Escherichia coli (strain K12)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 4 DNA 4 | DNA (28-MER) × 2 ;DNA (5'-D(*AP*TP*AP*TP*CP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*TP*AP*A)-3') ; × 2 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HIPB_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–71； UniProt 4–74 作者链 B； PDB构建体 1–71； UniProt 4–74 作者链 C； PDB构建体 1–71； UniProt 4–74 作者链 D； PDB构建体 1–71； UniProt 4–74 |
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| 条目编号 entry_id | 4yg4 |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-02-25 |
| 结构标题 title | HipB-O1-O1* complex |
| 关键词 keywords | persistence, multidrug resistance, transcription, higher-order complex, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 42.03 Å |
| Rg（电子密度） | 42.53 Å |
| 总 Rg | 42.63 Å |
| 原子数 | 4186 |
| 残基数 | 376 |
| 排除体积 | 68823 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4yg4A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 4yg4B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 4yg4C00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 4yg4D00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |