HOMO SAPIENS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 6 | MANGANESE (II) ION × 6 6-(5-oxo-4-(1H-1,2,3-triazol-1-yl)-2,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl)nicotinic acid × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | EGLN1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 7–252； UniProt 181–426 作者链 B； PDB构建体 7–252； UniProt 181–426 作者链 C； PDB构建体 7–252； UniProt 181–426 |
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| 条目编号 entry_id | 5a3u |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-06-03 |
| 结构标题 title | HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2/EGLN1) in complex with 6-(5-oxo-4-(1H- 1,2,3-triazol-1-yl)-2,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl)nicotinic acid |
| 关键词 keywords | ;OXIDOREDUCTASE, NON-HEME, IRON, 2-OXOGLUTARATE, DIOXYGENASE, HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR, HIF, HIF PROLYL HYDROXYLASE DOMAIN 2, PHD2, EGLN, OXYGENASE, HYPOXIA, DNA-BINDING, METAL-BINDING, TRANSCRIPTION, HELIX-LOOP-HELIX-BETA, DSBH, FACIAL TRIAD, ASPARAGINYL/ ASPARTYL HYDROXYLASE, TRANSCRIPTION AND EPIGENETIC REGULATION, SIGNALING, DEVELOPMENT, CELL STRUCTURE, ANKYRIN REPEAT DOMAIN, ARD, BETA-HYDROXYLATION, TRANSCRIPTION ACTIVATOR/INHIBITOR, PHOSPHORYLATION, S-NITROSYLATION ;; OXIDOREDUCTASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 33.07 Å |
| Rg（电子密度） | 32.28 Å |
| 总 Rg | 33.04 Å |
| 原子数 | 9520 |
| 残基数 | 1232 |
| 排除体积 | 167520 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 5a3uA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — q2cbj1_9rhob like domain |
| 结构域编号 domain_id | 5a3uB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — q2cbj1_9rhob like domain |
| 结构域编号 domain_id | 5a3uC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — q2cbj1_9rhob like domain |