5m3d

Structural tuning of CD81LEL (space group P31)

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CD81 antigen

Homo sapiens

UniProt P60033

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 1,2-ETHANEDIOL × 4 PHOSPHATE ION × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 1,2-ETHANEDIOL × 2 PHOSPHATE ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CD81_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–92; UniProt 112–201 作者链 B; PDB构建体 3–92; UniProt 112–201 作者链 C; PDB构建体 3–92; UniProt 112–201 作者链 D; PDB构建体 3–92; UniProt 112–201

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5m3d
沉积日期 deposition_date2016-10-14
结构标题 titleStructural tuning of CD81LEL (space group P31)
关键词 keywordshuman cellular receptor for Hepatitis C virus, cell adhesion; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5m3d__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5m3d__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5m3d__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.26 Å
Rg(电子密度)16.58 Å
总 Rg17.54 Å
原子数2739
残基数180
排除体积24466 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5m3d__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5m3d__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd5m3da1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.135 — Tetraspanin
超家族 Superfamily superfamilya.135.1 — Tetraspanin
家族 Family familya.135.1.1 — Tetraspanin
结构域编号 domain_idd5m3da2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd5m3db1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.135 — Tetraspanin
超家族 Superfamily superfamilya.135.1 — Tetraspanin
家族 Family familya.135.1.1 — Tetraspanin
结构域编号 domain_idd5m3db2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd5m3dc1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.135 — Tetraspanin
超家族 Superfamily superfamilya.135.1 — Tetraspanin
家族 Family familya.135.1.1 — Tetraspanin
结构域编号 domain_idd5m3dc2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd5m3dd1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.135 — Tetraspanin
超家族 Superfamily superfamilya.135.1 — Tetraspanin
家族 Family familya.135.1.1 — Tetraspanin
结构域编号 domain_idd5m3dd2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id5m3dA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1450 — Cd81 Antigen, Extracellular Domain; Chain: A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetraspanin
结构域编号 domain_id5m3dB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1450 — Cd81 Antigen, Extracellular Domain; Chain: A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetraspanin
结构域编号 domain_id5m3dC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1450 — Cd81 Antigen, Extracellular Domain; Chain: A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetraspanin
结构域编号 domain_id5m3dD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1450 — Cd81 Antigen, Extracellular Domain; Chain: A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetraspanin

7. 引用文献 (3)