Escherichia coli J96
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ;5-[4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-methyl-phenyl]-~{N}1,~{N}3-dimethyl-benzene-1,3-dicarboxamide ; × 1 GLYCEROL × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | FIMH_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–158； UniProt 22–179 |
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| 条目编号 entry_id | 5f2f |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-12-01 |
| 结构标题 title | Crystal structure of para-biphenyl-2-methyl-3', 5' di-methyl amide mannoside bound to FimH lectin domain |
| 关键词 keywords | lectin, mannoside, immunoglobulin fold, carbohydrate binding protein, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.48 Å |
| Rg（电子密度） | 16.52 Å |
| 总 Rg | 17.43 Å |
| 原子数 | 2433 |
| 残基数 | 158 |
| 排除体积 | 22056 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5f2fa_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.2.3 — Bacterial adhesins |
| 家族 Family family | b.2.3.2 — Pilus subunits |
| 结构域编号 domain_id | 5f2fA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1090 — Fimbrial-type adhesion domain |