Escherichia coli K12
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 24 | HYDROXY DIIRON-OXO MOIETY × 24 SULFATE ION × 16 GLYCEROL × 88 water × 24 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | FTNA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 作者链 B； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 作者链 C； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 作者链 D； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 作者链 E； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 作者链 F； PDB构建体 2–165； UniProt 2–165 |
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| 条目编号 entry_id | 4xgs |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-01-02 |
| 结构标题 title | Crystal structure analysis of novel iron uptake mechanism of Gram-negative bacterial ferritin |
| 关键词 keywords | ferritin, Escherichia coli, mutant, ferroxidase center, novel iron uptake route, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 53.41 Å |
| Rg（电子密度） | 52.73 Å |
| 总 Rg | 53.04 Å |
| 原子数 | 33136 |
| 残基数 | 3920 |
| 排除体积 | 588570 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsb1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsc1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsc2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsd1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsd2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4xgse1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgse2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsf1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.1 — Ferritin |
| 结构域编号 domain_id | d4xgsf2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsC00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsD00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsE00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 4xgsF00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |