SAXSdb — 5mjs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin beta chain

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Microtubule integrity protein mal3 × 1 （Q10113） Tubulin alpha-1 chain × 4 （P04688） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBB_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429 作者链 B； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429 作者链 C； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429 作者链 J； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429

Microtubule integrity protein mal3

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q10113

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Tubulin beta chain × 4 （P05219） Tubulin alpha-1 chain × 4 （P04688） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAL3_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

Tubulin alpha-1 chain

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt P04688

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Tubulin beta chain × 4 （P05219） Microtubule integrity protein mal3 × 1 （Q10113） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBA1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–444； UniProt 1–444 作者链 F； PDB构建体 1–444； UniProt 1–444 作者链 G； PDB构建体 1–444； UniProt 1–444 作者链 H； PDB构建体 1–444； UniProt 1–444

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5mjs
沉积日期 deposition_date	2016-12-01
结构标题 title	S. pombe microtubule copolymerized with GTP and Mal3-143
关键词 keywords	Schizosaccharomyces pombe microtubules, structural protein; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5mjs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5mjs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5mjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	56.92 Å
Rg（电子密度）	57.10 Å
总 Rg	57.10 Å
原子数	28114
残基数	3569
排除体积	494880 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5mjs__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tubulin beta chain
分子量 formula_weight	47191.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,J,B,C
原子数 atom_count	28114

MREIVHIQAGQCGNQVGAAFWSTIADEHGLDSAGIYHGTSEAQHERLNVYFNEAAGGKYVPRAVLVDLEPGTMDAVKSGKFGNLFRPDNIIYGQSGAGNIWAKGHYTEGAELADAVLDVVRREAEACDALQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLLSKIREEYPDRMMATFSVAPAPKSSDTVVEPYNATLSMHQLVENSDETFCIDNEALSSIFANTLKIKSPSYDDLNHLVSAVMAGVTTSFRFPGELNSDLRKLAVNMVPFPRLHFFMVGFAPLAAIGSSSFQAVSVPELTQQMFDANNMMVAADPRHGRYLTVAALFRGKVSMKEVDEQIRSVQTKNSAYFVEWIPDNVLKAVCSVPPKDLKMSATFIGNSTSIQEIFRRLGDQFSAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQEAG

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Schizosaccharomyces pombe

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Microtubule integrity protein mal3
分子量 formula_weight	16668.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSESRQELLAWINQVTSLGLTRIEDCGKGYAMIQIFDSIYQDIPLKKVNFECNNEYQYINNWKVLQQVFLKKGIDKVVDPERLSRCKMQDNLEFVQWAKRFWDQYYPGGDYDALARRGNRGPANTRVMNSSAGATGPSRRRQV

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tubulin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	49813.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

MREVISVHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIGPDGFPTENSEVHKNNSYLNDGFGTFFSETGQGKFVPRSIYVDLEPNVIDQVRTGPYKDLFHPEQMVTGKEDASNNYARGHYTVGKEMIDSVLERIRRMADNCSGLQGFLVFHSFGGGTGSGLGALLLERLNMEYGKKSNLQFSVYPAPQVSTSVVEPYNSVLTTHATLDNSDCTFMVDNEACYDICRRNLDIERPTYENLNRLIAQVVSSITASLRFAGSLNVDLNEFQTNLVPYPRIHFPLVTYSPIVSAAKAFHESNSVQEITNQCFEPYNQMVKCDPRTGRYMATCLLYRGDVIPRDVQAAVTSIKSRRTIQFVDWCPTGFKIGICYEPPQHVPGSGIAKVNRAVCMLSNTTSIAEAWSRLDHKFDLMYSKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALERDYEEVGQDSM

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Schizosaccharomyces pombe

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4896
宿主生物 host_organism	Schizosaccharomyces pombe

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4896
宿主生物 host_organism	Schizosaccharomyces pombe

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	12763

S. pombe microtubule copolymerized with GTP and Mal3-143

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Microtubule integrity protein mal3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5mjs__assembly_1__model_1

5mjs__assembly_1__model_1 | I(q)

5mjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

S. pombe microtubule copolymerized with GTP and Mal3-143

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Microtubule integrity protein mal3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5mjs__assembly_1__model_1

5mjs__assembly_1__model_1 | I(q)

5mjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)