5iix

Crystal structure of Equine Serum Albumin in the presence of 15 mM zinc at pH 6.5

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serum albumin

物种未注明

UniProt P35747

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 25–607 片段:residues 25-607 ZN ZINC ION × 11 UNL UNKNOWN LIGAND × 2 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;1 ul of 30 mg/ml protein in 10 mM Tris pH 7.5 and 150 mM NaCl buffer was mixed with 1 ul of the well condition (0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris:HCl, 2.0 M (NH4)2SO4, 5 mM ZnCl2, final pH 6.5) and equilibrated against well solution in 15 Well Crystallization Plate (Qiagen). Crystals were soaked with 50 mM ZnCl2 in 100 mM Tris, final pH 6.5, to final concentration of 15 mM 分辨率 2.20 Å R-free 0.228

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ALBU_HORSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–583; UniProt 25–607

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5iix
沉积日期 deposition_date2016-03-01
结构标题 titleCrystal structure of Equine Serum Albumin in the presence of 15 mM zinc at pH 6.5
关键词 keywordsStructural Genomics, PSI-Biology, New York Structural Genomics Research Consortium, NYSGRC, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd5iixa1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5iixa2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5iixa3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id5iixA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id5iixA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id5iixA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id5iixA04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id5iixA05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id5iixA06
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)