5aw0

Kinetics by X-ray crystallography: Tl+-substitution of bound K+ in the E2.MgF42-.2K+ crystal after 55 min

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Na, K-ATPase alpha subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 1	Na+,K+-ATPase beta subunit × 1 （C4IX13） Phospholemman-like protein × 1 （Q70Q12） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 THALLIUM (I) ION × 3 POTASSIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q4H132_SQUAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1028； UniProt 1–1028

Na+,K+-ATPase beta subunit

物种未注明

UniProt C4IX13

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 1	Na, K-ATPase alpha subunit × 1 （Q4H132） Phospholemman-like protein × 1 （Q70Q12） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 THALLIUM (I) ION × 3 POTASSIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4IX13_SQUAC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305

Phospholemman-like protein

物种未注明

UniProt Q70Q12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 1	Na, K-ATPase alpha subunit × 1 （Q4H132） Na+,K+-ATPase beta subunit × 1 （C4IX13） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 THALLIUM (I) ION × 3 POTASSIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q70Q12_SQUAC
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–74； UniProt 21–94

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5aw0
沉积日期 deposition_date	2015-07-01
结构标题 title	Kinetics by X-ray crystallography: Tl+-substitution of bound K+ in the E2.MgF42-.2K+ crystal after 55 min
关键词 keywords	;MEMBRANE PROTEIN, ION PUMP, ATPASE, K+ BINDING, HALOACID DEHYDROGENEASE SUPERFAMILY, PHOSPHATE ANALOGUE, ATP-BINDING, HYDROLASE, ION TRANSPORT, NUCLEOTIDE-BINDING, PHOSPHOPROTEIN, HYDROLASE-TRANSPORT PROTEIN COMPLEX, KINETICS ;; HYDROLASE/TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5aw0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5aw0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5aw0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.80 Å
Rg（电子密度）	47.11 Å
总 Rg	46.75 Å
原子数	10233
残基数	1299
排除体积	183810 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5aw0__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Na, K-ATPase alpha subunit
分子量 formula_weight	113309.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10235

MGKGTASDKYEPAATSENATKSKKKGKKDKIDKKRDLDELKKEVSMDDHKLSLDELHNKYGTDLTRGLTNARAKEILARDGPNSLTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAATEDEPANDNLYLGVVLSTVVIVTGCFSYYQEAKSSRIMDSFKNMVPQQALVIRDGEKSTINAEFVVAGDLVEVKGGDRIPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFSSENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGVVVYTGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGAAFDKTSATWSALSRIAALCNRAVFQAGQDNVPILKRSVAGDASESALLKCIELCCGSVQGMRDRNPKIVEIPFNSTNKYQLSIHENEKSSESRYLLVMKGAPERILDRCSTILLNGAEEPLKEDMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHFALPEDKYNEGYPFDADEPNFPTTDLCFVGLMAMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETIEDIAARLNIPIGQVNPRDAKACVVHGSDLKDLSTEVLDDILHYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLVFIIGNVPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPMDLIGKRVRWDDRWISDVEDSFGQQWTYEQRKIVEFTCHTSFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGTDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSLIIFLYDEMRRFIIRRSPGGWVEQETYY

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Na+,K+-ATPase beta subunit
分子量 formula_weight	35176.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MARGKSKETDGGWKKFLWDSEKKEFLGRTGSSWFKIFLFYLIFYGCLAGIFIGTIQVLLLTLSDFEPKYQDRVAPPGLSHAPYAIKTEISFSISNPKSYESFVKSMHKLMDLYNESSQAGNSPFEDCSDTPADYIKRGDLDDSQGQKKACRFSRMWLKNCSGLDDTTYGYAEGKPCVVAKLNRIIGFYPKPLKNTTDLPEELQANYNQYVLPLRCAAKREEDREKIGSIEYFGLGGYAGFPLQYYPYYGKRLQKKYLQPLLAIQFTNLTQNMELRIECKVYGENIDYSEKDRFRGRFEVKIEVKS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phospholemman-like protein
分子量 formula_weight	8225.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MDPEGPDNDERFTYDYYRLRVVGLIVAAVLCVIGIIILLAGKCRCKFNQNKRTRSNSGTATAQHLLQPGEATEC

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROMAGNESATE(2-)
分子量 formula_weight	100.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	THALLIUM (I) ION
分子量 formula_weight	204.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	5aw0A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	150 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic transduction domain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic transduction domain A

结构域编号 domain_id	5aw0A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1110 — Calcium-transporting ATPase, transmembrane domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Calcium-transporting ATPase, transmembrane domain

结构域编号 domain_id	5aw0A03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1000 — HAD superfamily/HAD-like

结构域编号 domain_id	5aw0A04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1110 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic domain N
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic domain N

结构域编号 domain_id	5aw0B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	5aw0B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1660 — Na, k-atpase alpha subunit.

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晶胞边长 a length_a	224.203 Å
晶胞边长 b length_b	50.994 Å
晶胞边长 c length_c	164.505 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	104.77 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	14.980 Å
R 因子 r_factor	0.2830
R_work r_work	0.2830
R_free r_free	0.2770

Kinetics by X-ray crystallography: Tl+-substitution of bound K+ in the E2.MgF42-.2K+ crystal after 55 min

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Na, K-ATPase alpha subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Na+,K+-ATPase beta subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phospholemman-like protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5aw0__assembly_1__model_1

5aw0__assembly_1__model_1 | I(q)

5aw0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Kinetics by X-ray crystallography: Tl+-substitution of bound K+ in the E2.MgF42-.2K+ crystal after 55 min

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Na, K-ATPase alpha subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Na+,K+-ATPase beta subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phospholemman-like protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5aw0__assembly_1__model_1

5aw0__assembly_1__model_1 | I(q)

5aw0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)