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5a8x

Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 53.7 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neutrophil elastase

物种未注明

UniProt P08246

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 2 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 30–247 未记录 alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 IUY ethyl (5R)-5-(4-cyanophenyl)-7-methyl-8-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,5-dihydroimidazo[1,2-a]pyrimidin-4-ium-6-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 2.23 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 5A8X Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1B0F CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEUTROPHIL ELASTASE WITH MDL 101, 146 提交 1998-11-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 SEI 1-{3-METHYL-2-[4-(MORPHOLINE-4-CARBONYL)-BENZOYLAMINO]-BUTYRYL}-PYRROLIDINE-2-CARBOXYLIC ACID (3,3,4,4,4-PENTAFLUORO-1-ISOPROPYL-2-OXO-BUTYL)-AMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00
分辨率 3.00 Å
1H1B Crystal structure of human neutrophil elastase complexed with an inhibitor (GW475151) 提交 2002-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–50（21 aa）
链 A 51–108（58 aa）
链 A 109–110（2 aa）
链 A 111–160（50 aa）
链 A 161–174（14 aa）
链 A 175–183（9 aa）
链 A 184–200（17 aa）
链 A 201–202（2 aa）
链 A 203–247（45 aa）
链 B 30–50（21 aa）
链 B 51–108（58 aa）
链 B 109–110（2 aa）
链 B 111–160（50 aa）
链 B 161–174（14 aa）
链 B 175–183（9 aa）
链 B 184–200（17 aa）
链 B 201–202（2 aa）
链 B 203–247（45 aa）
未记录 151 (2S)-3-METHYL-2-((2R,3S)-3-[(METHYLSULFONYL)AMINO]-1-{[2-(PYRROLIDIN-1-YLMETHYL)-1,3-OXAZOL-4-YL]CARBONYL}PYRROLIDIN-2-YL)BUTANOIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；HNE/GW475151 COMPLEX 10MG/ML IN 10MM NA CITRATE PH 5.0. HANGING DROPS OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND PRECIPITANT. PRECIPITANT 1.1-1.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM CITRATE PH 3.8-4.0, ROOM TEMP.
分辨率 2.00 Å R-free 0.310
1HNE Structure of human neutrophil elastase in complex with a peptide chloromethyl ketone inhibitor at 1.84-angstroms resolution 提交 1989-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.84 Å
1PPF X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF HUMAN LEUKOCYTE ELASTASE (PMN ELASTASE) AND THE THIRD DOMAIN OF THE TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR 提交 1991-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1PPG The refined 2.3 angstroms crystal structure of human leukocyte elastase in a complex with a valine chloromethyl ketone inhibitor 提交 1991-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1PPG The refined 2.3 angstroms crystal structure of human leukocyte elastase in a complex with a valine chloromethyl ketone inhibitor 提交 1991-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
2RG3 Covalent complex structure of elastase 提交 2007-10-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；PEG, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.80 Å
2Z7F Crystal structure of the complex of human neutrophil elastase with 1/2SLPI 提交 2007-08-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 30–247（218 aa） 片段：Peptidase S1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Na-Acetate, 2.0M Na-Formate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.231
3Q76 Structure of human neutrophil elastase (uncomplexed) 提交 2011-01-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.9 M ammonium sulfate, 5% w/v PEG400, 0.1 M MES-NaOH, 20% v/v glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.86 Å R-free 0.214
3Q76 Structure of human neutrophil elastase (uncomplexed) 提交 2011-01-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.9 M ammonium sulfate, 5% w/v PEG400, 0.1 M MES-NaOH, 20% v/v glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.86 Å R-free 0.214
3Q77 Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2011-01-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2HY 2-hydroxyethyl (4R)-4-(4-cyanophenyl)-6-methyl-2-oxo-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.203
4NZL Extracellular proteins of Staphylococcus aureus inhibit the neutrophil serine proteases 提交 2013-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：mature neutrophil elastase
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；298 K；1.0 M succinic acid, 0.1 M Na-HEPES, 1% (w/v) PEG 2000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.207
4WVP Crystal structure of an activity-based probe HNE complex 提交 2014-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH8, 0.8M ammonium sulfate
分辨率 1.63 Å R-free 0.169
4WVP Crystal structure of an activity-based probe HNE complex 提交 2014-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH8, 0.8M ammonium sulfate
分辨率 1.63 Å R-free 0.169
5A09 Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：RESIDUES 30-247
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JJD 2-[(4R)-4-(4-cyanophenyl)-5-ethanoyl-6-methyl-2-oxidanylidene-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-4H-pyrimidin-3-yl]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 28%PEG4000, 0.1MTRIS/HCL AT PH 8.2, 0.7MLICL
分辨率 1.81 Å R-free 0.239
5A0A Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-04-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 JJS 5-[(6R)-5-ethanoyl-4-methyl-2-oxidanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,6-dihydropyrimidin-6-yl]pyridine-2-carbonitrile × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 28%PEG4000,0.1MTRIS/HCL AT PH 8.2,0.7MLICL
分辨率 1.78 Å R-free 0.204
5A0B Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-04-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JJX (4R)-4-(4-cyanophenyl)-6-methyl-2-oxidanylidene-3-[2-oxidanylidene-2-(4-propan-2-ylpiperazin-1-yl)ethyl]-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-4H-pyrimidine-5-carbonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 15% PEG6000, 0.2M AMMONIUM CITRATE
分辨率 2.23 Å R-free 0.218
5A0C Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP RESIDUES 30-247
未记录 JJV (6S)-6-(4-cyano-2-methylsulfonyl-phenyl)-4-methyl-2-oxidanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,6-dihydropyrimidine-5-carbonitrile × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 XPE 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE-1,29-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M MES AT PH6.5,1.2M SODIUMMALONATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
5A0C Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 30–247（218 aa） 片段：UNP RESIDUES 30-247
未记录 JJV (6S)-6-(4-cyano-2-methylsulfonyl-phenyl)-4-methyl-2-oxidanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,6-dihydropyrimidine-5-carbonitrile × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M MES AT PH6.5,1.2M SODIUMMALONATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
5A8Y Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-07-17 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 VBM METHYL {(7R)-6-CYANO-7-(4-CYANOPHENYL)-5-METHYL-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]-4,7-DIHYDRO[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRIMIDIN-2-YL}CARBAMATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.221
5A8Z Crystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor 提交 2015-07-17 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 IUL 4-[(4R)-7-methyl-2,5-bis(oxidanylidene)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4,6,8-tetrahydropyrimido[4,5-d]pyridazin-4-yl]benzenecarbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.236
5ABW Neutrophil elastase inhibitors for the treatment of (cardio)pulmonary diseases 提交 2015-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP RESIDUES 30-247
未记录 WQQ 1-(3-CHLOROPHENYL)-5-(3,5-DIMETHYLISOXAZOL-4-YL)-6-METHYL-N-[4-(METHYLSULFONYL)BENZYL]-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDINE-3-CARBOXAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6E69 Ortho-substituted phenyl sulfonyl fluoride and fluorosulfate as potent elastase inhibitory fragments 提交 2018-07-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 HVP 2-(fluorosulfonyl)benzene-1-sulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.3 M ammonium citrate, pH 5.0, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
6E69 Ortho-substituted phenyl sulfonyl fluoride and fluorosulfate as potent elastase inhibitory fragments 提交 2018-07-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 HVP 2-(fluorosulfonyl)benzene-1-sulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.3 M ammonium citrate, pH 5.0, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
6E69 Ortho-substituted phenyl sulfonyl fluoride and fluorosulfate as potent elastase inhibitory fragments 提交 2018-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 HVP 2-(fluorosulfonyl)benzene-1-sulfonic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.3 M ammonium citrate, pH 5.0, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
6E69 Ortho-substituted phenyl sulfonyl fluoride and fluorosulfate as potent elastase inhibitory fragments 提交 2018-07-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 HVP 2-(fluorosulfonyl)benzene-1-sulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.3 M ammonium citrate, pH 5.0, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
6F5M Crystal structure of highly glycosylated human leukocyte elastase in complex with a thiazolidinedione inhibitor 提交 2017-12-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 CQH 5-[[4-[[(2~{S})-4-methyl-1-oxidanylidene-1-[(2-propylphenyl)amino]pentan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl]-2-oxidanylidene-1,3-thiazol-1-ium-4-olate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HLE from human blood was purchased from SERVA as a lyophilisate in the presence of sodium acetate puffer, pH 5.5. The lyophilisate was disolved in water so that the HLE concentration was 5 mg/ml (170 micromolar) and the acetate concentration 250 millimolar. 120 microliter dissolved HNE lysophilisate was mixed with 6 microliter inhibitor solution (10 mM in DMSO). 1 microliter of the resulting HLE/inhibitor mixture was mixed with 0.5 microliter reservoir solution which was composed of 20 % PEG MME 5000, 0.2 M potassium sulphate. Repeated seeding was necessary to get usable crystals. In the final seeding step the reservoir was composed of 20 % PEG MME 5000, 0.2 M sodium sulphate.
分辨率 2.70 Å R-free 0.234
6F5M Crystal structure of highly glycosylated human leukocyte elastase in complex with a thiazolidinedione inhibitor 提交 2017-12-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 CQH 5-[[4-[[(2~{S})-4-methyl-1-oxidanylidene-1-[(2-propylphenyl)amino]pentan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl]-2-oxidanylidene-1,3-thiazol-1-ium-4-olate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HLE from human blood was purchased from SERVA as a lyophilisate in the presence of sodium acetate puffer, pH 5.5. The lyophilisate was disolved in water so that the HLE concentration was 5 mg/ml (170 micromolar) and the acetate concentration 250 millimolar. 120 microliter dissolved HNE lysophilisate was mixed with 6 microliter inhibitor solution (10 mM in DMSO). 1 microliter of the resulting HLE/inhibitor mixture was mixed with 0.5 microliter reservoir solution which was composed of 20 % PEG MME 5000, 0.2 M potassium sulphate. Repeated seeding was necessary to get usable crystals. In the final seeding step the reservoir was composed of 20 % PEG MME 5000, 0.2 M sodium sulphate.
分辨率 2.70 Å R-free 0.234
6SMA Crystal structure of Human Neutrophil Elastase (HNE) in complex with the 3-Oxo-beta-Sultam inhibitor LMC249 提交 2019-08-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 BR BROMIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293.15 K；24% PEG Smear Broad 0.1 M Tris-HCl pH 7.2 0.1 M KSCN 0.1M NaBr
分辨率 2.59 Å R-free 0.258
6SMA Crystal structure of Human Neutrophil Elastase (HNE) in complex with the 3-Oxo-beta-Sultam inhibitor LMC249 提交 2019-08-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 BR BROMIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293.15 K；24% PEG Smear Broad 0.1 M Tris-HCl pH 7.2 0.1 M KSCN 0.1M NaBr
分辨率 2.59 Å R-free 0.258
6SMA Crystal structure of Human Neutrophil Elastase (HNE) in complex with the 3-Oxo-beta-Sultam inhibitor LMC249 提交 2019-08-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 30–247（218 aa）
未记录 BR BROMIDE ION × 2 LKK 3-[[1-[(4-bromophenyl)methyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methylcarbamoyl]pentane-3-sulfonic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293.15 K；24% PEG Smear Broad 0.1 M Tris-HCl pH 7.2 0.1 M KSCN 0.1M NaBr
分辨率 2.59 Å R-free 0.258
7CBK Structure of Human Neutrophil Elastase Ecotin complex 提交 2020-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–267（267 aa）
链 D 1–267（267 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
7WHU Human Neutrophil Elastase in-complex with Ecotin Peptide 提交 2021-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–267（267 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
分辨率 2.89 Å R-free 0.306
7WHU Human Neutrophil Elastase in-complex with Ecotin Peptide 提交 2021-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–267（267 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
分辨率 2.89 Å R-free 0.306
7WHU Human Neutrophil Elastase in-complex with Ecotin Peptide 提交 2021-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–267（267 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
分辨率 2.89 Å R-free 0.306
7WHU Human Neutrophil Elastase in-complex with Ecotin Peptide 提交 2021-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–267（267 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
分辨率 2.89 Å R-free 0.306
8D4Q Crystal Structure of Neutrophil Elastase Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate (pH 5.2), 12% (w/v) PEG-6000
分辨率 2.20 Å R-free 0.217
8D4Q Crystal Structure of Neutrophil Elastase Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；0.1M sodium citrate (pH 5.2), 12% (w/v) PEG-6000
分辨率 2.20 Å R-free 0.217
8D4U Crystal Structure of Neutrophil Elastase Inhibited by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES (pH 7.5), 0.2M Lithium Sulfate, 25%(w/v) PEG-3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.230
8D4U Crystal Structure of Neutrophil Elastase Inhibited by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES (pH 7.5), 0.2M Lithium Sulfate, 25%(w/v) PEG-3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.230
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000
分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 30–247（218 aa） 片段：UNP residues 30-247
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8G24 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 5.5 提交 2023-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M sodium chloride, 26% w/v PDB3350
分辨率 1.82 Å R-free 0.249
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G26 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 8.5 提交 2023-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M magnesium chloride, 25% PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.238
8QGX Complex between human neutrophil elastase with nanobody NbE201 提交 2023-09-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；The crystals were grown at 20oC using the sitting drop vapor diffusion method. The drop contained 0.2 uL of hNE in complex with NbE201 at a concentration of 15 mg/mL and 0.2 uL of 0.1M HEPES pH7 buffer with 10 per cent (v/v) polyethylene glycol 5000 monomethyl ether and 5 per cent (v/v) tacsimate. The crystals were transferred to a cryoprotectant solution containing 33 per cent (v/v) polyethylene glycol 6000 and 33 per cent (v/v) glycerol before being frozen in liquid nitrogen.
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8VK5 Human Sputum Leucocyte Elastase (uncomplexed) 提交 2024-01-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；296 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.56 Å R-free 0.159
9ASS Crystal Structure of Neutrophil Elastase Inhibited by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.01 M zinc sulfate heptahydrate 0.1M MES (pH 6.5) 25% (v/v) peg-550MME
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
9ASX BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap3 of S. aureus 提交 2024-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate 0.1 M imidazole (pH 6.8) 22% (w/v) peg-2kMME
分辨率 1.96 Å R-free 0.228
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 30–247（218 aa）
链 F 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 30–247（218 aa）
链 C 30–247（218 aa）
链 D 30–247（218 aa）
链 F 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 30–247（218 aa）
链 C 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 30–247（218 aa）
链 F 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9ATU Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase by Eap4 from S. aureus 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 30–247（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.0) 17% (w/v) PEG-10K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
9SI4 Structure of human neutrophil elastase in complex with a 5,8-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrimidin-3(2H)-one inhibitor 提交 2025-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–247（218 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 A1JN2 methyl (5~{R})-5-[4-cyano-2-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethyl]phenyl]-7-methyl-3-oxidanylidene-8-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-2,5-dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrimidine-6-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；18% PEG-3350, 0.2M ammonium citrate
分辨率 1.14 Å R-free 0.155

共 37 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELNE_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5a8x

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5a8x
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5a8x
沉积日期 deposition_date2015-07-17
结构标题 titleCrystal Structure of human neutrophil elastase in complex with a dihydropyrimidone inhibitor
关键词 keywordsTRYPSIN FAMILY FOLD, PROTEASE, HYDROLASE, HYDROLASE- INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.17 Å
零角强度 I(0) i010924900.00
分子量 molecular_weight24238.0 kDa
排除体积 excluded_volume30272 ų
包络体积 envelope_volume33815 ų
水化壳体积 shell_volume17080 ų
包络直径 envelope_diameter52.3 Å
壳层 Rg shell_rg22.73 Å
包络 Rg envelope_rg16.53 Å
形状 Rg shape_rg16.15 Å
总 Rg total_rg17.27 Å
总原子数 total_atoms1701
残基数 n_residues209
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax53.7 Å
Rg (实空间) rg_real17.35 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.17 Å
I(0) (实空间) i0_real1.0920e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1320e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal17.36 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal10930000.0000
解质量估计 total_estimate0.9006
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.2 Å
偏度 Skewness skewness0.124
峰度 Kurtosis kurtosis-0.439
角度范围 angular_range— – 0.4550 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3799000.0000
实空间数据点数 n_real_points76
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.906; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.999
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id5a8xA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id5a8xA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)