5a1y

The structure of the COPI coat linkage IV

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1

SACCHAROMYCES CEREVISIAE

UniProt P11076

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ARF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181 作者链 B; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181 作者链 I; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181 作者链 J; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181 作者链 R; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181

COATOMER SUBUNIT ALPHA

MUS MUSCULUS

UniProt Q8CIE6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPA_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–1224; UniProt 1–1224 作者链 K; PDB构建体 1–1224; UniProt 1–1224

;COATOMER SUBUNIT BETA' ;

MUS MUSCULUS

UniProt O55029

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPB2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–905; UniProt 1–905 作者链 L; PDB构建体 1–905; UniProt 1–905

COATOMER SUBUNIT GAMMA-1

MUS MUSCULUS

UniProt Q9QZE5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPG1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–874; UniProt 1–874 作者链 M; PDB构建体 1–874; UniProt 1–874 作者链 V; PDB构建体 1–874; UniProt 1–874

COATOMER SUBUNIT ZETA-1

MUS MUSCULUS

UniProt P61924

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPZ1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–177; UniProt 1–177 作者链 N; PDB构建体 1–177; UniProt 1–177 作者链 W; PDB构建体 1–177; UniProt 1–177

COATOMER SUBUNIT BETA

MUS MUSCULUS

UniProt Q9JIF7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPB_MOUSE
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 16–968; UniProt 1–953 作者链 O; PDB构建体 16–968; UniProt 1–953

COATOMER SUBUNIT DELTA

MUS MUSCULUS

UniProt Q5XJY5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT EPSILON × 2 (O89079) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COPD_MOUSE
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–511; UniProt 1–511 作者链 P; PDB构建体 1–511; UniProt 1–511

COATOMER SUBUNIT EPSILON

MUS MUSCULUS

UniProt O89079

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 21 ADP-RIBOSYLATION FACTOR 1 × 5 (P11076) COATOMER SUBUNIT ALPHA × 2 (Q8CIE6) ;COATOMER SUBUNIT BETA' ; × 2 (O55029) COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 × 3 (Q9QZE5) COATOMER SUBUNIT ZETA-1 × 3 (P61924) COATOMER SUBUNIT BETA × 2 (Q9JIF7) COATOMER SUBUNIT DELTA × 2 (Q5XJY5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 COPE_MOUSE
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–308; UniProt 1–308 作者链 Z; PDB构建体 1–308; UniProt 1–308

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5a1y
沉积日期 deposition_date2015-05-06
结构标题 titleThe structure of the COPI coat linkage IV
关键词 keywordsTRANSPORT PROTEIN, COPI, COATOMER, COATED VESICLES; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5a1y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5a1y__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5a1y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)102.10 Å
总 Rg102.00 Å
原子数39957
残基数9993
排除体积550300 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5a1y__assembly_1__model_1 21-meric (21) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)