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5egu

FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bromodomain-containing protein 4

Homo sapiens

UniProt O60885

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2i8n 2oss 2ouo 2yel 2yem 2yem 3mxf 3p5o 3svf 3svg 3u5j 3u5k

共 655 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
5khm 6djc 7dhs 7l9m 7la9 7la9 7la9 7mr5 7mr6 7mr7

共 10 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
8wxy 8wy3 8wy7

共 3 个 assembly

异源或核酸复合物
2lsp 2mjv 2n3k 2ncz 2nd0 2nd1 2nnu 2nnu 3uvw 3uvx 3uvy 3uw9

共 111 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BRD4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–127； UniProt 44–168 作者链 B； PDB构建体 3–127； UniProt 44–168 作者链 C； PDB构建体 3–127； UniProt 44–168 作者链 D； PDB构建体 3–127； UniProt 44–168

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5egu
沉积日期 deposition_date2015-10-27
结构标题 titleFIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione
关键词 keywordsINHIBITOR, HISTONE, EPIGENETIC READER, BROMODOMAIN, BRD4, Brd4_BD1, Brd4_BD1 06-NOV, transcription; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5egu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5egu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5egu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）15.57 Å
Rg（电子密度）14.43 Å
总 Rg15.62 Å
原子数1042
残基数121
排除体积18741 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5egu__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5egu__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 5egu__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 5egu__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd5egua_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamilya.29.2 — Bromodomain
家族 Family familya.29.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5egub_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamilya.29.2 — Bromodomain
家族 Family familya.29.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5eguc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamilya.29.2 — Bromodomain
家族 Family familya.29.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5egud1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamilya.29.2 — Bromodomain
家族 Family familya.29.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5egud2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id5eguA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bromodomain-like
结构域编号 domain_id5eguB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bromodomain-like
结构域编号 domain_id5eguC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bromodomain-like
结构域编号 domain_id5eguD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bromodomain-like
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7. 引用文献 (1)