SAXSdb — 4zi3

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADP-ribosylation factor-like protein 3

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Cilia- and flagella-associated protein 36 × 1 （Q8C6E0） Cilia- and flagella-associated protein 36 × 1 （Q8C6E0） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARL3_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 B； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

Cilia- and flagella-associated protein 36

Mus musculus

UniProt Q8C6E0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ADP-ribosylation factor-like protein 3 × 2 （Q9WUL7） PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CFA36_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2, 3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–135； UniProt 1–133 作者链 D； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4zi3
沉积日期 deposition_date	2015-04-27
结构标题 title	BART-like domain of BARTL1/CCDC104 aa1-133 in complex with Arl3FL bound to GppNHp in P1 21 1
关键词 keywords	Arf-like GTPase, GTP-binding, BART-like domain, cilia, hydrolase; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4zi3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4zi3__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4zi3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.86 Å
Rg（电子密度）	27.82 Å
总 Rg	28.47 Å
原子数	4894
残基数	601
排除体积	87355 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4zi3__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ADP-ribosylation factor-like protein 3
分子量 formula_weight	21582.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5335

MGLLSILRKLKSAPDQEVRILLLGLDNAGKTTLLKQLASEDISHITPTQGFNIKSVQSQGFKLNVWDIGGQRKIRPYWRSYFENTDILIYVIDSADRKRFEETGQELTELLEEEKLSCVPVLIFANKQDLLTAAPASEIAEGLNLHTIRDRVWQIQSCSALTGEGVQDGMNWVCKNVNAKKKLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	House Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cilia- and flagella-associated protein 36
分子量 formula_weight	15570.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GPMAAEEEDEVEWVVESIAGFLRGPDWSIPILDFVEQKCEVFDDEEESKLTYTEIHQEYKELVEKLLESYLKEIGINEDQFQEACTSPLAKTRTSQAILQPVLAAEDFTIFKAMMVQKNIEMQLQAIRIIQERNG

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	House Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cilia- and flagella-associated protein 36
分子量 formula_weight	15416.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAEEEDEVEWVVESIAGFLRGPDWSIPILDFVEQKCEVFDDEEESKLTYTEIHQEYKELVEKLLESYLKEIGINEDQFQEACTSPLAKTRTSQAILQPVLAAEDFTIFKAMMVQKNIEMQLQAIRIIQERNG

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	House Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
分子量 formula_weight	522.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	274

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d4zi3a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d4zi3a2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4zi3b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4zi3A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4zi3B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4zi3C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1520 — Adp-ribosylation factor-like protein 2-binding protein fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ADP-ribosylation factor-like 2-binding protein, domain

结构域编号 domain_id	4zi3D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1520 — Adp-ribosylation factor-like protein 2-binding protein fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ADP-ribosylation factor-like 2-binding protein, domain

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晶胞边长 a length_a	51.550 Å
晶胞边长 b length_b	67.720 Å
晶胞边长 c length_c	98.470 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	102.65 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	28.950 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1893
R_free r_free	0.2427

BART-like domain of BARTL1/CCDC104 aa1-133 in complex with Arl3FL bound to GppNHp in P1 21 1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADP-ribosylation factor-like protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cilia- and flagella-associated protein 36

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4zi3__assembly_1__model_1

4zi3__assembly_1__model_1 | I(q)

4zi3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

BART-like domain of BARTL1/CCDC104 aa1-133 in complex with Arl3FL bound to GppNHp in P1 21 1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADP-ribosylation factor-like protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cilia- and flagella-associated protein 36

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4zi3__assembly_1__model_1

4zi3__assembly_1__model_1 | I(q)

4zi3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)