SAXSdb — 5awg

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FeS cluster assembly protein SufB

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufD × 1 （P77689） Probable ATP-dependent transporter SufC × 2 （P77499） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufD × 1 （P77689） Probable ATP-dependent transporter SufC × 2 （P77499） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SUFB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 E； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495

FeS cluster assembly protein SufD

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P77689

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufB × 1 （P77522） Probable ATP-dependent transporter SufC × 2 （P77499） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufB × 1 （P77522） Probable ATP-dependent transporter SufC × 2 （P77499） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SUFD_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423 作者链 F； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423

Probable ATP-dependent transporter SufC

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P77499

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufB × 1 （P77522） FeS cluster assembly protein SufD × 1 （P77689） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	FeS cluster assembly protein SufB × 1 （P77522） FeS cluster assembly protein SufD × 1 （P77689） MERCURY (II) ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SUFC_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 D； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 G； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 H； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5awg
沉积日期 deposition_date	2015-07-03
结构标题 title	Crystal structure of Hg-bound SufB-SufC-SufD complex from Escherichia coli
关键词 keywords	Iron-Sulfur Clusters, Iron-Sulfur Proteins, ABC proteins, ABC ATPase, TRANSPORT PROTEIN-PROTEIN BINDING complex; TRANSPORT PROTEIN/PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5awg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5awg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5awg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.49 Å
Rg（电子密度）	37.01 Å
总 Rg	37.34 Å
原子数	9443
残基数	1213
排除体积	167410 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5awg__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5awg__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FeS cluster assembly protein SufB
分子量 formula_weight	54800.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E
原子数 atom_count	18808

MSRNTEATDDVKTWTGGPLNYKEGFFTQLATDELAKGINEEVVRAISAKRNEPEWMLEFRLNAYRAWLEMEEPHWLKAHYDKLNYQDYSYYSAPSCGNCDDTCASEPGAVQQTGANAFLSKEVEAAFEQLGVPVREGKEVAVDAIFDSVSVATTYREKLAEQGIIFCSFGEAIHDHPELVRKYLGTVVPGNDNFFAALNAAVASDGTFIYVPKGVRCPMELSTYFRINAEKTGQFERTILVADEDSYVSYIEGCSAPVRDSYQLHAAVVEVIIHKNAEVKYSTVQNWFPGDNNTGGILNFVTKRALCEGENSKMSWTQSETGSAITWKYPSCILRGDNSIGEFYSVALTSGHQQADTGTKMIHIGKNTKSTIISKGISAGHSQNSYRGLVKIMPTATNARNFTQCDSMLIGANCGAHTFPYVECRNNSAQLEHEATTSRIGEDQLFYCLQRGISEEDAISMIVNGFCKDVFSELPLEFAVEAQKLLAISLEHSVG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FeS cluster assembly protein SufD
分子量 formula_weight	46884.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

MAGLPNSSNALQQWHHLFEAEGTKRSPQAQQHLQQLLRTGLPTRKHENWKYTPLEGLINSQFVSIAGEISPQQRDALALTLDSVRLVFVDGRYVPALSDATEGSGYEVSINDDRQGLPDAIQAEVFLHLTESLAQSVTHIAVKRGQRPAKPLLLMHITQGVAGEEVNTAHYRHHLDLAEGAEATVIEHFVSLNDARHFTGARFTINVAANAHLQHIKLAFENPLSHHFAHNDLLLAEDATAFSHSFLLGGAVLRHNTSTQLNGENSTLRINSLAMPVKNEVCDTRTWLEHNKGFCNSRQLHKTIVSDKGRAVFNGLINVAQHAIKTDGQMTNNNLLMGKLAEVDTKPQLEIYADDVKCSHGATVGRIDDEQIFYLRSRGINQQDAQQMIIYAFAAELTEALRDEGLKQQVLARIGQRLPGGAR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Probable ATP-dependent transporter SufC
分子量 formula_weight	27613.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H

MLSIKDLHVSVEDKAILRGLSLDVHPGEVHAIMGPNGSGKSTLSATLAGREDYEVTGGTVEFKGKDLLALSPEDRAGEGIFMAFQYPVEIPGVSNQFFLQTALNAVRSYRGQETLDRFDFQDLMEEKIALLKMPEDLLTRSVNVGFSGGEKKRNDILQMAVLEPELCILDESDSGLDIDALKVVADGVNSLRDGKRSFIIVTHYQRILDYIKPDYVHVLYQGRIVKSGDFTLVKQLEEQGYGWLTEQQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MERCURY (II) ION
分子量 formula_weight	200.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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晶胞边长 a length_a	119.848 Å
晶胞边长 b length_b	139.379 Å
晶胞边长 c length_c	124.414 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	113.55 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.278 Å
最低分辨率 resolution_low	43.942 Å
R 因子 r_factor	0.2973
R_work r_work	0.2948
R_free r_free	0.3404

Crystal structure of Hg-bound SufB-SufC-SufD complex from Escherichia coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FeS cluster assembly protein SufB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FeS cluster assembly protein SufD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable ATP-dependent transporter SufC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5awg__assembly_1__model_1

5awg__assembly_1__model_1 | I(q)

5awg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Hg-bound SufB-SufC-SufD complex from Escherichia coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FeS cluster assembly protein SufB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

FeS cluster assembly protein SufD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable ATP-dependent transporter SufC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5awg__assembly_1__model_1

5awg__assembly_1__model_1 | I(q)

5awg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)