4wr8

Macrophage Migration Inhibitory Factor in complex with a biaryltriazole inhibitor (3b-180)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Macrophage migration inhibitory factor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
5	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 8 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 water × 3	与蛋白数一致
6	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MIF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 B； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 C； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 D； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 E； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 F； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 G； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 H； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 I； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 J； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 K； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 L； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 M； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 N； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 O； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 P； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 Q； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115 作者链 R； PDB构建体 1–114； UniProt 2–115

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wr8
沉积日期 deposition_date	2014-10-23
结构标题 title	Macrophage Migration Inhibitory Factor in complex with a biaryltriazole inhibitor (3b-180)
关键词 keywords	CD74 binding, tautomerase, inhibitor, complex, ISOMERASE-ISOMERASE INHIBITOR complex; ISOMERASE/ISOMERASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4wr8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4wr8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4wr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.84 Å
Rg（电子密度）	18.59 Å
总 Rg	19.48 Å
原子数	2591
残基数	342
排除体积	46020 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4wr8__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4wr8__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4wr8__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4wr8__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`4wr8__assembly_5__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`4wr8__assembly_6__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Macrophage migration inhibitory factor
分子量 formula_weight	12355.1 kDa
EC 编号 ec_number	5.3.2.1,5.3.3.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R
原子数 atom_count	15883

PMFIVNTNVPRASVPDGFLSELTQQLAQATGKPPQYIAVHVVPDQLMAFGGSSEPCALCSLHSIGKIGGAQNRSYSKLLCGLLAERLRISPDRVYINYYDMNAANVGWNNSTFA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	53

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	4-[4-(quinolin-2-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]phenol
分子量 formula_weight	288.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	236

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_id	d4wr8a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8e_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8f_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8g_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8h_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8i_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8j_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8k_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8l_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8m_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8n_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8o_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8p_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8q_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

结构域编号 domain_id	d4wr8r_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.80 — Tautomerase/MIF
超家族 Superfamily superfamily	d.80.1 — Tautomerase/MIF
家族 Family family	d.80.1.3 — MIF-related

CATH v4.4 (18 domains)

结构域编号 domain_id	4wr8A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8F00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8G00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8H00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8I00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8J00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8K00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8L00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8M00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8N00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8O00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8P00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8Q00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	4wr8R00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

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晶胞边长 a length_a	138.644 Å
晶胞边长 b length_b	138.644 Å
晶胞边长 c length_c	266.586 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	144

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2248
R_work r_work	0.2219
R_free r_free	0.2805

Macrophage Migration Inhibitory Factor in complex with a biaryltriazole inhibitor (3b-180)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Macrophage migration inhibitory factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wr8__assembly_1__model_1

4wr8__assembly_1__model_1 | I(q)

4wr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

CATH v4.4 (18 domains)

7. 引用文献 (1)

Macrophage Migration Inhibitory Factor in complex with a biaryltriazole inhibitor (3b-180)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Macrophage migration inhibitory factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wr8__assembly_1__model_1

4wr8__assembly_1__model_1 | I(q)

4wr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

CATH v4.4 (18 domains)

7. 引用文献 (1)