5ffv

Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H3K14ac histone peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 62.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peregrin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 626–740	片段：UNP residues 626-740	Histone H3 × 1 （K7EMV3） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 626–740	片段：UNP residues 626-740	Histone H3 × 1 （K7EMV3） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5FFV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2RS9 Solution structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with histone H4K5ac peptide 提交 2011-12-08	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 633–740（108 aa）片段：Bromodomain, UNP residues 633-740	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM H4K5ac-1, 0.54 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bromodomain-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2X35 Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG 3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 10 MM NACL	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
2X4W Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：RESIDUES 1076-1205	未记录	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；4M SODIUM FORMATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL	分辨率 1.50 Å R-free 0.216
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4X Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5) 0.01M NACL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
2X4Y Molecular basis of Histone H3K36me3 recognition by the PWWP domain of BRPF1. 提交 2010-02-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1076–1205（130 aa）片段：BRPF1 PWWP DOMAIN, RESIDUES 1076-1205	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG4K, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 0.1M TRIS (PH 8.5), 0.01M NACL.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
3L42 PWWP domain of human bromodomain and PHD finger containing protein 1 提交 2009-12-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：UNP residues 1079-1207	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；3.5M sodium formate, 0.1M TRIS-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.1M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 1.30 Å R-free 0.233
3MO8 PWWP Domain of Human Bromodomain and PHD finger-containing protein 1 In Complex with Trimethylated H3K36 Peptide 提交 2010-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：UNP residues 1079-1207	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；3.5M sodium formate, 0.1M Tris-HCl pH8.5, H3K36me3 peptide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.69 Å R-free 0.207
4LC2 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1B 提交 2013-06-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：unp residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG3350 0.1 M bis tris propane, 10% ethylene glycol 0.15 M sodium nitrate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.65 Å R-free 0.220
4QYD Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H4K12ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% w/v polyethylene glycol (PEG) 6,000, 5% v/v (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.94 Å R-free 0.213
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4QYL Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H2AK5ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 629–742（114 aa）片段：bromodomain (UNP residues 629-742)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 0.1 M MES monohydrate, pH 6.5, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 5000, 1% propylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
4UYE BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1- yl)-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2-methoxybenzamide 提交 2014-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 622-738	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 9F9 N-[1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1-yl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 10% MORPHEUS DIVALENTS MPD_P1K_P3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.201
4UYE BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1- yl)-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2-methoxybenzamide 提交 2014-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 622-738	未记录	9F9 N-[1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1-yl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 10% MORPHEUS DIVALENTS MPD_P1K_P3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.201
5C6S Human Bromodomain and PHD Finger Containing 1, PWWP domain in complex with XST005904a 提交 2015-06-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1079–1207（129 aa）片段：PWWP domain (UNP residues 1079-1207)	未记录	4K8 isoquinoline-3-carboxylic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M LiSO4, 0.1M HEPES pH7.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.217
5C7N Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with Bromosporine 提交 2015-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：residues 626-740	未记录	BMF Bromosporine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M sodium acetate, 0.15 M sodium nitrate, pH 5.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5C85 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED1 提交 2015-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 4YO 6-bromo-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH6.5, 0.2 M sodium nitrate, 20%PEG33500	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
5C87 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED2 提交 2015-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 4YS isoquinolin-1(2H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH6.5, 0.2 M sodium nitrate, 20%PEG33500	分辨率 1.55 Å R-free 0.198
5C89 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with 917 提交 2015-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	4YT 1-ethyl-8-methoxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M sodium acetate, pH 5.5, 0.15 M potassium thiocynate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.200
5D7X Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with XZ08 提交 2015-08-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 XZ8 4-(1-acetyl-1H-indol-3-yl)-5-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane, pH6.5, 0.2M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.35 Å R-free 0.176
5DY7 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED4 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5GT 7-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.69 Å R-free 0.204
5DYA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED5 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 625–740（116 aa）片段：UNP residues 625-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 5GV (2R)-2-ethyl-3-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-6-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.214
5DYC Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED6 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 625–740（116 aa）片段：UNP residues 625-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 5GU 7-bromo-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.235
5E3D Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED7 提交 2015-10-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5JL 2,8-dithioxo-1,2,3,7,8,9-hexahydro-6H-purin-6-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.71 Å R-free 0.222
5E3G Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED8 提交 2015-10-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5JQ 2-thioxo-2,3,7,9-tetrahydro-1H-purine-6,8-dione × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.205
5EM3 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED9 提交 2015-11-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5Q0 quinolin-5-ol × 2 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium-Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.188
5EPR Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED11 提交 2015-11-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5QY (3~{S})-3-methyl-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxalin-2-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.220
5EPS Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED10 提交 2015-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）片段：UNP residues 625-740	未记录	5QX 1-methyl-3,4-dihydroquinoxalin-2-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.47 Å R-free 0.198
5EQ1 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED12 提交 2015-11-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	BEA 5-METHYL-1,2,4-TRIAZOLO[3,4-B]BENZOTHIAZOLE × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.194
5ERC X-ray crystal structure of BRPF1 PZP domain 提交 2015-11-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 274–450（177 aa）片段：PZP domain (UNP residues 274-450)	未记录	ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2 M Calcium acetate, 0.1 M Imidazole pH 8.0, 10% PEG8000	分辨率 2.05 Å R-free 0.193
5ETB Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED13 提交 2015-11-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5RO 1-(7-methyl-1~{H}-indol-3-yl)ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.33 Å R-free 0.187
5ETD Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED14 提交 2015-11-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5RN 1-(1~{H}-indol-3-yl)ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.187
5EV9 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED15 提交 2015-11-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SB ~{N}-[5-(1~{H}-pyrazol-4-yl)quinolin-8-yl]ethanamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.221
5EVA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED16 提交 2015-11-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5S9 ~{N}-[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-2-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.198
5EWC Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED17 提交 2015-11-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SJ ethyl (2~{R})-2-methyl-3-oxidanylidene-2,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-6-carboxylate × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.211
5EWD Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED18 提交 2015-11-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SH 4-phenylpyridine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.58 Å R-free 0.226
5EWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED19 提交 2015-11-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SG isoquinolin-5-ol × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.63 Å R-free 0.213
5EWV Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED20 提交 2015-11-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5SN 1,5-dimethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoline × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.67 Å R-free 0.221
5EWW Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with SEED21 提交 2015-11-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740#	未记录	5SK ~{N}-[(2~{R})-butan-2-yl]-1-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4-amine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.73 Å R-free 0.210
5FFW Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H4K5acK8ac histone peptide 提交 2015-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740 链 B 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.2 M NaCl, 25% PEG3350, 0.1 M Hepes pH 7.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.243
5FFY Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with a benzimidazole ligand 提交 2015-12-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	5XD 4-ethyl-~{N}-(6-methoxy-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；0.1 M bis tris propane pH 9, 10% ethylene glycol, 0.15 M sodium nitrate	分辨率 1.55 Å R-free 0.213
5FG4 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with OF-1 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5XE 4-bromanyl-~{N}-(6-methoxy-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl)-2-methyl-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277.15 K；25% PEG3350, 0.1M bis-tris propane pH 7.4, 5% ethyleneglycol, 0.15M sodium nitrate	分辨率 1.65 Å R-free 0.254
5FG5 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with PFI-4 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	5XF ~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-6-pyrrolidin-1-yl-benzimidazol-5-yl)-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% PEG3350, 0.25 M sodium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
5FG5 Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with PFI-4 chemical probe 提交 2015-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	5XF ~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-6-pyrrolidin-1-yl-benzimidazol-5-yl)-2-methoxy-benzamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% PEG3350, 0.25 M sodium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4R BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-2- methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 622–738（117 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 622-738	未记录	LF1 N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% P550MME_P20K, 0.1M BUFFER 3, PH8.5, 10% ETHYLENE GLYCOLS	分辨率 1.96 Å R-free 0.240
5G4S BROMODOMAIN OF HUMAN BRPF1 WITH N-1,3-dimethyl-6-2R-2- methylpiperazin-1-yl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl-N- ethyl-2-methoxybenzamide 提交 2016-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 624–738（115 aa）片段：BROMODOMAIN OF BRPF1, UNP RESIDUES 624-738	未记录	8VI N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl]-N-ethyl-2-methoxy-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1M MORPHEUS BUFFER 1, PH 6.5 37.5% MPD_P1K_P3350 10% MORPHEUS NITRATE-PHOSPHATE-SULPHATE	分辨率 1.60 Å R-free 0.194
5MWG Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ091 提交 2017-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	WGX ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.227
5MWG Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ091 提交 2017-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	WGX ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.227
5MWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ089 提交 2017-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	UWX ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.226
5MWH Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ089 提交 2017-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	UWX ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.226
5MWZ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ073 提交 2017-01-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	KGU ~{N}-[1,4-diethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-piperidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH7.4, 25% PEG3350, 5% EG, 0.15 M NaNO3	分辨率 1.25 Å R-free 0.181
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5MYG Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-57 chemical probe 提交 2017-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 626–740（115 aa）	未记录	LS8 4-cyano-~{N}-(1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-quinolin-6-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M ammonium acetate, 17% PEG 10K, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
5O4S Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ135 提交 2017-05-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9KW ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5O4S Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ135 提交 2017-05-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	9KW ~{N}-[1,4-dimethyl-7-morpholin-4-yl-2,3-bis(oxidanylidene)quinoxalin-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydronaphthalene-2-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
5O4T Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ061 提交 2017-05-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9KT 1,4-dimethylquinoxaline-2,3-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.212
5O55 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ047 提交 2017-05-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）片段：UNP residues 626-740	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 9L5 ~{N}-[(1~{S})-1-(1,5-dimethylpyrazol-4-yl)ethyl]-1-ethyl-3-methyl-2-oxidanylidene-quinoxaline-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
5O5A Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ032 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 9LN 1-ethyl-~{N}-methyl-2,3-bis(oxidanylidene)-~{N}-[(1-phenylpyrazol-4-yl)methyl]-4~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.202
5O5F Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ038 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9LT 1-ethyl-~{N}-[(~{R})-(3-fluorophenyl)-(1-methylimidazol-2-yl)methyl]-2,3-bis(oxidanylidene)-4~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.30 Å R-free 0.188
5O5H Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ053 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	9LK ~{N}-[6-(4-chloranylphenoxy)pyridin-3-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 2 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane, pH6.5, 0.2 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.235
5OV8 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ097 提交 2017-08-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	AXN ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-pyrrolidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
5OV8 Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ097 提交 2017-08-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	AXN ~{N}-[1,4-dimethyl-2,3-bis(oxidanylidene)-7-pyrrolidin-1-yl-quinoxalin-6-yl]-4-(2-methylpropyl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.244
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWA Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with BZ054 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 626–740（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.268
5OWB Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with DSPBP1004 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 AYW 4-methyl-6-oxidanyl-1-benzofuran-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Sodium Acetate, pH5.5, 0.15 M Sodium Nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.204
5OWE Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with DSPBP1010 提交 2017-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0E 1,3-bis(oxidanyl)benzo[c]chromen-6-one × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-tris propane, pH6.5, 0.2 M Sodium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.213
5T4U Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with a quinolinone ligand 提交 2016-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1 12Q 1-METHYLQUINOLIN-2(1H)-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；20 % PEG3350, 0.2 M ammonium nitrate	分辨率 1.50 Å R-free 0.231
5T4V Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with NI-48 ligand 提交 2016-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–740（114 aa）	未记录	N48 4-cyano-N-(7-methoxy-1,4-dimethyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.1 m bis-tris propane pH 8.5, 0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol	分辨率 1.65 Å R-free 0.250
6EKQ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain complexed with BZ054 in space group C2 提交 2017-09-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.182
6EKQ Crystal structure of the human BRPF1 bromodomain complexed with BZ054 in space group C2 提交 2017-09-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 626–740（115 aa）	未记录	B0H ~{N}-[4-[[(3~{S},5~{R})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]methyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2,4-dimethyl-1,3-oxazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris Propane pH9, 10% EG, 0.15M NaNO3, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.182
6U04 Crystal structure of human BRPF1 PZP bound to histone H3 tail 提交 2019-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 271–454（184 aa）	未记录	PR PRASEODYMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 40% (v/v) PEG400, and 0.01M Praseodymium(III) acetate hydrate	分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7C4I High resolution structure of BRPF1 Bromo Domain from Biortus 提交 2020-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium fluoride, 20 %(w/v) PEG 3350	分辨率 1.37 Å R-free 0.194
8QAZ Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 3 提交 2023-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	QA5 2-[4-[4-ethanoyl-5-methyl-3-(3-methylbutyl)-1~{H}-pyrrol-2-yl]-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350, 5% ethylene glycol	分辨率 1.40 Å R-free 0.196
8QB0 Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 2 提交 2023-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	Q9U 2-[4-(3,6,6-trimethyl-4-oxidanylidene-5,7-dihydro-2~{H}-isoindol-1-yl)-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350, 5% ethylene glycol	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
8QB2 Crystal Structure of BRPF1 bromodomain in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 79 提交 2023-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 626–740（115 aa）	突变：bromodomain (residues 626-740)	GKI 1-[2-methyl-4-(3-methylbutyl)-5-(2-piperazin-1-yl-1,3-thiazol-4-yl)-1~{H}-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.18 M sodium nitrate, 30% PEG 3350	分辨率 1.42 Å R-free 0.196

共 64 个其他 PDB 条目、93 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BRPF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–116； UniProt 626–740 作者链 B； PDB构建体 2–116； UniProt 626–740

Histone H3

物种未注明

UniProt K7EMV3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 10–20	片段：UNP residues 10-20 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Peregrin × 1 （P55201） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 10–20	片段：UNP residues 10-20 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Peregrin × 1 （P55201） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M bis-tris pH 5.5	分辨率 1.30 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5FFV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B75 Crystal structure of MOZ double PHD finger in complex with histone H3 butyrylation at K14 提交 2016-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–26（25 aa）片段：UNP residues 2-26	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris	分辨率 1.70 Å R-free 0.195
5B76 Crystal structure of MOZ double PHD finger domain in complex with histone H3 crotonylation at K14 提交 2016-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–26（25 aa）片段：UNP residues 2-26	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris	分辨率 1.65 Å R-free 0.236
5B77 Crystal structrue of MOZ double PHD finger in complex with histone H3 propionylation at K14 提交 2016-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–26（25 aa）片段：UNP residues 2-26	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris	分辨率 1.55 Å R-free 0.204
5B78 Crystal structure of MOZ double PHD finger mutant-S210D/N235R in complex with histone H3 crotonylation at K14 提交 2016-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–26（25 aa）片段：UNP residues 2-26	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；polyethylene glycol 4000, lithium sulfate, Tris	分辨率 1.40 Å R-free 0.187
5FB0 Crystal Structure of a PHD finger bound to histone H3 T3ph peptide 提交 2015-12-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium citrate	分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5FB0 Crystal Structure of a PHD finger bound to histone H3 T3ph peptide 提交 2015-12-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium citrate	分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5FB1 Crystal Structure of a PHD finger bound to histone H3 K9me3 peptide 提交 2015-12-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–16（15 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M sodium citrate/citric acid, pH 5.5, 10% 2-propanol	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5GH9 Crystal structure of CBP Bromodomain with H3K56ac peptide 提交 2016-06-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 45–58（14 aa）片段：UNP residues 45-58	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.05 M Cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, 1.0 M Sodium acetate trihydrate,	分辨率 1.45 Å R-free 0.176

共 7 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7EMV3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–11； UniProt 10–20 作者链 D； PDB构建体 1–11； UniProt 10–20

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5ffv
沉积日期 deposition_date	2015-12-19
结构标题 title	Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H3K14ac histone peptide
关键词 keywords	Peregrin, MOZ-MORF complex, transcription; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.97 Å
零角强度 I(0) i0	13352500.00
分子量 molecular_weight	27664.0 kDa
排除体积 excluded_volume	34834 Å³
包络体积 envelope_volume	41994 Å³
水化壳体积 shell_volume	18687 Å³
包络直径 envelope_diameter	62.8 Å
壳层 Rg shell_rg	24.92 Å
包络 Rg envelope_rg	19.02 Å
形状 Rg shape_rg	18.96 Å
总 Rg total_rg	19.89 Å
总原子数 total_atoms	1950
残基数 n_residues	233
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	62.8 Å
Rg (实空间) rg_real	19.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.34 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3350e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6660e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.67 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	13350000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8973
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.184
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.476
角度范围 angular_range	— – 0.4000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6850000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.888; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.999

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Peregrin
分子量 formula_weight	13703.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2244

SMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	1202.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

KSTGGKAPRKQ

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	274

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5ffvA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

结构域编号 domain_id	5ffvB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	74.266 Å
晶胞边长 b length_b	74.354 Å
晶胞边长 c length_c	49.509 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.300 Å
最低分辨率 resolution_low	29.730 Å
R 因子 r_factor	0.1908
R_work r_work	0.1900
R_free r_free	0.2064

fit	/app/data/saxs_computation/ff/5ffv/5ffv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ff/5ffv/5ffv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ff/5ffv/5ffv.dat

Crystal structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with H3K14ac histone peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peregrin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)