SAXSdb — 4zkb

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemokine binding protein

Orf virus (strain NZ2)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 17–286	片段：UNP residues 17-286	C-C motif chemokine 3 × 1 （P10147） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6, 2.0M ammonium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.323

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4ZKB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4P5I Crystal structure of the chemokine binding protein from orf virus 提交 2014-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–286（270 aa）片段：UNP RESIDUES 17-286	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；CRYSTALLIZATION DROPLETS CONSISTED OF 3 UL ORFV CKBP (12 MG ML-1 IN 20 MM HEPES PH 7.0, 1 MM DTT) PLUS 3.0 UL OF A SOLUTION CONTAINING 100 MM L-ARG IN 1.8 M AMMONIUM CITRATE TRIBASIC PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 289K	分辨率 2.25 Å R-free 0.233
4ZK9 The chemokine binding protein of orf virus complexed with CCL2 提交 2015-04-30	结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–286（270 aa）片段：UNP residues 17-286	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6, 2.0M ammonium citrate	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
4ZKC The chemokine binding protein of orf virus complexed with CCL7 提交 2015-04-30	结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–286（270 aa）片段：UNP residues 17-286	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6, 2.0M ammonium citrate	分辨率 3.15 Å R-free 0.327

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q2F862_ORFV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–270； UniProt 17–286

C-C motif chemokine 3

Homo sapiens

UniProt P10147

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 24–92	片段：UNP residues 24-92	Chemokine binding protein × 1 （Q2F862） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6, 2.0M ammonium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.323

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4ZKB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B50 NMR STRUCTURE OF HUMAN MIP-1A D26A, 10 STRUCTURES 提交 1999-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–92（69 aa）链 B 24–92（69 aa）	突变：D26A 突变：D26A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.5；318 K；离子强度（mmCIF原始值）NO ADDED SALT；压力 1 NMR样品组成 10% H2O/90% D2O	分辨率未提供
1B53 NMR STRUCTURE OF HUMAN MIP-1A D26A, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1999-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–92（69 aa）链 B 24–92（69 aa）	突变：D26A 突变：D26A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.5；318 K；离子强度（mmCIF原始值）NO ADDED SALT；压力 1 NMR样品组成 10% H2O/90% D2O	分辨率未提供
2X69 X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha polymer 提交 2010-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–92（70 aa）片段：RESIDUES 23-92 链 C 23–92（70 aa）片段：RESIDUES 23-92	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.265
2X69 X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha polymer 提交 2010-02-15	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–92（70 aa）片段：RESIDUES 23-92	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.265
2X69 X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha polymer 提交 2010-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–92（70 aa）片段：RESIDUES 23-92 链 E 23–92（70 aa）片段：RESIDUES 23-92	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.265
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 23–92（70 aa）链 R 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 23–92（70 aa）链 F 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 23–92（70 aa）链 P 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 23–92（70 aa）链 D 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 23–92（70 aa）链 J 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–92（70 aa）链 B 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 23–92（70 aa）链 H 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 23–92（70 aa）链 N 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
2X6G X-ray Structure of Macrophage Inflammatory Protein-1 alpha (D27A) 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 23–92（70 aa）链 L 23–92（70 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M NH4AC, 0.1M HEPES (PH7.8), 26% PEG3350	分辨率 2.18 Å R-free 0.286
3FPU The crystallographic structure of the Complex between Evasin-1 and CCL3 提交 2009-01-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–92（69 aa）	突变：A10T	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；291 K；24% (w/v) PEG 3350, 200mM Ammonium sulfate, 100mM HEPES, pH 8.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.76 Å R-free 0.285
3H44 Crystal Structure of Insulin Degrading Enzyme in Complex with macrophage inflammatory protein 1 alpha 提交 2009-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 23–92（70 aa）片段：residues 23-92 链 D 23–92（70 aa）片段：residues 23-92	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 6 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；13% PEGMME 5000, 100mM HEPES, pH 7.0, 10%, Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.237
3H44 Crystal Structure of Insulin Degrading Enzyme in Complex with macrophage inflammatory protein 1 alpha 提交 2009-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 23–92（70 aa）片段：residues 23-92 链 D 23–92（70 aa）片段：residues 23-92	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 6 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；13% PEGMME 5000, 100mM HEPES, pH 7.0, 10%, Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.237
3H44 Crystal Structure of Insulin Degrading Enzyme in Complex with macrophage inflammatory protein 1 alpha 提交 2009-04-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 23–92（70 aa）片段：residues 23-92	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 3 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；13% PEGMME 5000, 100mM HEPES, pH 7.0, 10%, Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.237
3H44 Crystal Structure of Insulin Degrading Enzyme in Complex with macrophage inflammatory protein 1 alpha 提交 2009-04-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–92（70 aa）片段：residues 23-92	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 3 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；13% PEGMME 5000, 100mM HEPES, pH 7.0, 10%, Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.237
3KBX Human macrophage inflammatory protein-1 alpha L3M_V63M 提交 2009-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–92（70 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.257
3KBX Human macrophage inflammatory protein-1 alpha L3M_V63M 提交 2009-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–92（70 aa）链 C 23–92（70 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.257
3KBX Human macrophage inflammatory protein-1 alpha L3M_V63M 提交 2009-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–92（70 aa）链 E 23–92（70 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.257
4RA8 Structure analysis of the Mip1a P8A mutant 提交 2014-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–91（69 aa）片段：UNP residues 23-91	突变：P8A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
4RA8 Structure analysis of the Mip1a P8A mutant 提交 2014-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–91（69 aa）片段：UNP residues 23-91 链 C 23–91（69 aa）片段：UNP residues 23-91	突变：P8A 突变：P8A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
4RA8 Structure analysis of the Mip1a P8A mutant 提交 2014-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–91（69 aa）片段：UNP residues 23-91 链 E 23–91（69 aa）片段：UNP residues 23-91	突变：P8A 突变：P8A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
5COR X-RAY STRUCTURE OF MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-1 ALPHA (CCL3) N-TERMINAL-SWITCH POLYMER 提交 2015-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 23–92（70 aa）链 C 23–92（70 aa）链 E 23–92（70 aa）链 G 23–92（70 aa）链 I 23–92（70 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.16 K；0.01 M Cobalt (II) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 1.0 M 1,6-Hexanediol	分辨率 2.55 Å R-free 0.220
5COR X-RAY STRUCTURE OF MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-1 ALPHA (CCL3) N-TERMINAL-SWITCH POLYMER 提交 2015-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 23–92（70 aa）链 D 23–92（70 aa）链 F 23–92（70 aa）链 H 23–92（70 aa）链 J 23–92（70 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 4 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.16 K；0.01 M Cobalt (II) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 1.0 M 1,6-Hexanediol	分辨率 2.55 Å R-free 0.220
5D65 X-RAY STRUCTURE OF MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-1 ALPHA (CCL3) WITH HEPARIN COMPLEX 提交 2015-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 23–92（70 aa）片段：UNP residues 23-92 链 B 23–92（70 aa）片段：UNP residues 23-92 链 C 23–92（70 aa）片段：UNP residues 23-92 链 D 23–92（70 aa）片段：UNP residues 23-92 链 E 23–92（70 aa）片段：UNP residues 23-92	未记录	BGC beta-D-glucopyranose × 9 CL CHLORIDE ION × 2 GLC alpha-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.1M Tris, pH 7.0; 1.8M (NH4)2SO4;	分辨率 3.10 Å R-free 0.243
7F1Q Cryo-EM structure of the chemokine receptor CCR5 in complex with MIP-1a and Gi 提交 2021-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 24–92（69 aa）	突变：T15R,T112C,G259N	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7F1T Crystal structure of the human chemokine receptor CCR5 in complex with MIP-1a 提交 2021-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–92（69 aa）	突变：T15C,T108C,C150Y,M156A,G255N,A376D,R417A,T427A,K446E	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM HEPES, pH 6.0, 250mM ammonium sulfate, 30% (v/v) PEG 400, 8% (v/v) PPG 400	分辨率 2.60 Å R-free 0.271

共 12 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCL3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–69； UniProt 24–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4zkb
沉积日期 deposition_date	2015-04-30
结构标题 title	The chemokine binding protein of orf virus complexed with CCL3
关键词 keywords	Complex, Orf chemokine binding protein, CCL3, Viral Protein-cytokine complex; Viral Protein/cytokine
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.74 Å
零角强度 I(0) i0	14941700.00
分子量 molecular_weight	27343.0 kDa
排除体积 excluded_volume	33484 Å³
包络体积 envelope_volume	41785 Å³
水化壳体积 shell_volume	18816 Å³
包络直径 envelope_diameter	65.2 Å
壳层 Rg shell_rg	24.84 Å
包络 Rg envelope_rg	19.03 Å
形状 Rg shape_rg	18.78 Å
总 Rg total_rg	19.52 Å
总原子数 total_atoms	1919
残基数 n_residues	267
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	64.3 Å
Rg (实空间) rg_real	19.84 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4940e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.7280e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	14940000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8945
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.224
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.397
角度范围 angular_range	— – 0.4000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2676000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.881; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.981

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chemokine binding protein
分子量 formula_weight	30374.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1919

APLLESQRSNSEEKANFCSTHNDEVYARFRLQMRVGVRHSPLYTPSNMCMLDIEDSVEDIEESTEKEYASTATGEAAGVNVSVALVGEGVSIPFSYIGLGFNPSLEDSYLYVNVSSRAPWVKQTSDLSANGGWGIKQVLEKELLAIQIGCDNQKFPEEPTTTPPSPVTTTLSSTTPDLNEENTENTPTTTGASVDRKRNPADIDFSLLVDPRCVTSVDLHVELRDACIDYKQESPLSLKGKYGDGELVKKEIKDVGKNHNMCSLNLNPGNENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Orf virus (strain NZ2)
通用名 common_name	ORFV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10259
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	C-C motif chemokine 3
分子量 formula_weight	8551.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SLAADTPTACCFSYTSRQIPQNFIADYFETSSQCSKPGVIFLTKRSRQVCADPSEEWVQKYVSDLELSAHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4zkbb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamily	d.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family family	d.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4zkbB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	78.000 Å
晶胞边长 b length_b	78.000 Å
晶胞边长 c length_c	186.020 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	47.440 Å
R 因子 r_factor	0.2704
R_work r_work	0.2677
R_free r_free	0.3230

fit	/app/data/saxs_computation/zk/4zkb/4zkb.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zk/4zkb/4zkb.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zk/4zkb/4zkb.dat

The chemokine binding protein of orf virus complexed with CCL3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemokine binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

C-C motif chemokine 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)