5eps

Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED10

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 52.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peregrin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 627–740	片段：UNP residues 625-740	5QX 1-methyl-3,4-dihydroquinoxalin-2-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.47 Å R-free 0.198

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5EPS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2RS9 Solution structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with histone H4K5ac peptide 提交 2011-12-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 633–740（108 aa）片段：Bromodomain, UNP residues 633-740	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM H4K5ac-1, 0.54 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bromodomain-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2X35 Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-01-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG 3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 10 MM NACL	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
2X4W Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：RESIDUES 1076-1205	未记录	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；4M SODIUM FORMATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL	分辨率 1.50 Å R-free 0.216
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
3L42 PWWP domain of human bromodomain and PHD finger containing protein 1 提交 2009-12-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：UNP residues 1079-1207	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；3.5M sodium formate, 0.1M TRIS-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.1M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 1.30 Å R-free 0.233
3MO8 PWWP Domain of Human Bromodomain and PHD finger-containing protein 1 In Complex with Trimethylated H3K36 Peptide 提交 2010-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：UNP residues 1079-1207	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；3.5M sodium formate, 0.1M Tris-HCl pH8.5, H3K36me3 peptide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.69 Å R-free 0.207
4LC2 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1B 提交 2013-06-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：unp residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG3350 0.1 M bis tris propane, 10% ethylene glycol 0.15 M sodium nitrate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.65 Å R-free 0.220
4QYD Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H4K12ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% w/v polyethylene glycol (PEG) 6,000, 5% v/v (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.94 Å R-free 0.213
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4UYE BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1- yl)-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2-methoxybenzamide 提交 2014-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 622-738	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 9F9 N-[1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1-yl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 10% MORPHEUS DIVALENTS MPD_P1K_P3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.201
4UYE BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1- yl)-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2-methoxybenzamide 提交 2014-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 622-738	未记录	9F9 N-[1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1-yl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 10% MORPHEUS DIVALENTS MPD_P1K_P3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.201
5C6S Human Bromodomain and PHD Finger Containing 1, PWWP domain in complex with XST005904a 提交 2015-06-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：PWWP domain (UNP residues 1079-1207)	未记录	4K8 isoquinoline-3-carboxylic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M LiSO4, 0.1M HEPES pH7.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.217
5C7N Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with Bromosporine 提交 2015-06-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：residues 626-740	未记录	BMF Bromosporine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M sodium acetate, 0.15 M sodium nitrate, pH 5.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5C85 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED1 提交 2015-06-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 4YO 6-bromo-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH6.5, 0.2 M sodium nitrate, 20%PEG33500	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
5C87 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED2 提交 2015-06-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 4YS isoquinolin-1(2H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH6.5, 0.2 M sodium nitrate, 20%PEG33500	分辨率 1.55 Å R-free 0.198
5C89 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with 917 提交 2015-06-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	4YT 1-ethyl-8-methoxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M sodium acetate, pH 5.5, 0.15 M potassium thiocynate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.200
5D7X Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with XZ08 提交 2015-08-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 XZ8 4-(1-acetyl-1H-indol-3-yl)-5-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane, pH6.5, 0.2M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.35 Å R-free 0.176
5DY7 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED4 提交 2015-09-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5GT 7-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.69 Å R-free 0.204
5DYA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED5 提交 2015-09-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 625–740（116 aa）片段：UNP residues 625-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 5GV (2R)-2-ethyl-3-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-6-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.214
5DYC Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED6 提交 2015-09-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 625–740（116 aa）片段：UNP residues 625-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 5GU 7-bromo-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.235
5E3D Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED7 提交 2015-10-02	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5JL 2,8-dithioxo-1,2,3,7,8,9-hexahydro-6H-purin-6-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.71 Å R-free 0.222
5E3G Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED8 提交 2015-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5JQ 2-thioxo-2,3,7,9-tetrahydro-1H-purine-6,8-dione × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.205
5EM3 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED9 提交 2015-11-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5Q0 quinolin-5-ol × 2 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium-Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.188
5EPR Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED11 提交 2015-11-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5QY (3~{S})-3-methyl-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxalin-2-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.220
5EQ1 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED12 提交 2015-11-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	BEA 5-METHYL-1,2,4-TRIAZOLO[3,4-B]BENZOTHIAZOLE × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.194
5ERC X-ray crystal structure of BRPF1 PZP domain 提交 2015-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 274–450（177 aa）片段：PZP domain (UNP residues 274-450)	未记录	ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2 M Calcium acetate, 0.1 M Imidazole pH 8.0, 10% PEG8000	分辨率 2.05 Å R-free 0.193
5ETB Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED13 提交 2015-11-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5RO 1-(7-methyl-1~{H}-indol-3-yl)ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.33 Å R-free 0.187
5ETD Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED14 提交 2015-11-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5RN 1-(1~{H}-indol-3-yl)ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.187
5EV9 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED15 提交 2015-11-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SB ~{N}-[5-(1~{H}-pyrazol-4-yl)quinolin-8-yl]ethanamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.221
5EVA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED16 提交 2015-11-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5S9 ~{N}-[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-2-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.198
5EWC Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED17 提交 2015-11-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SJ ethyl (2~{R})-2-methyl-3-oxidanylidene-2,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-6-carboxylate × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.211
5EWD Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED18 提交 2015-11-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SH 4-phenylpyridine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.58 Å R-free 0.226
5EWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED19 提交 2015-11-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SG isoquinolin-5-ol × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.63 Å R-free 0.213
5EWV Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED20 提交 2015-11-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SN 1,5-dimethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoline × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.67 Å R-free 0.221
5EWW Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED21 提交 2015-11-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740#	未记录	5SK ~{N}-[(2~{R})-butan-2-yl]-1-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4-amine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.73 Å R-free 0.210
5FFV Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H3K14ac histone peptide 提交 2015-12-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206
5FFV Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H3K14ac histone peptide 提交 2015-12-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206
5FFW Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H4K5acK8ac histone peptide 提交 2015-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740 链 B 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.2 M NaCl, 25% PEG3350, 0.1 M Hepes pH 7.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.243
5FFY Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with a benzimidazole ligand 提交 2015-12-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5XD 4-ethyl-~{N}-(6-methoxy-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；0.1 M bis tris propane pH 9, 10% ethylene glycol, 0.15 M sodium nitrate	分辨率 1.55 Å R-free 0.213
5FG4 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with OF-1 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5XE 4-bromanyl-~{N}-(6-methoxy-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl)-2-methyl-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277.15 K；25% PEG3350, 0.1M bis-tris propane pH 7.4, 5% ethyleneglycol, 0.15M sodium nitrate	分辨率 1.65 Å R-free 0.254
5FG5 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with PFI-4 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5XF ~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-6-pyrrolidin-1-yl-benzimidazol-5-yl)-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% PEG3350, 0.25 M sodium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
5FG5 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with PFI-4 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	5XF ~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-6-pyrrolidin-1-yl-benzimidazol-5-yl)-2-methoxy-benzamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% PEG3350, 0.25 M sodium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4S BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-N- ethyl-2-methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 624–738（115 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 624-738	未记录	8VI N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-N-ethyl-2-methoxy-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1M MORPHEUS BUFFER 1, PH 6.5 37.5% MPD_P1K_P3350 10% MORPHEUS NITRATE-PHOSPHATE-SULPHATE	分辨率 1.60 Å R-free 0.194
5MWG Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ091 提交 2017-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	WGX ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.227
5MWG Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ091 提交 2017-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	WGX ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.227
5MWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ089 提交 2017-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	UWX ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.226
5MWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ089 提交 2017-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	UWX ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.226
5MWZ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ073 提交 2017-01-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	KGU ~{N}-[1,4-diethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH7.4, 25% PEG3350, 5% EG, 0.15 M NaNO3	分辨率 1.25 Å R-free 0.181
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5O4S Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ135 提交 2017-05-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9KW ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5O4S Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ135 提交 2017-05-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	9KW ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5O4T Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ061 提交 2017-05-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9KT 1,4-dimethylquinoxaline-2,3-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.212
5O55 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ047 提交 2017-05-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 9L5 ~{N}-[(1~{S})-1-(1,5-dimethylpyrazol-4-yl)ethyl]-1-ethyl-3-methyl-2-oxidanylidene-quinoxaline-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
5O5A Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ032 提交 2017-06-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 9LN 1-ethyl-~{N}-methyl-2,3-bis(oxidanylidene)-~{N}-[(1-phenylpyrazol-4-yl)methyl]-4~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.202
5O5F Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ038 提交 2017-06-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9LT 1-ethyl-~{N}-[(~{R})-(3-fluorophenyl)-(1-methylimidazol-2-yl)methyl]-2,3-bis(oxidanylidene)-4~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.30 Å R-free 0.188
5O5H Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ053 提交 2017-06-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9LK ~{N}-[6-(4-chloranylphenoxy)pyridin-3-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 2 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.235
5OV8 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ097 提交 2017-08-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	AXN ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-pyrrolidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
5OV8 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ097 提交 2017-08-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	AXN ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-pyrrolidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 626–740（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWB Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with DSPBP1004 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 AYW 4-methyl-6-oxidanyl-1-benzofuran-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.204
5OWE Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with DSPBP1010 提交 2017-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0E 1,3-bis(oxidanyl)benzo[c]chromen-6-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.213
5T4U Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with a quinolinone ligand 提交 2016-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 12Q 1-METHYLQUINOLIN-2(1H)-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；20 % PEG3350, 0.2 M ammonium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.231
5T4V Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-48 ligand 提交 2016-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	N48 4-cyano-N-(7-methoxy-1,4-dimethyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.1 m bis-tris propane pH 8.5, 0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol	分辨率 1.65 Å R-free 0.250
6EKQ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain complexed with BZ054 in space group C2 提交 2017-09-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.182
6EKQ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain complexed with BZ054 in space group C2 提交 2017-09-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.182
6U04 Crystal structure of human BRPF1 PZP bound to histone H3 tail 提交 2019-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 271–454（184 aa）	未记录	PR PRASEODYMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 40% (v/v) PEG400, and 0.01M Praseodymium(III) acetate hydrate	分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7C4I High resolution structure of BRPF1 Bromo Domain from Biortus 提交 2020-05-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium fluoride, 20 %(w/v) PEG 3350	分辨率 1.37 Å R-free 0.194
8QAZ Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 3 提交 2023-08-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	QA5 2-[4-[4-ethanoyl-5-methyl-3-(3-methylbutyl)-1~{H}-pyrrol-2-yl]-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350, 5% ethylene glycol	分辨率 1.40 Å R-free 0.196
8QB0 Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 2 提交 2023-08-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	Q9U 2-[4-(3,6,6-trimethyl-4-oxidanylidene-5,7-dihydro-2~{H}-isoindol-1-yl)-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350, 5% ethylene glycol	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
8QB2 Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 79 提交 2023-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	GKI 1-[2-methyl-4-(3-methylbutyl)-5-(2-piperazin-1-yl-1,3-thiazol-4-yl)-1~{H}-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350	分辨率 1.42 Å R-free 0.196

共 64 个其他 PDB 条目、94 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BRPF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–116； UniProt 627–740

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5eps
沉积日期 deposition_date	2015-11-12
结构标题 title	Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED10
关键词 keywords	;Bromodomain and PHD finger-containing protein 1(BRPF1), monocytic leukemia zinc-finger (MOZ), Inhibitor, transcription, DNA binding protein ;; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	15.65 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.67 Å
零角强度 I(0) i0	3536340.00
分子量 molecular_weight	13479.0 kDa
排除体积 excluded_volume	16941 Å³
包络体积 envelope_volume	19290 Å³
水化壳体积 shell_volume	11586 Å³
包络直径 envelope_diameter	52.3 Å
壳层 Rg shell_rg	19.77 Å
包络 Rg envelope_rg	15.03 Å
形状 Rg shape_rg	14.65 Å
总 Rg total_rg	15.77 Å
总原子数 total_atoms	950
残基数 n_residues	113
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	52.0 Å
Rg (实空间) rg_real	15.64 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.31 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.5360e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5870e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	15.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3536000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7944
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	18.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.367
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.145
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	697000.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.778; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Peregrin
分子量 formula_weight	13703.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1087

SMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1-methyl-3,4-dihydroquinoxalin-2-one
分子量 formula_weight	162.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NITRATE ION
分子量 formula_weight	62.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	111

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5epsa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.2 — Bromodomain
家族 Family family	a.29.2.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	5epsA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	60.630 Å
晶胞边长 b length_b	60.630 Å
晶胞边长 c length_c	62.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.470 Å
最低分辨率 resolution_low	40.200 Å
R 因子 r_factor	0.1889
R_work r_work	0.1884
R_free r_free	0.1981

fit	/app/data/saxs_computation/ep/5eps/5eps.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ep/5eps/5eps.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ep/5eps/5eps.dat