5jze

Erve virus viral OTU domain protease in complex with mouse ISG15

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-like protein ISG15

Mus musculus

UniProt Q64339

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 RNA-dependent RNA polymerase × 1 (J3RTH4) prop-2-en-1-amine × 1 CITRATE ANION × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 RNA-dependent RNA polymerase × 1 (J3RTH4) prop-2-en-1-amine × 1 CITRATE ANION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ISG15_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–76; UniProt 79–154 作者链 D; PDB构建体 1–76; UniProt 79–154

RNA-dependent RNA polymerase

Erve virus

UniProt J3RTH4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ubiquitin-like protein ISG15 × 1 (Q64339) prop-2-en-1-amine × 1 CITRATE ANION × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ubiquitin-like protein ISG15 × 1 (Q64339) prop-2-en-1-amine × 1 CITRATE ANION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 J3RTH4_9VIRU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–159; UniProt 4–162 作者链 C; PDB构建体 1–159; UniProt 4–162

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5jze
沉积日期 deposition_date2016-05-16
结构标题 titleErve virus viral OTU domain protease in complex with mouse ISG15
关键词 keywordsvOTU, ISG15, nairovirus, protease, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5jze__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5jze__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5jze__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.12 Å
Rg(电子密度)18.22 Å
总 Rg19.18 Å
原子数1924
残基数234
排除体积34095 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5jze__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5jze__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd5jzeb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd5jzed_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id5jzeA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 —
结构域编号 domain_id5jzeB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id5jzeC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 —
结构域编号 domain_id5jzeD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
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7. 引用文献 (1)