SAXSdb — 4wsa

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA

Influenza B virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	;Influenza B vRNA promoter 3' end ; × 1 ;Influenza B vRNA promoter 5' end ; × 1 RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit × 1 （Q5V8Y6） PB2 × 1 （Q5V8X3）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5V8Z9_9INFB
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 15–740； UniProt 1–726

RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit

Influenza B virus

UniProt Q5V8Y6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	;Influenza B vRNA promoter 3' end ; × 1 ;Influenza B vRNA promoter 5' end ; × 1 PA × 1 （Q5V8Z9） PB2 × 1 （Q5V8X3）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5V8Y6_9INFB
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 10–761； UniProt 1–752

PB2

Influenza B virus

UniProt Q5V8X3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	;Influenza B vRNA promoter 3' end ; × 1 ;Influenza B vRNA promoter 5' end ; × 1 PA × 1 （Q5V8Z9） RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit × 1 （Q5V8Y6）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5V8X3_9INFB
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 10–779； UniProt 1–770

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wsa
沉积日期 deposition_date	2014-10-26
结构标题 title	Crystal structure of Influenza B polymerase bound to the vRNA promoter (FluB1 form)
关键词 keywords	TRANSFERASE-RNA COMPLEX; TRANSFERASE/RNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4wsa__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4wsa__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4wsa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.34 Å
Rg（电子密度）	40.78 Å
总 Rg	41.14 Å
原子数	17940
残基数	2206
排除体积	319170 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4wsa__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Influenza B vRNA promoter 3' end ;
分子量 formula_weight	5584.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R
原子数 atom_count	17940

UAUACCUCUGCUUCUGCU

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;Influenza B vRNA promoter 5' end ;
分子量 formula_weight	4557.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	V

AGUAGUAACAAGAG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PA
分子量 formula_weight	85822.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

GSHHHHHHHHGSGSMDTFITRNFQTTIIQKAKNTMAEFSEDPELQPAMLFNICVHLEVCYVISDMNFLDEEGKAYTALEGQGKEQNLRPQYEVIEGMPRTIAWMVQRSLAQEHGIETPKYLADLFDYKTKRFIEVGITKGLADDYFWKKKEKLGNSMELMIFSYNQDYSLSNESSLDEEGKGRVLSRLTELQAELSLKNLWQVLIGEEDVEKGIDFKLGQTISRLRDISVPAGFSNFEGMRSYIDNIDPKGAIERNLARMSPLVSVTPKKLTWEDLRPIGPHIYNHELPEVPYNAFLLMSDELGLANMTEGKSKKPKTLAKECLEKYSTLRDQTDPILIMKSEKANENFLWKLWRDCVNTISNEEMSNELQKTNYAKWATGDGLTYQKIMKEVAIDDETMCQEEPKIPNKCRVAAWVQTEMNLLSTLTSKRALDLPEIGPDVAPVEHVGSERRKYFVNEINYCKASTVMMKYVLFHTSLLNESNASMGKYKVIPITNRVVNEKGESFDMLYGLAVKGQSHLRGDTDVVTVVTFEFSSTDPRVDSGKWPKYTVFRIGSLFVSGREKSVYLYCRVNGTNKIQMKWGMEARRCLLQSMQQMEAIVEQESSIQGYDMTKACFKGDRVNSPKTFSIGTQEGKLVKGSFGKALRVIFTKCLMHYVFGNAQLEGFSAESRRLLLLIQALKDRKGPWVFDLEGMYSGIEECISNNPWVIQSAYWFNEWLGFEKEGSKVLESVDEIMDEGSGSGENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Influenza B virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	289331
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit
分子量 formula_weight	86207.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.48
突变 mutation	Trichoplusia ni
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GSGSGSGSGMNINPYFLFIDVPIQAAISTTFPYTGVPPYSHGTGTGYTIDTVIRTHEYSNKGKQYISDVTGCTMVDPTNGPLPEDNEPSAYAQLDCVLEALDRMDEEHPGLFQAASQNAMETLMVTTVDKLTQGRQTFDWTVCRNQPAATALNTTITSFRLNDLNGADKGGLIPFCQDIIDSLDRPEMTFFSVKNIKKKLPAKNRKGFLIKRIPMKVKDKITKVEYIKRALSLNTMTKDAERGKLKRRAIATAGIQIRGFVLVVENLAKNICENLEQSGLPVGGNEKKAKLSNAVAKMLSNCPPGGISMTVTGDNTKWNECLNPRIFLAMTERITRDSPIWFRDFCSIAPVLFSNKIARLGKGFMITSKTKRLKAQIPCPDLFSIPLERYNEETRAKLKKLKPFFNEEGTASLSPGMMMGMFNMLSTVLGVAALGIKNIGNKEYLWDGLQSSDDFALFVNAKDEETCMEGINDFYRTCKLLGINMSKKKSYCNETGMFEFTSMFYRDGFVSNFAMELPSFGVAGVNESADMAIGMTIIKNNMINNGMGPATAQTAIQLFIADYRYTYKCHRGDSKVEGKRMKIIKELWENTKGRDGLLVADGGPNIYNLRNLHIPEIVLKYNLMDPEYKGRLLHPQNPFVGHLSIEGIKEADITPAHGPVKKMDYDAVSGTHSWRTKRNRSILNTDQRNMILEEQCYAKCCNLFEACFNSASYRKPVGQHSMLEAMAHRLRMDARLDYESGRMSKDDFEKAMAHLGEIGYIGSGSGENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Influenza B virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	289331
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PB2
分子量 formula_weight	90844.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GSGSGSGSGMTLAKIELLKQLLRDNEAKTVLKQTTVDQYNIIRKFNTSRIEKNPSLRMKWAMCSNFPLALTKGDMANRIPLEYKGIQLKTNAEDIGTKGQMCSIAAVTWWNTYGPIGDTEGFERVYESFFLRKMRLDNATWGRITFGPVERVRKRVLLNPLTKEMPPDEASNVIMEILFPKEAGIPRESTWIHRELIKEKREKLKGTMITPIVLAYMLERELVARRRFLPVAGATSAEFIEMLHCLQGENWRQIYHPGGNKLTESRSQSMIVACRKIIRRSIVASNPLELAVEIANKTVIDTEPLKSCLAAIDGGDVACDIIRAALGLKIRQRQRFGRLELKRISGRGFKNDEEILIGNGTIQKIGIWDGEEEFHVRCGECRGILKKSKMKLEKLLINSAKKEDMRDLIILCMVFSQDTRMFQGVRGEINFLNRAGQLLSPMYQLQRYFLNRSNDLFDQWGYEESPKASELHGINESMNASDYTLKGVVVTRNVIDDFSSTETEKVSITKNLSLIKRTGEVIMGANDVSELESQAQLMITYDTPKMWEMGTTKELVQNTYQWVLKNLVTLKAQFLLGKEDMFQWDAFEAFESIIPQKMAGQYSGFARAVLKQMRDQEVMKTDQFIKLLPFCFSPPKLRSNGEPYQFLKLVLKGGGENFIEVRKGSPLFSYNPQTEVLTICGRMMSLKGKIEDEERNRSMGNAVLAGFLVSGKYDPDLGDFKTIEELEKLKPGEKANILLYQGKPVKVVKRKRYSALSNDISQGIKRQRMTVESMGWALSGWSHPQFEKGSGSENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Influenza B virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	289331
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

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晶胞边长 a length_a	199.700 Å
晶胞边长 b length_b	199.700 Å
晶胞边长 c length_c	252.680 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	48.978 Å
R 因子 r_factor	0.2304
R_work r_work	0.2286
R_free r_free	0.2653

Crystal structure of Influenza B polymerase bound to the vRNA promoter (FluB1 form)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wsa__assembly_1__model_1

4wsa__assembly_1__model_1 | I(q)

4wsa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Influenza B polymerase bound to the vRNA promoter (FluB1 form)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA-directed RNA polymerase catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4wsa__assembly_1__model_1

4wsa__assembly_1__model_1 | I(q)

4wsa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)