Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 3 FORMIC ACID × 1 6-methyl-5-[(4-propan-2-ylphenyl)amino]-2~{H}-1,2,4-triazin-3-one × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 33 SODIUM ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HDAC6_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–107； UniProt 1109–1213 |
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| 条目编号 entry_id | 5kh9 |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-06-14 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a low occupancy fragment candidate (5-[(4-Isopropylphenyl)amino]-6-methyl-1,2,4-triazin-3(2H)-one) bound in the ubiquitin binding pocket of the HDAC6 zinc-finger domain |
| 关键词 keywords | HISTONE DEACETYLASE, HDAC, HDAC6, FRAGMENT SCREENING, STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM, SGC, DIAMOND I04-1 XCHEM, PANDDA, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 5kh9__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。 | ||||||
| 结构域编号 domain_id | 5kh9A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Herpes Virus-1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) |