5izu

A new binding site outside the canonical PDZ domain determines the specific interaction between Shank and SAPAP and their function

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3

Mus musculus

UniProt Q4ACU6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 peptide from Disks large-associated protein 3 × 2 (Q6PFD5) water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SHAN3_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 7–139; UniProt 533–665 作者链 C; PDB构建体 7–139; UniProt 533–665

peptide from Disks large-associated protein 3

物种未注明

UniProt Q6PFD5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3 × 2 (Q4ACU6) water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DLGP3_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–15; UniProt 963–977 作者链 D; PDB构建体 1–15; UniProt 963–977

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5izu
沉积日期 deposition_date2016-03-26
结构标题 titleA new binding site outside the canonical PDZ domain determines the specific interaction between Shank and SAPAP and their function
关键词 keywordsShank, SAPAP, PDZ, extension, synapse, specific interaction, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5izu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5izu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5izu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.38 Å
Rg(电子密度)21.36 Å
总 Rg22.26 Å
原子数2137
残基数278
排除体积38197 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5izu__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id5izuC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PDZ domain
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7. 引用文献 (1)