5a23

SdsA sulfatase triclinic form

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SDS HYDROLASE SDSA1

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 4	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9I5I9_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–658； UniProt 1–658 作者链 B； PDB构建体 1–658； UniProt 1–658 作者链 C； PDB构建体 1–658； UniProt 1–658 作者链 D； PDB构建体 1–658； UniProt 1–658

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5a23
沉积日期 deposition_date	2015-05-11
结构标题 title	SdsA sulfatase triclinic form
关键词 keywords	HYDROLASE, SDSA SULFATASE, POLYMORPHS; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5a23__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5a23__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5a23__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.37 Å
Rg（电子密度）	31.43 Å
总 Rg	32.16 Å
原子数	9816
残基数	1256
排除体积	173260 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5a23__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5a23__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SDS HYDROLASE SDSA1
分子量 formula_weight	72673.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	19632

MSRLLALLALAPLLAGAAETTAPKPPSAFTVEAQRRVEAELPFADRADFERADRGLIRRPERLLIRNPDGSVAWQLGGYDFLLDGKPRDSINPSLQRQALLNLKYGLFEVAEGIYQVRGFDLANITFIRGDSGWIVVDTLTTPATARAAYELVSRELGERPIRTVIYSHAHADHFGGVRGLVEPQQVASGAVQIIAPAGFMEAAIKENVLAGNAMMRRATYQYGTQLPKGPQGQVDMAIGKGLARGPLSLLAPTRLIEGEGEDLVLDGVPFTFQNTPGTESPAEMNIWLPRQKALLMAENVVGTLHNLYTLRGAEVRDALGWSKYINQALHRFGRQAEVMFAVHNWPRWGNAEIVEVLEKQRDLYGYLHDQTLHLANQGVTIGQVHNRLRLPPSLDQEWYDRGYHGSVSHNARAVLNRYLGYYDGNPATLDPLSPEDSAGRYVEYMGGAERLLEQARASYARGEYRWVVEVVNRLVFAEPDNRAARELQADALEQLGYQAENAGWRNSYLSAAYELRHGVPRDQPTMKAGSADALAAMDTGLLFDYLGVRLDAGAAEGKALSINLRLPDIGENYLLELKNSHLNNLRGVQSEDAGQTVSIDRADLNRLLLKEVSAVRLVFEGKLKSSGNPLLLGQLFGMLGDFDFWFDIVTPAAKSEG

来源 Source

来源生物 organism	PSEUDOMONAS AERUGINOSA
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d5a23a1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.157 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
超家族 Superfamily superfamily	d.157.1 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
家族 Family family	d.157.1.13 — Alkylsulfatase-like

结构域编号 domain_id	d5a23a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.106 — SCP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.106.1 — SCP-like
家族 Family family	d.106.1.3 — Alkylsulfatase C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d5a23b1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.157 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
超家族 Superfamily superfamily	d.157.1 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
家族 Family family	d.157.1.13 — Alkylsulfatase-like

结构域编号 domain_id	d5a23b2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.106 — SCP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.106.1 — SCP-like
家族 Family family	d.106.1.3 — Alkylsulfatase C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d5a23c1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.157 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
超家族 Superfamily superfamily	d.157.1 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
家族 Family family	d.157.1.13 — Alkylsulfatase-like

结构域编号 domain_id	d5a23c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.106 — SCP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.106.1 — SCP-like
家族 Family family	d.106.1.3 — Alkylsulfatase C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d5a23d1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.157 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
超家族 Superfamily superfamily	d.157.1 — Metallo-hydrolase/oxidoreductase
家族 Family family	d.157.1.13 — Alkylsulfatase-like

结构域编号 domain_id	d5a23d2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.106 — SCP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.106.1 — SCP-like
家族 Family family	d.106.1.3 — Alkylsulfatase C-terminal domain-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	5a23A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — Metallo-beta-lactamase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Metallo-beta-lactamase domain

结构域编号 domain_id	5a23A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Alkyl sulfatase, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	5a23A03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SCP2 sterol-binding domain

结构域编号 domain_id	5a23B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — Metallo-beta-lactamase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Metallo-beta-lactamase domain

结构域编号 domain_id	5a23B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Alkyl sulfatase, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	5a23B03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SCP2 sterol-binding domain

结构域编号 domain_id	5a23C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — Metallo-beta-lactamase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Metallo-beta-lactamase domain

结构域编号 domain_id	5a23C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Alkyl sulfatase, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	5a23C03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SCP2 sterol-binding domain

结构域编号 domain_id	5a23D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — Metallo-beta-lactamase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Metallo-beta-lactamase domain

结构域编号 domain_id	5a23D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Alkyl sulfatase, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	5a23D03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SCP2 sterol-binding domain

▶

晶胞边长 a length_a	86.900 Å
晶胞边长 b length_b	86.800 Å
晶胞边长 c length_c	129.030 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	107.59 °
晶胞夹角 β angle_beta	102.96 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	95.59 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.410 Å
最低分辨率 resolution_low	118.770 Å
R 因子 r_factor	0.2562
R_work r_work	0.2535
R_free r_free	0.3070

SdsA sulfatase triclinic form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SDS HYDROLASE SDSA1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5a23__assembly_1__model_1

5a23__assembly_1__model_1 | I(q)

5a23__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

SdsA sulfatase triclinic form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SDS HYDROLASE SDSA1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5a23__assembly_1__model_1

5a23__assembly_1__model_1 | I(q)

5a23__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)