Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Proline-rich nuclear receptor coactivator 2 × 2 （Q9NPJ4） mRNA decapping complex subunit 2 × 2 （O13828） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DCP1_SCHPO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 D； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | mRNA-decapping enzyme subunit 1 × 2 （Q9P805） mRNA decapping complex subunit 2 × 2 （O13828） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PNRC2_HUMAN |
| Isoform | Q9NPJ4-2 |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–31； UniProt 72–102 作者链 F； PDB构建体 1–31； UniProt 72–102 |
Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | mRNA-decapping enzyme subunit 1 × 2 （Q9P805） Proline-rich nuclear receptor coactivator 2 × 2 （Q9NPJ4） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DCP2_SCHPO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 6–249； UniProt 1–244 作者链 E； PDB构建体 6–249； UniProt 1–244 |
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| 条目编号 entry_id | 5kq1 |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-07-05 |
| 结构标题 title | Crystal structure of S. pombe Dcp1/Dcp2 in complex with H. sapiens PNRC2 |
| 关键词 keywords | decapping mRNA decay Nudix cap analog, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 33.27 Å |
| Rg（电子密度） | 32.47 Å |
| 总 Rg | 33.25 Å |
| 原子数 | 6274 |
| 残基数 | 762 |
| 排除体积 | 112280 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1b1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.242 — Dcp2 domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.242.1 — Dcp2 domain-like |
| 家族 Family family | a.242.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1b2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.113 — Nudix |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.113.1 — Nudix |
| 家族 Family family | d.113.1.7 — mRNA decapping enzyme-like |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1b3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1e1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.242 — Dcp2 domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.242.1 — Dcp2 domain-like |
| 家族 Family family | a.242.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1e2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.113 — Nudix |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.113.1 — Nudix |
| 家族 Family family | d.113.1.7 — mRNA decapping enzyme-like |
| 结构域编号 domain_id | d5kq1e3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 29 — PH-domain like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1B01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1050 — Dcp2, box A domain |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1B02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 79 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1D00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 29 — PH-domain like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1E01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1050 — Dcp2, box A domain |
| 结构域编号 domain_id | 5kq1E02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 79 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase |