Rattus norvegicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ;N-[(E)-3-[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methylaminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]-5-(4-fluorophenyl)-2,3-dihydroxy-benzamide ; × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | COMT_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–221； UniProt 44–264 |
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| 条目编号 entry_id | 5lqc |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-08-16 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of COMT in complex with N-[(E)-3-[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolan-2-yl]prop-2-enyl]-5-(4-fluorophenyl)-2,3-dihydroxybenzamide |
| 关键词 keywords | METHYLTRANSFERASE, NEUROTRANSMITTER DEGRADATION, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.62 Å |
| Rg（电子密度） | 27.08 Å |
| 总 Rg | 27.82 Å |
| 原子数 | 3434 |
| 残基数 | 426 |
| 排除体积 | 61526 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5lqca_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 家族 Family family | c.66.1.1 — COMT-like |
| 结构域编号 domain_id | 5lqcA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — Vaccinia Virus protein VP39 |