SAXSdb — 4z61

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phytosulfokine receptor 1

Daucus carota

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Somatic embryogenesis receptor kinase 2 × 1 （Q9XIC7） PTR-ILE-PTR-THR-GLN × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Somatic embryogenesis receptor kinase 2 × 1 （Q9XIC7） PTR-ILE-PTR-THR-GLN × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSKR1_DAUCA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–636； UniProt 24–659 作者链 B； PDB构建体 1–636； UniProt 24–659

Somatic embryogenesis receptor kinase 2

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9XIC7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Phytosulfokine receptor 1 × 1 （Q8LPB4） PTR-ILE-PTR-THR-GLN × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Phytosulfokine receptor 1 × 1 （Q8LPB4） PTR-ILE-PTR-THR-GLN × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SERK2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–216； UniProt 1–216 作者链 D； PDB构建体 1–216； UniProt 1–216

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4z61
沉积日期 deposition_date	2015-04-03
结构标题 title	The plant peptide hormone receptor complex
关键词 keywords	hormone receptor, complex, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4z61__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4z61__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4z61__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.88 Å
Rg（电子密度）	30.86 Å
总 Rg	31.60 Å
原子数	6188
残基数	791
排除体积	110410 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4z61__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4z61__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phytosulfokine receptor 1
分子量 formula_weight	70140.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
突变 mutation	A245E, I355L, E368A, A575S, A613D, V625A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	12670

SQNLTCNSNDLKALEGFMRGLESSIDGWKWNESSSFSSNCCDWVGISCKSSVSLGLDDVNESGRVVELELGRRKLSGKLSESVAKLDQLKVLNLTHNSLSGSIAASLLNLSNLEVLDLSSNDFSGLFPSLINLPSLRVLNVYENSFHGLIPASLCNNLPRIREIDLAMNYFDGSIPVGIGNCSSVEYLGLASNNLSGSIPQELFQLSNLSVLALQNNRLSGALSSKLGKLSNLGRLDISSNKFSGKIPDVFLELNKLWYFSAQSNLFNGEMPRSLSNSRSISLLSLRNNTLSGQIYLNCSAMTNLTSLDLASNSFSGSIPSNLPNCLRLKTINFAKIKFIAQIPESFKNFQSLTSLSFSNSSIQNISSALEILQHCQNLKTLVLTLNFQKEELPSVPSLQFKNLKVLIIASCQLRGTVPQWLSNSPSLQLLDLSWNQLSGTIPPWLGSLNSLFYLDLSNNTFIGEIPHSLTSLQSLVSKENAVEEPSPDFPFFKKKNTNAGGLQYNQPSSFPPMIDLSYNSLNGSIWPEFGDLRQLHVLNLKNNNLSGNIPANLSGMTSLEVLDLSHNNLSGNIPPSLVKLSFLSTFSVAYNKLSGPIPTGVQFQTFPNSSFEGNQGLCGEHASPCHITDQSPHGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Daucus carota
通用名 common_name	Wild carrot
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4039
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Somatic embryogenesis receptor kinase 2
分子量 formula_weight	24441.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MGRKKFEAFGFVCLISLLLLFNSLWLASSNMEGDALHSLRANLVDPNNVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNNENSVIRVDLGNADLSGQLVPQLGQLKNLQYLELYSNNITGPVPSDLGNLTNLVSLDLYLNSFTGPIPDSLGKLFKLRFLRLNNNSLTGPIPMSLTNIMTLQVLDLSNNRLSGSVPDNGSFSLFTPISFANNLDLCGPVTSRPCPGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PTR-ILE-PTR-THR-GLN
分子量 formula_weight	846.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q

YIYTQ

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	17

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	205

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4z61C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4z61D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

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晶胞边长 a length_a	486.185 Å
晶胞边长 b length_b	73.495 Å
晶胞边长 c length_c	67.333 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.84 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.750 Å
最低分辨率 resolution_low	29.870 Å
R 因子 r_factor	0.2000
R_work r_work	0.1960
R_free r_free	0.2620

The plant peptide hormone receptor complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phytosulfokine receptor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Somatic embryogenesis receptor kinase 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4z61__assembly_2__model_1

4z61__assembly_2__model_1 | I(q)

4z61__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

The plant peptide hormone receptor complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phytosulfokine receptor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Somatic embryogenesis receptor kinase 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4z61__assembly_2__model_1

4z61__assembly_2__model_1 | I(q)

4z61__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)