TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 P; UniProt 392–398 | 片段:UNP residues 392-398 | Hyaluronidase × 1 (D1CDN2) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;38% PEG-4000, 400 mM sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl | 分辨率 2.06 Å R-free 0.236 |
| 2 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 Q; UniProt 392–398 | 片段:UNP residues 392-398 | Hyaluronidase × 1 (D1CDN2) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;38% PEG-4000, 400 mM sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl | 分辨率 2.06 Å R-free 0.236 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5DIY | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2J4O Structure of TAB1 提交 2006-09-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–401(401 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-401
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;TAB1, WAS CONCENTRATED TO 14.1 MG/ML, AND CRYSTALLISED BY VAPOUR DIFFUSION. 1 MICROL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 1 MICROL OF MOTHER LIQUOR (100 MM HEPES PH 7.5, 1.5 M LI2SO4) AND 0.25 MICROL 100 MM BACL2. HEXAGONALLY-SHAPED CRYSTALS APPEARED WITHIN THREE DAYS.
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.236 |
| 2POM TAB1 with manganese ion 提交 2007-04-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–370(370 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;1.5M Li2SO4, 0.1M Hepes, 1mM MnCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.233 |
| 2POP The Crystal Structure of TAB1 and BIR1 complex 提交 2007-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–132(132 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370
链 A
152–370(219 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370
链 C
1–132(132 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370
链 C
152–370(219 aa)
片段:N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370
|
突变:Residues 133-151 were deleted 突变:Residues 133-151 were deleted 突变:Residues 133-151 were deleted 突变:Residues 133-151 were deleted | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;295 K;8.5% PEG8000, 4% ethylene glycol, 100mM Hepes, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.254 |
| 2YDS CpOGA D298N in complex with TAB1-derived O-GlcNAc peptide 提交 2011-03-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 T
392–398(7 aa)
片段:RESIDUES 392-398
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 19 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;pH 8.5
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.238 |
| 2YIY Crystal structure of compound 8 bound to TAK1-TAB 提交 2011-05-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–497(30 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 31-303, C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 468-497
|
未记录 | YIY (1E)-1-[5-TERT-BUTYL-2-(3-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-3-YLIDENE]-3-(4-PYRIDIN-3-YLOXYPHENYL)UREA × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;0.1 M TRIS-HCL PH 7.5, 0.6 M SODIUM CITRATE, 0.2 M NACL, 10 MM DTT.
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.245 |
| 4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
389–401(13 aa)
片段:RESIDUES 389-401
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9.3;1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.272 |
| 4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
389–401(13 aa)
片段:RESIDUES 389-401
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9.3;1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.272 |
| 4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
389–401(13 aa)
片段:RESIDUES 389-401
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9.3;1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.272 |
| 4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
389–401(13 aa)
片段:RESIDUES 389-401
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9.3;1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.272 |
| 4GS6 Irreversible Inhibition of TAK1 Kinase by 5Z-7-Oxozeaenol 提交 2012-08-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 1FM (3S,5Z,8S,9S,11E)-8,9,16-trihydroxy-14-methoxy-3-methyl-3,4,9,10-tetrahydro-1H-2-benzoxacyclotetradecine-1,7(8H)-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.55-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.245 |
| 4KA3 Structure of MAP kinase in complex with a docking peptide 提交 2013-04-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
395–415(21 aa)
片段:UNP residues 395-415
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.86;294 K;100mM Hepes, 22% polyacrylic acid 5100, pH 7.86, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.267 |
| 4L3P Crystal Structure of 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:SEE REMARK 999
|
未记录 | 1UH 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.268 |
| 4L52 Crystal Structure of 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethan-1-one bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–496(29 aa)
片段:SEE REMARK 999
|
未记录 | 1UL 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.230 |
| 4L53 Crystal Structure of (1R,4R)-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexan-1-ol bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–496(29 aa)
片段:SEE REMARK 999
|
未记录 | 1UO trans-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.238 |
| 4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)
|
未记录 | NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.207 |
| 4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)
|
未记录 | NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.207 |
| 5E7R Crystal structure of TL10-81 bound to TAK1-TAB1 提交 2015-10-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP O43318 residues 31-303, UNP Q15750 residues 468-504
|
未记录 | 5KW 2-chloro-N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.65-0.75 M sodium citrate pH 7.0, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.0, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.246 |
| 5GJD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 2 提交 2016-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6V3 1-(4-((1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)oxy)phenyl)-3-(5-(4-methylpiperazin-1-yl)naphthalen-2-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.245 |
| 5GJF Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 3 提交 2016-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6V4 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(3-phenylureido)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;1.94M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.234 |
| 5GJG Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 4 提交 2016-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6V5 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(phenylcarbamoyl)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;294 K;1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.221 |
| 5J7S Crystal structure of SM1-71 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504
|
未记录 | 6H3 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine; Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor.
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.240 |
| 5J8I Crystal structure of TL11-113 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504
|
未记录 | 6H4 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine;
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 5J9L Crystal structure of CPT1691 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–497(30 aa)
|
未记录 | 6HF N-(4-((2-((4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)oxy)phenyl)acrylamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.243 |
| 5JGA Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 11c 提交 2016-04-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6KC N-[5-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)[1,1'-biphenyl]-2-yl]-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;294 K;1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 5JGB Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 10 提交 2016-04-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6JV N-(2-methoxy-4-{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]carbamoyl}phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 5JGD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 12 提交 2016-04-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
片段:UNP residues 31-303,UNP residues 468-504
|
未记录 | 6KD N-(2-isopropoxy-3-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.215 |
| 5JH6 Crystal structure of TL10-92 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | T92 2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl prop-2-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.253 |
| 5JK3 Crystal structure of TL11-128 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | 6L4 ~{N}-[2-[5-chloranyl-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrimidin-4-yl]oxyphenyl]prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.266 |
| 5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–504(504 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–504(504 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–504(504 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–504(504 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 5O90 Crystal structure of a P38alpha T185G mutant in complex with TAB1 peptide. 提交 2017-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
386–414(29 aa)
片段:UNP residues 386-414
|
未记录 | SB4 4-(4-FLUOROPHENYL)-1-(4-PIPERIDINYL)-5-(2-AMINO-4-PYRIMIDINYL)-IMIDAZOLE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;20% PEG3350
0.2M Na/K Tartrate
0.1M pH7.0 Bis-Tris Propane
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分辨率 2.49 Å R-free 0.275 |
| 5V5N Crystal structure of Takinib bound to TAK1 提交 2017-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–497(30 aa)
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未记录 | EDH N~1~-(1-propyl-1,3-dihydro-2H-benzimidazol-2-ylidene)benzene-1,3-dicarboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 10mM DTT. 20% Ethyleneglycol as cryoprotectant.
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分辨率 2.01 Å R-free 0.222 |
| 7NTH Structure of TAK1 in complex with compound 54 提交 2021-03-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 URW 2-[[5-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl-[(2~{R})-1-(methylamino)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]carbamoyl]-1~{H}-imidazol-2-yl]carbonyl]isoindole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;293 K;0.30 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.6
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分辨率 1.97 Å R-free 0.225 |
| 7NTI Structure of TAK1 in complex with compound 22 提交 2021-03-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 UWZ ~{N}-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl]-~{N}-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-2-pyrrolidin-1-ylcarbonyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.9;293 K;0.60 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.9
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分辨率 1.98 Å R-free 0.249 |
| 8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
468–504(37 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
468–504(37 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
468–504(37 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350
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分辨率 2.05 Å R-free 0.258 |
| 8XI8 The Crystal Structure of TAB1 from Biortus. 提交 2023-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–370(370 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2M Li2SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 16% PEG 4000
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分辨率 3.35 Å R-free 0.252 |
| 9FPD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with compound S1 提交 2024-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
468–504(37 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | A1IED 6-[5-[6-(4-oxidanylcyclohexyl)oxy-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl]-1,2-oxazol-3-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Tris HCl pH 7.25, 0.9 M Tri-sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 10 mM DTT
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分辨率 2.40 Å R-free 0.222 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TAB1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 P; PDB构建体 1–7; UniProt 392–398 作者链 Q; PDB构建体 1–7; UniProt 392–398 |