Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | GLYCINAMIDE RIBONUCLEOTIDE × 1 N-({4-[4-(2-amino-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)butyl]thiophen-2-yl}carbonyl)-L-glutamic acid × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PUR2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–204； UniProt 808–1010 |
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| 条目编号 entry_id | 4zyx |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-05-22 |
| 结构标题 title | Human GAR transformylase in complex with GAR and (S)-2-({4-[4-(2-Amino-4-oxo-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]-pyrimidin-6-yl)butyl]thiophene-2-carbonyl}amino)pentanedioic acid (AGF117) |
| 关键词 keywords | gar transformylase, antifolate, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.41 Å |
| Rg（电子密度） | 16.21 Å |
| 总 Rg | 17.23 Å |
| 原子数 | 1545 |
| 残基数 | 200 |
| 排除体积 | 27571 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4zyxa_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.65 — Formyltransferase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.65.1 — Formyltransferase |
| 家族 Family family | c.65.1.1 — Formyltransferase |
| 结构域编号 domain_id | 4zyxA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 170 — Formyl transferase, N-terminal domain |