4wz6

Human CFTR aa389-678 (NBD1), deltaF508 with three solubilizing mutations, bound ATP

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 70.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

Homo sapiens

UniProt P13569

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 389–678 片段:UNP residues 389-678 突变:F429S, F494N, deltaF508, Q637R ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;283 K;0.2M Magnesium Chloride, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 33% PEG 4000 分辨率 2.05 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CFTR_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–290; UniProt 389–678

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4wz6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4wz6
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4wz6
沉积日期 deposition_date2014-11-18
结构标题 titleHuman CFTR aa389-678 (NBD1), deltaF508 with three solubilizing mutations, bound ATP
关键词 keywordsATPase, hydrolase, ATP/ADP binding, ATP binding Protein; ATP binding Protein
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.20
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.38
零角强度 I(0) i015120600.00
分子量 molecular_weight29198.0 kDa
排除体积 excluded_volume36569 ų
包络体积 envelope_volume43668 ų
水化壳体积 shell_volume19150 ų
包络直径 envelope_diameter70.6
壳层 Rg shell_rg25.60
包络 Rg envelope_rg19.99
形状 Rg shape_rg19.43
总 Rg total_rg20.14
总原子数 total_atoms2046
残基数 n_residues258
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax70.2
Rg (实空间) rg_real20.18
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real1.5120e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.8850e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.18
I(0) (倒空间) i0_reciprocal15120000.0000
解质量估计 total_estimate0.8626
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary23.1
偏度 Skewness skewness0.366
峰度 Kurtosis kurtosis-0.194
角度范围 angular_range— – 0.3950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3472000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.743; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.992

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd4wz6a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id4wz6A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)