5h1u

Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 2

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 137.9 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription intermediary factor 1-alpha

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 824–1006	片段：UNP residues 824-1006	6KT 2-amino-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.269
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 824–1006	片段：UNP residues 824-1006	6KT 2-amino-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.269
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 824–1006	片段：UNP residues 824-1006	6KT 2-amino-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.269
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 824–1006	片段：UNP residues 824-1006	6KT 2-amino-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.269

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5H1U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2YYN Crystal structure of human bromodomain protein 提交 2007-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 891–1012（122 aa）片段：bromo domain 链 B 891–1012（122 aa）片段：bromo domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES, 25% PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
2YYN Crystal structure of human bromodomain protein 提交 2007-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 891–1012（122 aa）片段：bromo domain 链 D 891–1012（122 aa）片段：bromo domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES, 25% PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
2YYN Crystal structure of human bromodomain protein 提交 2007-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 891–1012（122 aa）片段：bromo domain 链 B 891–1012（122 aa）片段：bromo domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES, 25% PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
2YYN Crystal structure of human bromodomain protein 提交 2007-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 891–1012（122 aa）片段：bromo domain 链 D 891–1012（122 aa）片段：bromo domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES, 25% PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
3O33 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo in the free state 提交 2010-07-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes (pH 7.5), 2.0 M ammonium sulfate and 2% Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3O33 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo in the free state 提交 2010-07-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes (pH 7.5), 2.0 M ammonium sulfate and 2% Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3O33 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo in the free state 提交 2010-07-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes (pH 7.5), 2.0 M ammonium sulfate and 2% Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3O33 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo in the free state 提交 2010-07-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes (pH 7.5), 2.0 M ammonium sulfate and 2% Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3O34 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(13-32)K23ac peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 BTN BIOTIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；100 mM Na-citrate (pH 5.6), 200 mM K/Na-tartrate tetrahydrate and 1.6 M ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.241
3O35 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(23-31)K27ac peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；200 mM Na-acetate, 30% Polyethylene glycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.76 Å R-free 0.225
3O35 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(23-31)K27ac peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；200 mM Na-acetate, 30% Polyethylene glycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.76 Å R-free 0.225
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
4YAB Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with 1-methyl-5-(2-methyl-1 3-thiazol-4-yl)-2 3-dihydro-1H-indol-2-one (1) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4CN 1-methyl-5-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.90 Å R-free 0.219
4YAB Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with 1-methyl-5-(2-methyl-1 3-thiazol-4-yl)-2 3-dihydro-1H-indol-2-one (1) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4CN 1-methyl-5-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.90 Å R-free 0.219
4YAD Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with 2,4-dimethoxy-N-(1-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-6-yl)benzene-1-sulfonamide (3b) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4A7 2,4-dimethoxy-N-(1-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-6-yl)benzenesulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.73 Å R-free 0.208
4YAD Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with 2,4-dimethoxy-N-(1-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-6-yl)benzene-1-sulfonamide (3b) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4A7 2,4-dimethoxy-N-(1-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-6-yl)benzenesulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.73 Å R-free 0.208
4YAT Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-(1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl)-4-methoxybenzene-1-sulfonamide (5b) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4A8 N-(1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)-4-methoxybenzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 2.18 Å R-free 0.165
4YAT Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-(1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl)-4-methoxybenzene-1-sulfonamide (5b) 提交 2015-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4A8 N-(1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)-4-methoxybenzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 2.18 Å R-free 0.165
4YAX Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-[6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl]benzenesulfonamide (5g) 提交 2015-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	4AE N-[6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]benzenesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 2.25 Å R-free 0.235
4YAX Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-[6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl]benzenesulfonamide (5g) 提交 2015-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	4AE N-[6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]benzenesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 2.25 Å R-free 0.235
4YBM Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-{6-[3-(benzyloxy)phenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide (7b) 提交 2015-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.46 Å R-free 0.196
4YBM Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-{6-[3-(benzyloxy)phenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide (7b) 提交 2015-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 4BJ N-{6-[3-(benzyloxy)phenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzenesulfonamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.46 Å R-free 0.196
4YBS Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-{1,3-dimethyl-6-[3-(2-methylpropoxy)phenoxy]-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-1,2-dimethyl-1H-imidazole-4-sulfonamide (7g) 提交 2015-02-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 4BK N-{1,3-dimethyl-6-[3-(2-methylpropoxy)phenoxy]-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl}-1,2-dimethyl-1H-imidazole-4-sulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.83 Å R-free 0.231
4YBT Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-{1,3-dimethyl-2-oxo-6-[3-(oxolan-3-ylmethoxy)phenoxy]-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-1-methyl-1H-imidazole-4-sulfonamide (7l) 提交 2015-02-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 4BV N-(1,3-dimethyl-2-oxo-6-{3-[(3S)-tetrahydrofuran-3-ylmethoxy]phenoxy}-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)-1-methyl-1H-imidazole-4-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.82 Å R-free 0.209
4YC9 Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain complexed with N-(6-{3-[4-(dimethylamino)butoxy]-5-propoxyphenoxy}-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl)-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide (8i) 提交 2015-02-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：bromodomain (UNP residues 824-1006)	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 4C1 N-(6-{3-[4-(dimethylamino)butoxy]-5-propoxyphenoxy}-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)-3,4-dimethoxybenzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.2-2.4M ammonium sulfate, 0.1M HEPES buffer pH 7.5, 2% PEG400 and 8-9% glycerol	分辨率 1.82 Å R-free 0.203
4ZQL Crystal structure of TRIM24 with 3,4-dimethoxy-N-(6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)benzenesulfonamide inhibitor 提交 2015-05-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 791–972（182 aa）片段：residues 791-972	未记录	ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2M ammonium sulfate, 2%(v/v) PEG 400	分辨率 1.79 Å R-free 0.199
4ZQL Crystal structure of TRIM24 with 3,4-dimethoxy-N-(6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)benzenesulfonamide inhibitor 提交 2015-05-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 791–972（182 aa）片段：residues 791-972	未记录	ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 4QH 3,4-dimethoxy-N-[6-(4-methoxyphenoxy)-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl]benzenesulfonamide × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2M ammonium sulfate, 2%(v/v) PEG 400	分辨率 1.79 Å R-free 0.199
5H1T Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 1 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FF methyl 6-azanyl-3,4-dihydro-2H-quinoline-1-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5H1T Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 1 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FF methyl 6-azanyl-3,4-dihydro-2H-quinoline-1-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5H1T Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 1 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FF methyl 6-azanyl-3,4-dihydro-2H-quinoline-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5H1T Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 1 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FF methyl 6-azanyl-3,4-dihydro-2H-quinoline-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5H1V Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 6 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FU 2-Hydrazino-1,3-benzothiazole-6-carbohydrazide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
5H1V Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 6 提交 2016-10-11	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）片段：UNP residues 824-1006	未记录	ZN ZINC ION × 2 7FU 2-Hydrazino-1,3-benzothiazole-6-carbohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium, 2%(v/v) Polyethylene glycol 400, 2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
7B9X NMR2 structure of TRIM24-BD in complex with a precursor of IACS-9571 提交 2020-12-14	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 901–1006（106 aa）	未记录	T52 N-{6-[3-(4-Aminobutoxy)-5-propoxyphenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 1.1 mM [U-13C; U-15N] TRIM24-BD, 50 mM [U-2H] HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 10 % [U-2H] D2O, 1.1 mM N-{6-[3-(4-Aminobutoxy)-5-propoxyphenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 50 mM [U-2H] HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 10 % [U-2H] D2O, 1.1 % N-{6-[3-(4-Aminobutoxy)-5-propoxyphenoxy]-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-5-yl}-3,4-dimethoxybenzene-1-sulfonamide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9GD5 Crystal structure of apo TRIM24 PHD-BRD in C121 space group 提交 2024-08-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 825–1007（183 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES (pH 7.9), 2% PEG400, 8% glycerol	分辨率 1.68 Å R-free 0.240
9GD5 Crystal structure of apo TRIM24 PHD-BRD in C121 space group 提交 2024-08-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 825–1007（183 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES (pH 7.9), 2% PEG400, 8% glycerol	分辨率 1.68 Å R-free 0.240
9GDG Crystal structure of TRIM24 PHD-BRD in complex with N-(2-(2-(2-acetamidoethoxy)ethoxy)ethyl)-3-(N-(1,3-dimethyl-2-oxo-6-(3-propoxyphenoxy)-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)sulfamoyl)benzamide (PEG linker unresolved) 提交 2024-08-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 825–1007（183 aa）	未记录	A1IKF N-(2-(2-(2-acetamidoethoxy)ethoxy)ethyl)-3-(N-(1,3-dimethyl-2-oxo-6-(3-propoxyphenoxy)-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)sulfamoyl)benzamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES (pH 7.3), 5% PEG400	分辨率 1.46 Å R-free 0.210
9R9C Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain with XS839112 提交 2025-05-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 824–1006（183 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.59 Å R-free 0.196
9R9C Crystal structure of TRIM24 PHD-bromodomain with XS839112 提交 2025-05-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 824–1006（183 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.59 Å R-free 0.196

共 21 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIF1A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–183； UniProt 824–1006 作者链 B； PDB构建体 1–183； UniProt 824–1006 作者链 C； PDB构建体 1–183； UniProt 824–1006 作者链 D； PDB构建体 1–183； UniProt 824–1006

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5h1u
沉积日期 deposition_date	2016-10-11
结构标题 title	Complex structure of TRIM24 PHD-bromodomain and inhibitor 2
关键词 keywords	TRANSCRIPTION TRANSCRIPTION INHIBITOR, TRANSCRIPTION-TRANSCRIPTION INHIBITOR complex; TRANSCRIPTION/TRANSCRIPTION INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	40.22 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.38 Å
零角强度 I(0) i0	103870000.00
分子量 molecular_weight	82173.0 kDa
排除体积 excluded_volume	102560 Å³
包络体积 envelope_volume	153830 Å³
水化壳体积 shell_volume	34155 Å³
包络直径 envelope_diameter	140.0 Å
壳层 Rg shell_rg	41.95 Å
包络 Rg envelope_rg	39.69 Å
形状 Rg shape_rg	40.38 Å
总 Rg total_rg	40.48 Å
总原子数 total_atoms	5739
残基数 n_residues	701
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	137.9 Å
Rg (实空间) rg_real	40.47 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.27 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0390e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.7460e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	40.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	103800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6046
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	31.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.390
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.609
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6114000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.815; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.025; Positv: 1.000; Valcen: 0.584; Smooth: 0.754

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription intermediary factor 1-alpha
分子量 formula_weight	21231.3 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A,C,D
原子数 atom_count	5950

PNEDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKLTPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYSKPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEELLKNLYP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	2-amino-1,3-benzothiazole-6-carboxamide
分子量 formula_weight	193.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	DIMETHYL SULFOXIDE
分子量 formula_weight	78.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	211

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5h1uA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	5h1uA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

结构域编号 domain_id	5h1uB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	5h1uB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

结构域编号 domain_id	5h1uC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	5h1uC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

结构域编号 domain_id	5h1uD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	5h1uD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	920 — Histone Acetyltransferase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bromodomain-like

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	36.560 Å
晶胞边长 b length_b	48.568 Å
晶胞边长 c length_c	123.374 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	86.72 °
晶胞夹角 β angle_beta	81.46 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	67.90 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.901 Å
最低分辨率 resolution_low	33.552 Å
R 因子 r_factor	0.2275
R_work r_work	0.2252
R_free r_free	0.2692

fit	/app/data/saxs_computation/h1/5h1u/5h1u.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h1/5h1u/5h1u.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h1/5h1u/5h1u.dat