4v94

Molecular architecture of the eukaryotic chaperonin TRiC/CCT derived by a combination of chemical crosslinking and mass-spectrometry, XL-MS

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T-complex protein 1 subunit zeta

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPZ_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546 作者链 N； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546 作者链 f； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546 作者链 n； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546

T-complex protein 1 subunit theta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P47079

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPQ_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–568； UniProt 1–568 作者链 P； PDB构建体 1–568； UniProt 1–568 作者链 h； PDB构建体 1–568； UniProt 1–568 作者链 p； PDB构建体 1–568； UniProt 1–568

T-complex protein 1 subunit eta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P42943

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPH_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–550； UniProt 1–550 作者链 O； PDB构建体 1–550； UniProt 1–550 作者链 g； PDB构建体 1–550； UniProt 1–550 作者链 o； PDB构建体 1–550； UniProt 1–550

T-complex protein 1 subunit epsilon

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40413

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPE_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–562； UniProt 1–562 作者链 M； PDB构建体 1–562； UniProt 1–562 作者链 e； PDB构建体 1–562； UniProt 1–562 作者链 m； PDB构建体 1–562； UniProt 1–562

T-complex protein 1 subunit beta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39076

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527 作者链 J； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527 作者链 b； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527 作者链 j； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527

T-complex protein 1 subunit delta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39078

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPD_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528 作者链 L； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528 作者链 d； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528 作者链 l； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528

T-complex protein 1 subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P12612

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit gamma × 2 （P39077） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–559； UniProt 1–559 作者链 I； PDB构建体 1–559； UniProt 1–559 作者链 a； PDB构建体 1–559； UniProt 1–559 作者链 i； PDB构建体 1–559； UniProt 1–559

T-complex protein 1 subunit gamma

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39077

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	T-complex protein 1 subunit zeta × 2 （P39079） T-complex protein 1 subunit theta × 2 （P47079） T-complex protein 1 subunit eta × 2 （P42943） T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 （P40413） T-complex protein 1 subunit beta × 2 （P39076） T-complex protein 1 subunit delta × 2 （P39078） T-complex protein 1 subunit alpha × 2 （P12612） MAGNESIUM ION × 16 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCPG_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–374； UniProt 1–374 作者链 C； PDB构建体 431–590； UniProt 375–534 作者链 K； PDB构建体 1–374； UniProt 1–374 作者链 K； PDB构建体 431–590； UniProt 375–534 作者链 c； PDB构建体 1–374； UniProt 1–374 作者链 c； PDB构建体 431–590； UniProt 375–534 作者链 k； PDB构建体 1–374； UniProt 1–374 作者链 k； PDB构建体 431–590； UniProt 375–534

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4v94
沉积日期 deposition_date	2012-01-11
结构标题 title	Molecular architecture of the eukaryotic chaperonin TRiC/CCT derived by a combination of chemical crosslinking and mass-spectrometry, XL-MS
关键词 keywords	chaperonin, nano cage, protein folding, molecular chaperone, ATPase, cytosol, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4v94__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4v94__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4v94__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.56 Å
Rg（电子密度）	64.42 Å
总 Rg	64.49 Å
原子数	60040
残基数	8426
排除体积	1066400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4v94__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4v94__assembly_2__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit zeta
分子量 formula_weight	59997.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,N,f,n
原子数 atom_count	120080

MSLQLLNPKAESLRRDAALKVNVTSAEGLQSVLETNLGPKGTLKMLVDGAGNIKLTKDGKVLLTEMQIQSPTAVLIARAAAAQDEITGDGTTTVVCLVGELLRQAHRFIQEGVHPRIITDGFEIARKESMKFLDEFKISKTNLSNDREFLLQVARSSLLTKVDADLTEVLTPIVTDAVLSVYDAQADNLDLHMVEIMQMQHLSPKDTTFIKGLVLDHGGRHPDMPTRVKNAYVLILNVSLEYEKTEVNSGFFYSSADQRDKLAASERKFVDAKLKKIIDLKNEVCGMDPDKGFVIINQKGIDPMSLDVFAKHNILALRRAKRRNMERLQLVTGGEAQNSVEDLSPQILGFSGLVYQETIGEEKFTYVTENTDPKSCTILIKGSTHYALAQTKDAVRDGLRAVANVLKDKNIIPGAGAFYIALSRYLRSANMNKLGAKGKTKTGIEAFAEALLVIPKTLVKNSGFDPLDVLAMVEDELDDAQDSDETRYVGVDLNIGDSCDPTIEGIWDSYRVLRNAITGATGIASNLLLCDELLRAGRSTLKETPQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit theta
分子量 formula_weight	61735.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,P,h,p

MSLRLPQNPNAGLFKQGYNSYSNADGQIIKSIAAIRELHQMCLTSMGPCGRNKIIVNHLGKIIITNDAATMLRELDIVHPAVKVLVMATEQQKIDMGDGTNLVMILAGELLNVSEKLISMGLSAVEIIQGYNMARKFTLKELDEMVVGEITDKNDKNELLKMIKPVISSKKYGSEDILSELVSEAVSHVLPVAQQAGEIPYFNVDSIRVVKIMGGSLSNSTVIKGMVFNREPEGHVKSLSEDKKHKVAVFTCPLDIANTETKGTVLLHNAQEMLDFSKGEEKQIDAMMKEIADMGVECIVAGAGVGELALHYLNRYGILVLKVPSKFELRRLCRVCGATPLPRLGAPTPEELGLVETVKTMEIGGDRVTVFKQEQGEISRTSTIILRGATQNNLDDIERAIDDGVAAVKGLMKPSGGKLLPGAGATEIELISRITKYGERTPGLLQLAIKQFAVAFEVVPRTLAETAGLDVNEVLPNLYAAHNVTEPGAVKTDHLYKGVDIDGESDEGVKDIREENIYDMLATKKFAINVATEAATTVLSIDQIIMAKKAGGPRAPQGPRPGNWDQED

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit eta
分子量 formula_weight	59802.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,O,g,o

MNFGSQTPTIVVLKEGTDASQGKGQIISNINACVAVQEALKPTLGPLGSDILIVTSNQKTTISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDISRAQDAEVGDGTTSVTILAGELMKEAKPFLEEGISSHLIMKGYRKAVSLAVEKINELAVDITSEKSSGRELLERCARTAMSSKLIHNNADFFVKMCVDAVLSLDRNDLDDKLIGIKKIPGGAMEESLFINGVAFKKTFSYAGFEQQPKKFNNPKILSLNVELELKAEKDNAEVRVEHVEDYQAIVDAEWQLIFEKLRQVEETGANIVLSKLPIGDLATQFFADRNIFCAGRVSADDMNRVIQAVGGSIQSTTSDIKPEHLGTCALFEEMQIGSERYNLFQGCPQAKTCTLLLRGGAEQVIAEVERSLHDAIMIVKRALQNKLIVAGGGATEMEVSKCLRDYSKTIAGKQQMIINAFAKALEVIPRQLCENAGFDAIEILNKLRLAHSKGEKWYGVVFETENIGDNFAKFVWEPALVKINALNSATEATNLILSVDETITNKGSESANAGMMPPQGAGRGRGMPM

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit epsilon
分子量 formula_weight	61995.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,M,e,m

MAARPQQPPMEMPDLSNAIVAQDEMGRPFIIVKDQGNKKRQHGLEAKKSHILAARSVASIIKTSLGPRGLDKILISPDGEITITNDGATILSQMELDNEIAKLLVQLSKSQDDEIGDGTTGVVVLASALLDQALELIQKGIHPIKIANGFDEAAKLAISKLEETCDDISASNDELFRDFLLRAAKTSLGSKIVSKDHDRFAEMAVEAVINVMDKDRKDVDFDLIKMQGRVGGSISDSKLINGVILDKDFSHPQMPKCVLPKEGSDGVKLAILTCPFEPPKPKTKHKLDISSVEEYQKLQTYEQDKFKEMIDDVKKAGADVVICQWGFDDEANHLLLQNDLPAVRWVGGQELEHIAISTNGRIVPRFQDLSKDKLGTCSRIYEQEFGTTKDRMLIIEQSKETKTVTCFVRGSNKMIVDEAERALHDSLCVVRNLVKDSRVVYGGGAAEVTMSLAVSEEADKQRGIDQYAFRGFAQALDTIPMTLAENSGLDPIGTLSTLKSKQLKEKISNIGVDCLGYGSNDMKELFVVDPFIGKKQQILLATQLCRMILKIDNVIISGKDEY

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit beta
分子量 formula_weight	57276.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,J,b,j

MSVQIFGDQVTEERAENARLSAFVGAIAVGDLVKSTLGPKGMDKLLQSASSNTCMVTNDGATILKSIPLDNPAAKVLVNISKVQDDEVGDGTTSVTVLSAELLREAEKLIDQSKIHPQTIIEGYRLASAAALDALTKAAVDNSHDKTMFREDLIHIAKTTLSSKILSQDKDHFAELATNAILRLKGSTNLEHIQIIKILGGKLSDSFLDEGFILAKKFGNNQPKRIENAKILIANTTLDTDKVKIFGTKFKVDSTAKLAQLEKAEREKMKNKIAKISKFGINTFINRQLIYDYPEQLFTDLGINSIEHADFEGVERLALVTGGEVVSTFDEPSKCKLGECDVIEEIMLGEQPFLKFSGCKAGEACTIVLRGATDQTLDEAERSLHDALSVLSQTTKETRTVLGGGCAEMVMSKAVDTEAQNIDGKKSLAVEAFARALRQLPTILADNAGFDSSELVSKLRSSIYNGISTSGLDLNNGTIADMRQLGIVESYKLKRAVVSSASEAAEVLLRVDNIIRARPRTANRQHM

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit delta
分子量 formula_weight	57740.4 kDa
突变 mutation	G345D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,L,d,l

MSAKVPSNATFKNKEKPQEVRKANIIAARSVADAIRTSLGPKGMDKMIKTSRGEIIISNDGHTILKQMAILHPVARMLVEVSAAQDSEAGDGTTSVVILTGALLGAAERLLNKGIHPTIIADSFQSAAKRSVDILLEMCHKVSLSDREQLVRAASTSLSSKIVSQYSSFLAPLAVDSVLKISDENSKNVDLNDIRLVKKVGGTIDDTEMIDGVVLTQTAIKSAGGPTRKEKAKIGLIQFQISPPKPDTENNIIVNDYRQMDKILKEERAYLLNICKKIKKAKCNVLLIQKSILRDAVNDLALHFLSKLNIMVVKDIEREEIEFLSKGLGCKPIADIELFTEDRLDSADLVEEIDSDGSKIVRVTGIRNNNARPTVSVVIRGANNMIIDETERSLHDALCVIRCLVKERGLIAGGGAPEIEISRRLSKEARSMEGVQAFIWQEFASALEVIPTTLAENAGLNSIKVVTELRSKHENGELNDGISVRRSGTTNTYEEHILQPVLVSTSAITLASECVKSILRIDDIAFSR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit alpha
分子量 formula_weight	60557.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,I,a,i

MSQLFNNSRSDTLFLGGEKISGDDIRNQNVLATMAVANVVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDFTVTNDGATILSLLDVQHPAGKILVELAQQQDREIGDGTTSVVIIASELLKRANELVKNKIHPTTIITGFRVALREAIRFINEVLSTSVDTLGKETLINIAKTSMSSKIIGADSDFFSNMVVDALLAVKTQNSKGEIKYPVKAVNVLKAHGKSATESLLVPGYALNCTVASQAMPKRIAGGNVKIACLDLNLQKARMAMGVQINIDDPEQLEQIRKREAGIVLERVKKIIDAGAQVVLTTKGIDDLCLKEFVEAKIMGVRRCKKEDLRRIARATGATLVSSMSNLEGEETFESSYLGLCDEVVQAKFSDDECILIKGTSKHSSSSIILRGANDYSLDEMERSLHDSLSVVKRTLESGNVVPGGGCVEAALNIYLDNFATTVGSREQLAIAEFAAALLIIPKTLAVNAAKDSSELVAKLRSYHAASQMAKPEDVKRRSYRNYGLDLIRGKIVDEIHAGVLEPTISKVKSLKSALEACVAILRIDTMITVDPEPPKEDPHDH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	T-complex protein 1 subunit gamma
分子量 formula_weight	64939.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,K,c,k

MQAPVVFMNASQERTTGRQAQISNITAAKAVADVIRTCLGPKAMLKMLLDPMGGLVLTNDGHAILREIDVAHPAAKSMLELSRTQDEEVGDGTTTVIILAGEILAQCAPYLIEKNIHPVIIIQALKKALTDALEVIKQVSKPVDVENDAAMKKLIQASIGTKYVIHWSEKMCELALDAVKTVRKDLGQTVEGEPNFEIDIKRYVRVEKIPGGDVLDSRVLKGVLLNKDVVHPKMSRHIENPRVVLLDCPLEYKKGESQTNIEIEKEEDWNRILQIEEEQVQLMCEQILAVRPTLVITEKGVSDLAQHYLLKGGCSVLRRVKKSDNNRIARVTGATIVNRVEDLKESDVGTNCGLFKVEMIGDEYFSFLDNCKEPGSGSGWSHPQFEKGSGKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALGSGHHHHHHHHGSGKACTIMLRGGSKDILNEIDRNLQDAMAVARNVMLSPSLSPGGGATEMAVSVKLAEKAKQLEGIQQWPYQAVADAMECIPRTLIQNAGGDPIRLLSQLRAKHAQGNFTTGIDGDKGKIVDMVSYGIWEPEVIKQQSVKTAIESACLLLRVDDIVSGVRKQE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	SACCHAROMYCES CEREVISIAE

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	32

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	32

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	32

▶

晶胞边长 a length_a	159.100 Å
晶胞边长 b length_b	162.540 Å
晶胞边长 c length_c	268.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	85.23 °
晶胞夹角 β angle_beta	81.15 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	61.17 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.800 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2592
R_work r_work	0.2568
R_free r_free	0.3046

Molecular architecture of the eukaryotic chaperonin TRiC/CCT derived by a combination of chemical crosslinking and mass-spectrometry, XL-MS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T-complex protein 1 subunit zeta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit theta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit eta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit epsilon

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit delta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-complex protein 1 subunit gamma

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4v94__assembly_1__model_1

4v94__assembly_1__model_1 | I(q)

4v94__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer