Escherichia coli K12
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 6 DNA 2 | DNA (36-MER) × 1 DNA (36-MER) × 1 CRISPR-associated endoribonuclease Cas2 × 2 （P45956） MAGNESIUM ION × 2 water × 8 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | CAS1_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 B； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 C； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 D； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 |
Escherichia coli K12
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 6 DNA 2 | CRISPR-associated endonuclease Cas1 × 4 （Q46896） DNA (36-MER) × 1 DNA (36-MER) × 1 MAGNESIUM ION × 2 water × 8 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | CAS2_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 4 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 F； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 |
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| 条目编号 entry_id | 5dqz |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-09-15 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of Cas-DNA-PAM complex |
| 关键词 keywords | protein-DNA complex, HYDROLASE-DNA complex; HYDROLASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 41.56 Å |
| Rg（电子密度） | 41.51 Å |
| 总 Rg | 41.74 Å |
| 原子数 | 11596 |
| 残基数 | 1395 |
| 排除体积 | 203870 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 100 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 920 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 100 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzB02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 920 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzC01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 100 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzC02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 920 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzD01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 100 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 5dqzD02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 920 — CRISPR-associated endonuclease Cas1, C-terminal domain |