Norwalk virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CHLORIDE ION × 1 ;(phenylmethyl) ~{N}-[(8~{S},11~{S},14~{S})-8-(hydroxymethyl)-11-(2-methylpropyl)-5,10,13-tris(oxidanylidene)-1,4,9,12,17,18-hexazabicyclo[14.2.1]nonadeca-16(19),17-dien-14-yl]carbamate ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POLG_NVN68 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 8–188； UniProt 1101–1281 |
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| 条目编号 entry_id | 5e0g |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-09-28 |
| 结构标题 title | 1.20 A resolution structure of Norovirus 3CL protease in complex with a triazole-based macrocyclic (17-mer) inhibitor |
| 关键词 keywords | ;protease, norovirus, norwalk virus, antiviral inhibitors, triazole macrocyclic inhibitor, cell permeable, PROTEASE-PROTEASE INHIBITOR complex ;; PROTEASE/PROTEASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.04 Å |
| Rg（电子密度） | 14.91 Å |
| 总 Rg | 16.07 Å |
| 原子数 | 1296 |
| 残基数 | 173 |
| 排除体积 | 23071 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5e0ga1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.47 — Trypsin-like serine proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.47.1 — Trypsin-like serine proteases |
| 家族 Family family | b.47.1.4 — Viral cysteine protease of trypsin fold |
| 结构域编号 domain_id | d5e0ga2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5e0gA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Thrombin, subunit H |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Trypsin-like serine proteases |
| 结构域编号 domain_id | 5e0gA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Thrombin, subunit H |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Trypsin-like serine proteases |