5kp4

Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to 19-nortestosterone

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 61.6 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Steroid Delta-isomerase

Pseudomonas putida

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–131 链 B； UniProt 1–131	未记录	6VW (8~{R},9~{S},10~{R},13~{S},14~{S},17~{S})-13-methyl-17-oxidanyl-2,6,7,8,9,10,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1~{H}-cyclop enta[a]phenanthren-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.71 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5KP4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C7H CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT R75A IN KETOSTEROID ISOMERASE FROM PSEDOMONAS PUTIDA BIOTYPE B 提交 2000-02-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：R75A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.6	分辨率 2.50 Å R-free 0.271
1CQS CRYSTAL STRUCTURE OF D103E MUTANT WITH EQUILENINEOF KSI IN PSEUDOMONAS PUTIDA 提交 1999-08-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）片段：KSI MUTANT 链 B 1–131（131 aa）片段：KSI MUTANT	突变：D103E,D40N 突变：D103E,D40N	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；Sodium Acetate, Ammonium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 1.90 Å R-free 0.259
1DMM CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT ENZYMES Y57F OF KETOSTEROID ISOMERASE FROM PSEUDOMONAS PUTIDA BIOTYPE B 提交 1999-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：Y57F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1DMN CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT ENZYME Y32F/Y57F OF KETOSTEROID ISOMERASE FROM PSEUDOMONAS PUTIDA BIOTYPE B 提交 1999-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：Y32F, Y57F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 2.05 Å R-free 0.244
1DMQ CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT ENZYME Y32F OF KETOSTEROID ISOMERASE FROM PSEUDOMONAS PUTIDA BIOTYPE B 提交 1999-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：Y32F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
1E3R Crystal structure of ketosteroid isomerase mutant D40N (D38N TI numbering) from Pseudomonas putida complexed with androsten-3beta-ol-17-one 提交 2000-06-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：YES 突变：YES	AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.279
1E3V Crystal structure of ketosteroid isomerase from Psedomonas putida complexed with deoxycholate 提交 2000-06-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	DXC (3ALPHA,5BETA,12ALPHA)-3,12-DIHYDROXYCHOLAN-24-OIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
1E97 Crystal structure of ketosteroid isomerase from Pseudomonas putida ; triple mutant y16f/y32f/y57f 提交 2000-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
1EA2 Pseudoreversion of the Catalytic Activity of Y14F by the Additional Tyrosine-to-Phenylalanine Substitution(s) in the Hydrogen Bond Network of Delta-5-3-Ketosteroid Isomerase from Pheudomonas putida Biotype B 提交 2000-11-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 1.80 Å R-free 0.258
1GS3 High resolution crystal structure of PI delta-5-3-Ketosteroid Isomerase mutants Y30F/Y55F/Y115F/D38N (Y32F/Y57F/Y119F/D40N, PI numbering)complexed with equilenin at 2.1 A resolution 提交 2001-12-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.10 Å R-free 0.275
1K41 Crystal structure of KSI Y57S mutant 提交 2001-10-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y57S 突变：Y57S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4.6；295 K；Sodium Acetate, Ammonium acetate, pH 4.6, EVAPORATION, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.315
1OGX High Resolution Crystal Structure Of Ketosteroid Isomerase Mutant D40N(D38N, Ti Numbering) from Pseudomonas putida Complexed With Equilenin At 2.0 A Resolution. 提交 2003-05-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：YES 突变：YES	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1OH0 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE COMPLEXED WITH EQUILENIN 提交 2003-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	EQU EQUILENIN × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；20% POLYETHYLENEGLYCOL 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5.6	分辨率 1.10 Å R-free 0.220
1OHO CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE Y16F/D40N mutant COMPLEXED WITH EQUILENIN 提交 2003-05-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
1OPY KSI 提交 1997-05-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.273
1VZZ CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT ENZYME Y32F/D103L OF KETOSTEROID ISOMERASE FROM PSEUDOMONAS PUTIDA BIOTYPE B 提交 2004-05-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60	分辨率 2.30 Å R-free 0.239
1W00 Crystal structure of mutant enzyme D103L of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida biotype B 提交 2004-05-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60	分辨率 2.20 Å R-free 0.279
1W01 Crystal structure of mutant enzyme Y57F/D103L of ketosteroid isomerase from Pseudomonas putida biotype B 提交 2004-05-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1W02 Crystal structure of mutant enzyme Y16F/D103L of ketosteroid isomerase from Pseudomonas putida biotype B 提交 2004-05-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60	分辨率 2.30 Å R-free 0.285
1W6Y crystal structure of a mutant W92A in ketosteroid isomerase (KSI) from Pseudomonas putida biotype B 提交 2004-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	EQU EQUILENIN × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
2INX Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N from Pseudomonas putida (pKSI) with bound 2,6-difluorophenol 提交 2006-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：D40N	FFP 2,6-DIFLUOROPHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate 1.4 M, 2-propanol 6.5% protein concentration 25 mg/ml, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.234
2PZV Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N from Pseudomonas Putida (pksi) with bound Phenol 提交 2007-05-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N 突变：D40N	IPH PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M ammonium sulphate, 7% (v/v) 2-propanol, 40 mM potasium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.25 Å R-free 0.227
2PZV Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N from Pseudomonas Putida (pksi) with bound Phenol 提交 2007-05-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N 突变：D40N	IPH PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；1.4 M ammonium sulphate, 7% (v/v) 2-propanol, 40 mM potasium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.25 Å R-free 0.227
3CPO Crystal structure of ketosteroid isomerase D40N with bound 2-fluorophenol 提交 2008-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：D40N	FP2 2-fluorophenol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；AMMONIUM SULPHATE 1.4 M, 2-PROPANOL 5-7%, PROTEIN CONCENTRATION 25 MG/ML, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.24 Å R-free 0.200
3FZW Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N-D103N from Pseudomonas putida (pKSI) with bound equilenin 提交 2009-01-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, D103N 突变：D40N, D103N	EQU EQUILENIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate 1.4 M, 2-propanol 6.5%, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.32 Å R-free 0.183
3IPT Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase Y16S/D40N from Pseudomonas putida with Bound Equilenin 提交 2009-08-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y16S,D40N 突变：Y16S,D40N	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.9 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.63 Å R-free 0.245
3IPT Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase Y16S/D40N from Pseudomonas putida with Bound Equilenin 提交 2009-08-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：Y16S,D40N 突变：Y16S,D40N	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.9 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.63 Å R-free 0.245
3OWS Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M116C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 C 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.71 Å R-free 0.257
3OWS Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M116C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.71 Å R-free 0.257
3OWU Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/F86C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.270
3OWU Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/F86C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.270
3OWY Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M105C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.346
3OWY Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M105C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–131（131 aa）链 C 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.346
3OWY Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M105C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–131（131 aa）链 H 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.346
3OWY Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M105C-CN from P. putida with Bound Equilenin 提交 2010-09-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–131（131 aa）链 G 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M105(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.346
3OX9 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/F86C-CN from P. putida 提交 2010-09-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.341
3OX9 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/F86C-CN from P. putida 提交 2010-09-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, F86(XCN), C97S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.341
3OXA Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M116C-CN from P. putida 提交 2010-09-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 C 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.89 Å R-free 0.290
3OXA Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/C69S/C81S/C97S/M116C-CN from P. putida 提交 2010-09-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, C69S, C81S, C97S, M116(XCN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；1.1 M ammonium sulfate, 5% isopropanol, 40 mM potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.89 Å R-free 0.290
3RGR Crystal structure of ketosteroid isomerase M116A from Pseudomonas putida 提交 2011-04-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：M116A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；1 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate pH 7.2, 1 mM EDTA, 2 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.59 Å R-free 0.225
3SED Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase Variant M105A from Pseudomonos putida 提交 2011-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–127（125 aa）片段：unp residues 3-127	突变：M105A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.4 M Ammonium sulfate 6.5% Isopropyl alcohol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.231
3SED Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase Variant M105A from Pseudomonos putida 提交 2011-06-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–127（125 aa）片段：unp residues 3-127	突变：M105A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.4 M Ammonium sulfate 6.5% Isopropyl alcohol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.231
3T8N Crystal structure of ketosteroid isomerase Y16AD103A from Pseudomonas putida 提交 2011-08-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y16A, D103A 突变：Y16A, D103A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；1.6 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate, 1 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.47 Å R-free 0.218
3T8N Crystal structure of ketosteroid isomerase Y16AD103A from Pseudomonas putida 提交 2011-08-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–131（131 aa）链 F 1–131（131 aa）	突变：Y16A, D103A 突变：Y16A, D103A	SO4 SULFATE ION × 3 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；1.6 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate, 1 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.47 Å R-free 0.218
3VGN Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N from Pseudomonas putida (pKSI) with bound 3-fluoro-4-nitrophenol 提交 2011-08-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N 突变：D40N	FNN 3-fluoro-4-nitrophenol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.4M Ammonium sulphate, 6-7% 2-propanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.218
3VSY High-resolution crystal structure of wild-type KSI in the apo form at neutral pH 提交 2012-05-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–131（129 aa）片段：UNP RESIDUES 3-131 链 B 3–131（129 aa）片段：UNP RESIDUES 3-131	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；AMMONIUM SULPHATE 1.4M, 2-PROPANOL 5-7%, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.202
4CDL Crystal Structure of Retro-aldolase RA110.4-6 Complexed with Inhibitor 1-(6-methoxy-2-naphthalenyl)-1,3-butanedione 提交 2013-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	LLK (2E)-1-(6-methoxynaphthalen-2-yl)but-2-en-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；50 MM SODIUM ACETATE PH 4.5, 1 M NACL, 45% V/V PEG400	分辨率 2.50 Å R-free 0.297
4K1U Crystal structure of delta5-3-ketosteroid isomerase containing Y16F and Y32F mutations 提交 2013-04-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y16F Y32F 突变：Y16F Y32F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.262
4K1V Crystal structure of delta5-3-ketosteroid isomerase containing Y16F and Y57F mutations 提交 2013-04-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：Y16F, Y57F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；SODIUM ACETATE, AMMONIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
5AI1 Crystal structure of ketosteroid isomerase containing Y32F, D40N, Y57F and Y119F mutations in the equilenin-bound form 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：YES	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；0.1M SODIUM ACETATE (PH 4.5), 0.6M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG 4,000	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
5D81 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI); D40N, Y57(Cl-Y) 提交 2015-08-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：D40N,Y57(Cl-Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.39 Å R-free 0.222
5D82 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI); D40N, Y16(Cl-Y) 提交 2015-08-15	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, Y16(Cl-Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, Y16(Cl-Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.37 Å R-free 0.223
5D83 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI); D40N, Y32(Cl-Y) 提交 2015-08-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, Y32(Cl-Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：D40N, Y32(Cl-Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammounium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.70 Å R-free 0.248
5G2G Crystal structure of ketosteroid isomerase containing M116K mutation in the equilenin-bound form 提交 2016-04-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–128（127 aa）链 B 2–128（127 aa）	突变：YES 突变：YES	EQU EQUILENIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；BIS-TRIS, MAGNESIUM CHLORIDE, PEG 3350, PH 5.50	分辨率 1.60 Å R-free 0.230
5KP1 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to Equilenin; D40N, Y16(Cl-Y) 提交 2016-07-01	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.22 Å R-free 0.185
5KP1 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to Equilenin; D40N, Y16(Cl-Y) 提交 2016-07-01	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–131（131 aa）链 D 1–131（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.22 Å R-free 0.185
5KP3 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to Equilenin; D40N, Y57(Cl-Y) 提交 2016-07-01	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EQU EQUILENIN × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4M ammonium sulfate, 40mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.70 Å R-free 0.254
6C17 Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 3,4-dinitrophenol 提交 2018-01-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：D40N	MG MAGNESIUM ION × 2 DNX 3,4-dinitrophenol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；293 K；18-22% PEG 3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.04 M potassium phosphate	分辨率 1.10 Å R-free 0.174
6C1J Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase Y32F/Y57F/D40N mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 3,4-dinitrophenol 提交 2018-01-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：Y32F, Y57F, D40N	MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 DNX 3,4-dinitrophenol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；293 K；18-22 % PEG 3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.04 M potassium phosphate	分辨率 1.06 Å R-free 0.154
6C1X Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase D40N/D103N mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 3,4-dinitrophenol 提交 2018-01-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）	突变：D40N, D103N	MG MAGNESIUM ION × 4 DNX 3,4-dinitrophenol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；293 K；18-22 % PEG 3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.04 M potassium phosphate	分辨率 1.05 Å R-free 0.172
6F4Y CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE VARIANT D103S 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 1.92 Å R-free 0.252
6F4Y CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE VARIANT D103S 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 1.92 Å R-free 0.252
6F50 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE DOUBLE VARIANT V88I/L99V 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
6F50 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE DOUBLE VARIANT V88I/L99V 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
6F53 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE QUADRUPLE VARIANT V88I/L99V/D103S/V101A 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 1.49 Å R-free 0.202
6F54 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE TRIPLE VARIANT V88I/L99VD103S 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 1.08 Å R-free 0.199
6F54 CRYSTAL STRUCTURE OF KETOSTEROID ISOMERASE TRIPLE VARIANT V88I/L99VD103S 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–127（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；10-25% PEG3350 with 0.2 M MgCl2; ii) 10-25% PEG3350 with 0.2 M ammonium acetate	分辨率 1.08 Å R-free 0.199
6TZD Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 4-Androstenedione at 280 K 提交 2019-08-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	ASD 4-ANDROSTENE-3-17-DIONE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；17-23 % PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.45 Å R-free 0.174
6U1Z Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) at 280 K 提交 2019-08-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；278 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.50 Å R-free 0.167
6U4I Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to Equilenin at 280 K 提交 2019-08-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	EQU EQUILENIN × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.55 Å R-free 0.175
6UBQ Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 4-Androstenedione at 100 K 提交 2019-09-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	ASD 4-ANDROSTENE-3-17-DIONE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.30 Å R-free 0.170
6UCN Multi-conformer model of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to Equilenin at 250 K 提交 2019-09-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	EQU EQUILENIN × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；293 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.32 Å R-free 0.174
6UCW Multi-conformer model of Apo Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) at 250 K 提交 2019-09-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.25 Å R-free 0.173
6UCY Multi-conformer model of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to 4-Androstenedione at 250 K 提交 2019-09-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	ASD 4-ANDROSTENE-3-17-DIONE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.15 Å R-free 0.164
6UFS Crystal structure of ketosteroid isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to 5 alpha-dihydronandrolone 提交 2019-09-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	未记录	Q6J 5alpha-dihydronandrolone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；1.1-1.4 M ammonium sulfate, 40 mM potassium phosphate, 3-6% isopropanol	分辨率 1.47 Å R-free 0.221
7RXF Multi-conformer model of Apo Ketosteroid Isomerase Y57F mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) at 250 K 提交 2021-08-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y57F 突变：Y57F	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.16 Å R-free 0.171
7RXK Multi-conformer model of Apo Ketosteroid Isomerase Y32F/Y57F mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) at 250 K 提交 2021-08-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：Y32F, Y57F 突变：Y32F, Y57F	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M magnesium chloride	分辨率 1.10 Å R-free 0.166
7RY4 Multi-conformer model of Ketosteroid Isomerase Y57F/D40N mutant from Pseudomonas Putida (pKSI) bound to a transition state analog at 250 K 提交 2021-08-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–131（131 aa）链 B 1–131（131 aa）	突变：D40N, Y57F 突变：D40N, Y57F	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 J3Z (9beta,13alpha)-3-hydroxyestra-1,3,5(10)-trien-17-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；17-23% PEG 3350, 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 1.11 Å R-free 0.158

共 63 个其他 PDB 条目、78 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SDIS_PSEPU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 B； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5kp4
沉积日期 deposition_date	2016-07-01
结构标题 title	Crystal Structure of Ketosteroid Isomerase from Pseudomonas putida (pKSI) bound to 19-nortestosterone
关键词 keywords	Isomerase; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.57 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.35 Å
零角强度 I(0) i0	15053600.00
分子量 molecular_weight	28302.0 kDa
排除体积 excluded_volume	35047 Å³
包络体积 envelope_volume	40747 Å³
水化壳体积 shell_volume	18512 Å³
包络直径 envelope_diameter	62.0 Å
壳层 Rg shell_rg	24.61 Å
包络 Rg envelope_rg	18.77 Å
形状 Rg shape_rg	18.36 Å
总 Rg total_rg	19.24 Å
总原子数 total_atoms	1983
残基数 n_residues	254
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	61.6 Å
Rg (实空间) rg_real	19.47 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.29 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.5050e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8190e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	15050000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9020
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.215
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.411
角度范围 angular_range	— – 0.4050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2463000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.909; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.995

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Steroid Delta-isomerase
分子量 formula_weight	15015.1 kDa
EC 编号 ec_number	5.3.3.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2139

MNLPTAQEVQGLMARYIELVDVGDIEAIVQMYADDATVEDPFGQPPIHGREQIAAFYRQGLGGGKVRACLTGPVRASHNGCGAMPFRVEMVWNGQPCALDVIDVMRFDEHGRIQTMQAYWSEVNLSVREPQLVPR

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas putida
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	303
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(8~{R},9~{S},10~{R},13~{S},14~{S},17~{S})-13-methyl-17-oxidanyl-2,6,7,8,9,10,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1~{H}-cyclop enta[a]phenanthren-3-one ;
分子量 formula_weight	274.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	138

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d5kp4a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.17.4 — NTF2-like
家族 Family family	d.17.4.3 — Ketosteroid isomerase-like

结构域编号 domain_id	d5kp4b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.17.4 — NTF2-like
家族 Family family	d.17.4.3 — Ketosteroid isomerase-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5kp4A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	5kp4B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	33.851 Å
晶胞边长 b length_b	72.587 Å
晶胞边长 c length_c	94.820 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.706 Å
最低分辨率 resolution_low	36.294 Å
R 因子 r_factor	0.2050
R_work r_work	0.2032
R_free r_free	0.2390

fit	/app/data/saxs_computation/kp/5kp4/5kp4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kp/5kp4/5kp4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kp/5kp4/5kp4.dat