Xyloside xylosyltransferase 1
Mus musculus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 87–392 | 片段:unp residues 87-392 | Coagulation factor IX × 1 (P00740) alpha-D-xylopyranose-(1-3)-beta-D-glucopyranose × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 UDX URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-XYLOPYRANOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, and 21% PEG3350 | 分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4WNH | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WLG crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1, apo form 提交 2014-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 4WLG crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1, apo form 提交 2014-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 4WLG crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1, apo form 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
链 B
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 4WLM Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese 提交 2014-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 4WLM Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese 提交 2014-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 4WLM Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese 提交 2014-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
链 B
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 4WLZ Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese and UDP 提交 2014-10-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
87–392(306 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.288 |
| 4WLZ Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese and UDP 提交 2014-10-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
87–392(306 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.288 |
| 4WLZ Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese and UDP 提交 2014-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
链 B
87–392(306 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;20 mM HEPES, 1.5 M Li2SO4
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.288 |
| 4WM0 Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with acceptor ligand 提交 2014-10-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, and 21% PEG3350
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.233 |
| 4WMA Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese,acceptor ligand and UDP-Glucose 提交 2014-10-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UPG URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, and 21% PEG3350
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.243 |
| 4WMB crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese, acceptor ligand and UDP 提交 2014-10-08 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, and 21% PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.235 |
| 4WMI Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese, product ligand and UDP (Product complex I) 提交 2014-10-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, and 21% PEG3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 4WMK Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese, product ligand and UDP (Product complex II) 提交 2014-10-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, and 21% PEG3350
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.246 |
| 4WN2 Crystal structure of mouse Xyloside xylosyltransferase 1 complexed with manganese, product ligand and UDP (Product complex III) 提交 2014-10-10 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
87–392(306 aa)
片段:unp residues 87-392
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris, and 21% PEG3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | XXLT1_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–306; UniProt 87–392 |