HOMO SAPIENS
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ETHYL (5R)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOLE-5-CARBOXYLATE × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | SODIUM ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | BRD1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–135； UniProt 556–688 作者链 B； PDB构建体 3–135； UniProt 556–688 |
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| 条目编号 entry_id | 5amf |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-03-10 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the bromodomain of human surface epitope engineered BRD1A in complex with 3D Consortium fragment Ethyl 4,5,6,7- tetrahydro-1H-indazole-5-carboxylate (SGC - Diamond I04-1 fragment screening) |
| 关键词 keywords | HISTONE-BINDING PROTEIN, BROMODOMAIN, EPIGENETIC, FRAGMENTSCREENING, STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM, SGC, DIAMOND I04-1; HISTONE-BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.74 Å |
| Rg（电子密度） | 15.77 Å |
| 总 Rg | 16.86 Å |
| 原子数 | 970 |
| 残基数 | 121 |
| 排除体积 | 17076 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5amfa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.29 — Bromodomain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.29.2 — Bromodomain |
| 家族 Family family | a.29.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5amfa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5amfA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |
| 结构域编号 domain_id | 5amfB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |