SAXSdb — 5c0s

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

Influenza A virus, Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B, Enterobacteria phage T4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	CR6261 antibody heavy chain × 3 CR6261 antibody light chain × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D9IEJ2_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 263–290； UniProt 458–485

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

Influenza A virus, Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B, Enterobacteria phage T4

UniProt P04578

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	CR6261 antibody heavy chain × 3 CR6261 antibody light chain × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ENV_HV1H2
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 113–139； UniProt 628–654 作者链 A； PDB构建体 146–177； UniProt 546–577

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

Influenza A virus, Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B, Enterobacteria phage T4

UniProt Q6WG00

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	CR6261 antibody heavy chain × 3 CR6261 antibody light chain × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6WG00_9INFA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–32； UniProt 18–49 作者链 A； PDB构建体 36–110； UniProt 328–402 作者链 A； PDB构建体 178–259； UniProt 436–517

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5c0s
沉积日期 deposition_date	2015-06-12
结构标题 title	Crystal structure of a generation 4 influenza hemagglutinin stabilized stem in complex with the broadly neutralizing antibody CR6261
关键词 keywords	Hemagglutinin, immunogen, trimer, complex, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5c0s__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5c0s__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5c0s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.29 Å
Rg（电子密度）	54.32 Å
总 Rg	54.34 Å
原子数	15474
残基数	2025
排除体积	273380 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5c0s__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein
分子量 formula_weight	34211.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5158

DTICIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLGSGLRMVTGLRNIPQRETRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADQKSTQNAINGITNKVNSVIEKMGGDPEWDREINNYTSIIYSLIEESQNQQENGTGGGSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQTYNAELLVLLENERTLDFHDSNVKNLYEKVKSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCNNECMESVKNGTYDYPKYSEESKLNREKIDPGSGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLSGRLVPRGSGHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus, Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B, Enterobacteria phage T4
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CR6261 antibody heavy chain
分子量 formula_weight	23981.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKASGGPFRSYAISWVRQAPGQGPEWMGGIIPIFGTTKYAPKFQGRVTITADDFAGTVYMELSSLRSEDTAMYYCAKHMGYQVRETMDVWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CR6261 antibody light chain
分子量 formula_weight	23257.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

QSVLTQPPSVSAAPGQKVTISCSGSSSNIGNDYVSWYQQLPGTAPKLLIYDNNKRPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEANYYCATWDRRPTAYVVFGGGTKLTVLGAAAGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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晶胞边长 a length_a	101.649 Å
晶胞边长 b length_b	101.649 Å
晶胞边长 c length_c	186.022 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	9

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.300 Å
最低分辨率 resolution_low	27.060 Å
R 因子 r_factor	0.2410
R_work r_work	0.2380
R_free r_free	0.3100

Crystal structure of a generation 4 influenza hemagglutinin stabilized stem in complex with the broadly neutralizing antibody CR6261

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5c0s__assembly_1__model_1

5c0s__assembly_1__model_1 | I(q)

5c0s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a generation 4 influenza hemagglutinin stabilized stem in complex with the broadly neutralizing antibody CR6261

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hemagglutinin, Envelope glycoprotein, Fibritin fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5c0s__assembly_1__model_1

5c0s__assembly_1__model_1 | I(q)

5c0s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)