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLB3_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	1, 7
链与序列区间	作者链 A0； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 A5； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 AC； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 AH； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 AM； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 AR； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 AW； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 Ab； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 Ag； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 Al； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 Aq； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 Av； PDB构建体 1–149； UniProt 20–168 作者链 B4； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 BB； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 BG； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 BL； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 BQ； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 BV； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Ba； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Bf； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Bk； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Bp； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Bu； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Bz； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 C3； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CA； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CF； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CK； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CP； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CU； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 CZ； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Ce； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Cj； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Co； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Ct； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 Cy； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170

HEMOGLOBIN CHAIN D1

物种未注明

UniProt O61233

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O61233_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	2, 5
链与序列区间	作者链 A1； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 A6； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 AD； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 AI； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 AN； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 AS； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 AX； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 Ac； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 Ah； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 Am； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 Ar； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 Aw； PDB构建体 1–140； UniProt 19–158 作者链 B0； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 B5； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 BC； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 BH； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 BM； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 BR； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 BW； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Bb； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Bg； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Bl； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Bq； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Bv； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 C4； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 CB； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 CG； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 CL； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 CQ； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 CV； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Ca； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Cf； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Ck； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Cp； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Cu； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 Cz； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158

EXTRACELLULAR GLOBIN-4

物种未注明

UniProt P13579

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLB4_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	3, 6
链与序列区间	作者链 A2； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 A3； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 A7； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AA； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AE； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AF； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AJ； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AK； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AO； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AP； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AT； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AU； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AY； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 AZ； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ad； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ae； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ai； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Aj； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 An； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ao； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 As； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 At； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ax； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 Ay； PDB构建体 1–147； UniProt 5–151 作者链 B1； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 B6； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 BD； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 BI； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 BN； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 BS； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 BX； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 Bc； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 Bh； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 Bm； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 Br； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151 作者链 Bw； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

EXTRACELLULAR GLOBIN-2

物种未注明

UniProt P02218

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLB2_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A4； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 AB； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 AG； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 AL； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 AQ； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 AV； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Aa； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Af； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Ak； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Ap； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Au； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Az； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 B2； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 B3； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 B7； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BA； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BE； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BF； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BJ； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BK； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BO； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BP； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BT； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BU； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BY； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 BZ； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bd； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Be； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bi； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bj； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bn； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bo； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bs； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bt； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 Bx； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 By； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1

物种未注明

UniProt Q9GV76

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9GV76_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 C0； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 C5； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CC； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CH； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CM； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CR； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CW； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cb； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cg； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cl； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cq； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cv； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT

物种未注明

UniProt Q2I743

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT × 12 （Q2I742）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q2I743_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 C1； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 C6； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 CD； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 CI； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 CN； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 CS； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 CX； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Cc； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Ch； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Cm； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Cr； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Cw； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288

EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT

物种未注明

UniProt Q2I742

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 180	EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 12 （P11069） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 12 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 24 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-2 × 36 （P02218） HEMOGLOBIN CHAIN D1 × 24 （O61233） EXTRACELLULAR GLOBIN-4 × 12 （P13579） EXTRACELLULAR GLOBIN-3 × 24 （P11069） HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1 × 12 （Q9GV76） EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT × 12 （Q2I743）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q2I742_LUMTE
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 C2； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 C7； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CE； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CJ； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CO； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CT； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 CY； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cd； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Ci； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cn； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cs； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 Cx； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4v93
沉积日期 deposition_date	2014-04-16
结构标题 title	Fitted coordinates for Lumbricus terrestris hemoglobin cryo-EM complex (EMD-2627)
关键词 keywords	TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4v93__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4v93__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4v93__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	114.70 Å
总 Rg	114.70 Å
原子数	231000
残基数	28740
排除体积	4071400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4v93__assembly_1__model_1`	180-meric （180）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR GLOBIN-3
分子量 formula_weight	16902.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A0,A5,AC,AH,AM,AR,AW,Ab,Ag,Al,Aq,Av
原子数 atom_count	231000

HEHCCSEEDHRIVQKQWDILWRDTESSKIKIGFGRLLLTKLAKDIPEVNDLFKRVDIEHAEGPKFSAHALRILNGLDLAINLLDDPPALDAALDHLAHQHEVREGVQKAHFKKFGEILATGLPQVLDDYDALAWKSCLKGILTKISSRL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HEMOGLOBIN CHAIN D1
分子量 formula_weight	15988.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A1,A6,AD,AI,AN,AS,AX,Ac,Ah,Am,Ar,Aw

ECLVTESLKVKLQWASAFGHAHERVAFGLELWRDIIDDHPEIKAPFSRVRGDNIYSPEFGAHSQRVLSGLDITISMLDTPDMLAAQLAHLKVQHVERNLKPEFFDIFLKHLLHVLGDRLGTHFDFGAWHDCVDQIIDGIK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR GLOBIN-4
分子量 formula_weight	17136.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A2,A3,A7,AA,AE,AF,AJ,AK,AO,AP,AT,AU,AY,AZ,Ad,Ae,Ai,Aj,An,Ao,As,At,Ax,Ay

DCCSYEDRREIRHIWDDVWSSSFTDRRVAIVRAVFDDLFKHYPTSKALFERVKIDEPESGEFKSHLVRVANGLKLLINLLDDTLVLQSHLGHLADQHIQRKGVTKEYFRGIGEAFARVLPQVLSCFNVDAWNRCFHRLVARIAKDLP

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR GLOBIN-2
分子量 formula_weight	16268.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	36

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A4,AB,AG,AL,AQ,AV,Aa,Af,Ak,Ap,Au,Az,B2,B3,B7,BA,BE,BF,BJ,BK,BO,BP,BT,BU,BY,BZ,Bd,Be,Bi,Bj,Bn,Bo,Bs,Bt,Bx,By

KKQCGVLEGLKVKSEWGRAYGSGHDREAFSQAIWRATFAQVPESRSLFKRVHGDDTSHPAFIAHADRVLGGLDIAISTLDQPATLKEELDHLQVQHEGRKIPDNYFDAFKTAILHVVAAQLGRCYDREAWDACIDHIEDGIKGHH

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	HEMOGLOBIN CHAIN D1
分子量 formula_weight	17948.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B0,B5,BC,BH,BM,BR,BW,Bb,Bg,Bl,Bq,Bv,C4,CB,CG,CL,CQ,CV,Ca,Cf,Ck,Cp,Cu,Cz

MKVFVAVFLLAFATYVSAECLVTESLKVKLQWASAFGHAHERVAFGLELWRDIIDDHPEIKAPFSRVRGDNIYSPEFGAHSQRVLSGLDITISMLDTPDMLAAQLAHLKVQHVERNLKPEFFDIFLKHLLHVLGDRLGTHFDFGAWHDCVDQIIDGIK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR GLOBIN-4
分子量 formula_weight	17567.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B1,B6,BD,BI,BN,BS,BX,Bc,Bh,Bm,Br,Bw

ADDEDCCSYEDRREIRHIWDDVWSSSFTDRRVAIVRAVFDDLFKHYPTSKALFERVKIDEPESGEFKSHLVRVANGLKLLINLLDDTLVLQSHLGHLADQHIQRKGVTKEYFRGIGEAFARVLPQVLSCFNVDAWNRCFHRLVARIAKDLP

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR GLOBIN-3
分子量 formula_weight	19126.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B4,BB,BG,BL,BQ,BV,Ba,Bf,Bk,Bp,Bu,Bz,C3,CA,CF,CK,CP,CU,CZ,Ce,Cj,Co,Ct,Cy

MLRQLLVLVGLAVVCLADEHEHCCSEEDHRIVQKQWDILWRDTESSKIKIGFGRLLLTKLAKDIPEVNDLFKRVDIEHAEGPKFSAHALRILNGLDLAINLLDDPPALDAALDHLAHQHEVREGVQKAHFKKFGEILATGLPQVLDDYDALAWKSCLKGILTKISSRLNA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1
分子量 formula_weight	27460.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C0,C5,CC,CH,CM,CR,CW,Cb,Cg,Cl,Cq,Cv

MWYVLGLMLVGLAAGASDPYQERRFQYLVKNQNLHIDYLAKKLHDIEEEYNKLTHDVDKKTIRQLKARISNLEEHHCDEHESECRGDVPECIHDLLFCDGEKDCRDGSDEDPETCSLNITHVGSSYTGLATWTSCEDLNPDHAIVTITAAHRKSFFPNRVWLRATLSYELDEHDHTVSTTQLRGFYNFGKRELLLAPLKGQSEGYGVICDFNLGDDDHADCKIVVPSSLFVCAHFNAQRY

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT
分子量 formula_weight	32075.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C1,C6,CD,CI,CN,CS,CX,Cc,Ch,Cm,Cr,Cw

MLRLLLLSALSGLILADHHQPSGGGGGSYGGGGGGGGPFGRLFSDQLDPRLGANAFLIIRLDRIIEKLRTKLDEAEKIDPEHFVSEIDARVTKIEGTHCEKRTFQCGGNEQECISDLLVCDGHKDCHNAHDEDPDVCDTSVVKAGNVFSGTSTWHGCLAREDHVTRITITASKRRKFFTARIWLRALVESELERHGENVTSSFNAKGYYNFASRRLILLPTDDHDDHLAVVCSFNRGDNERAECHRVTEATLHQCADLFVTLEEHDDHDDHDDDHHDDHGKHHGGKHH

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT
分子量 formula_weight	26877.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C2,C7,CE,CJ,CO,CT,CY,Cd,Ci,Cn,Cs,Cx

MKSLGLLLAALAVVVTLASADSPPAQSHDEIIDKLIERTNKITTSISHVESLLDDRLDPKRIRKAGSLRHRVEELEDPSCDEHEHQCGGDDPQCISKLFVCDGHNDCRNGEDEKDCTLPTKAGDKFIGDVCFDHCTKRRPEHMTLAFESSSIAAFFTPIADLHVHIEIESETDEDESEVSMPADGEYSFADHRLTIHPPEEDGLGLVGEFDGYNFDRFVGHIVHELSEEVCAEFIFHRKK

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	8.100 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	8.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	4500

Fitted coordinates for Lumbricus terrestris hemoglobin cryo-EM complex (EMD-2627)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EXTRACELLULAR GLOBIN-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HEMOGLOBIN CHAIN D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXTRACELLULAR GLOBIN-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXTRACELLULAR GLOBIN-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HEMOGLOBIN LINKER CHAIN L1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L2 SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN LINKER L3 SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4v93__assembly_1__model_1

4v93__assembly_1__model_1 | I(q)

4v93__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer