Rattus norvegicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | MAGNESIUM ION × 1 CHLORIDE ION × 2 ;~{N}-[(~{E})-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]prop-2-enyl]-5-[(4-methylphenyl)methyl]-2,3-bis(oxidanyl)benzamide ; × 1 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | COMT_RAT |
| Isoform | P22734-2 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–221； UniProt 1–221 |
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| 条目编号 entry_id | 5lqk |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-08-17 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of COMT in complex with N-[(E)-3-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]prop-2-enyl]-2,3-dihydroxy-5-[(4-methylphenyl)methyl]benzamide |
| 关键词 keywords | METHYLTRANSFERASE, NEUROTRANSMITTER DEGRADATION, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.68 Å |
| Rg（电子密度） | 16.54 Å |
| 总 Rg | 17.52 Å |
| 原子数 | 1743 |
| 残基数 | 216 |
| 排除体积 | 31250 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5lqka_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 家族 Family family | c.66.1.1 — COMT-like |
| 结构域编号 domain_id | 5lqkA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — Vaccinia Virus protein VP39 |