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5d39

Transcription factor-DNA complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Signal transducer and activator of transcription 6

Homo sapiens

UniProt P42226

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 4 DNA 4 ;DNA (5'-D(P*TP*CP*TP*GP*TP*CP*TP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*CP*CP*AP*T)-3') ; × 2 ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*AP*GP*AP*CP*AP*GP*A)-3') ; × 2 water × 8 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*CP*TP*GP*TP*CP*TP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*CP*CP*AP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*AP*GP*AP*CP*AP*GP*A)-3') ; × 1 water × 4 与全部聚合物一致
3 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*CP*TP*GP*TP*CP*TP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*CP*CP*AP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*AP*GP*AP*CP*AP*GP*A)-3') ; × 1 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
9big

共 1 个 assembly

同源二聚体
4y5u

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1oj5 4y5w 4y5w 5d39 5d39 5d39 5nwm 5nwx

共 8 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 STAT6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–539； UniProt 123–658 作者链 B； PDB构建体 4–539； UniProt 123–658 作者链 C； PDB构建体 4–539； UniProt 123–658 作者链 D； PDB构建体 4–539； UniProt 123–658

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5d39
沉积日期 deposition_date2015-08-06
结构标题 titleTranscription factor-DNA complex
关键词 keywordsregulation, DNA binding, innate immune, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5d39__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5d39__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5d39__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）54.33 Å
Rg（电子密度）55.58 Å
总 Rg55.50 Å
原子数17191
残基数2024
排除体积302600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5d39__assembly_1__model_1 octameric （8） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5d39__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 5d39__assembly_3__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)